| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | = 3077 | 3566 (0.300) | 189 (0.020) | 21/146 | NT | 8.7% | intergenic (‑403/–) | USA300HOU_RS14900/– | hypothetical protein/– |
| ? | NC_012417 | = 3108 | 716 (0.070) | intergenic (‑434/–) | USA300HOU_RS14900/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 11900 total aligned reads displayed.
TACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/3018‑3125 | aCAGTGTTTAAACGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAATTTGACAATAAAAAACTCTAGTTATATTATTGAGGTGTCGAATCTTAAataata > 2:3121899/1‑91 (MQ=255) tatcttgattttcggttatacttctagtagtattatattgcatataaaaaaCCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATAc < 1:9463‑M2/40‑1 (MQ=255) gtgtTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactg < 2:765987‑M2/91‑5 (MQ=255) gtgtTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactg > 1:3229193‑M2/1‑87 (MQ=255) gtgtTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactg < 1:22812‑M2/91‑5 (MQ=255) gtgtTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactg < 2:2530062‑M2/91‑5 (MQ=255) gtgtTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactg > 1:1277788‑M2/1‑87 (MQ=255) gtgaTTAAACGTGTATTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATGTTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactg > 1:3498153‑M2/1‑87 (MQ=255) tgtTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactgg < 1:2953941‑M2/91‑6 (MQ=255) tgtTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactgg > 2:181080‑M2/1‑86 (MQ=255) gtTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactggg > 2:3255294‑M2/1‑85 (MQ=255) tttAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactgggg > 2:1385421‑M2/1‑84 (MQ=255) aaCGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCt > 2:468952/1‑91 (MQ=255) aaCGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCt > 1:3704371/1‑91 (MQ=255) aaCGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCt < 2:2462574/91‑1 (MQ=255) aaCGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCt < 2:2044050/91‑1 (MQ=255) aaCGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCt < 1:1197830/91‑1 (MQ=255) aCGTGGTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCtt < 2:2253603/91‑1 (MQ=255) gtgtTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCtttt > 1:2612279/1‑91 (MQ=255) gtgtTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCtttt < 1:2344835/91‑1 (MQ=255) gtgtTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATATGAAAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCtttt < 2:1180644/91‑1 (MQ=255) tgtTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACAGGGGGTCttttt > 2:1525847/1‑91 (MQ=255) gtTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTa > 1:884579/1‑91 (MQ=255) gtTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTa < 2:3620725/91‑1 (MQ=255) gtTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTCGGGTTCTTTTTa > 2:3397810/1‑91 (MQ=255) tttttGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTAt > 1:474171/1‑91 (MQ=255) ttttGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATa > 1:3296995‑M2/1‑90 (MQ=255) ttttGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATa < 2:39786‑M2/91‑2 (MQ=255) tttGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATat < 2:1257637‑M2/91‑3 (MQ=255) ttGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatg < 2:2676614‑M2/91‑4 (MQ=255) ttGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatg < 1:3628128‑M2/91‑4 (MQ=255) gtgCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgca < 1:2410892‑M2/91‑6 (MQ=255) gtgCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgca < 2:1088737‑M2/91‑6 (MQ=255) tgCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaa < 1:2683608‑M2/91‑7 (MQ=255) tgCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaa < 1:413759‑M2/91‑7 (MQ=255) gCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaat < 2:1015779‑M2/91‑8 (MQ=255) gCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaat < 1:1677507‑M2/91‑8 (MQ=255) gAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataa > 2:2900609‑M2/1‑80 (MQ=255) aaaGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcagtataat > 1:3020439‑M2/1‑79 (MQ=255) aaGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataata > 1:54017‑M2/1‑78 (MQ=255) aaGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataata > 1:1073287‑M2/1‑78 (MQ=255) aaGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataata > 2:232563‑M2/1‑78 (MQ=255) aaGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataata > 1:1549079‑M2/1‑78 (MQ=255) aGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatac > 2:855414‑M2/1‑77 (MQ=255) aGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatac > 2:1954908‑M2/1‑77 (MQ=255) aGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatac > 2:1675618‑M2/1‑77 (MQ=255) aGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatac > 1:3089168‑M2/1‑77 (MQ=255) gAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatacta < 1:356284‑M2/91‑17 (MQ=255) aaaaTTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactac > 2:3689815‑M2/1‑74 (MQ=255) aTTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactag < 2:2751461‑M2/91‑21 (MQ=255) aTTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactag < 1:1130902‑M2/91‑21 (MQ=255) gACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatctaatactactagaagt < 2:2973395‑M2/91‑25 (MQ=255) gACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagt > 1:737438‑M2/1‑67 (MQ=255) aCAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactgggggtcttttattgtcaaattttcctttcacgcacaaa < 2:1874954‑M2/91‑43 (MQ=255) aCAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagta < 1:1613679‑M2/91‑26 (MQ=255) aCAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagta < 2:613633‑M2/91‑26 (MQ=255) aCAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagta < 1:274821‑M2/91‑26 (MQ=255) aaTAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtata < 1:1000990‑M2/91‑28 (MQ=255) aaTAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtata > 1:820400‑M2/1‑64 (MQ=255) aTAAAAAGCCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCCTTTTATatgcaatataatactactagaagtataa > 1:2813881‑M2/1‑63 (MQ=255) aaaaaaCCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataacc > 1:1489073‑M2/1‑61 (MQ=255) aaaaaaCCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataacc > 1:2477417‑M2/1‑61 (MQ=255) aaaaaCCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccg < 2:3329487‑M2/91‑32 (MQ=255) aaaCCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaa > 1:3371961‑M2/1‑58 (MQ=255) aCCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaa < 1:1999200‑M2/91‑36 (MQ=255) ccccAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaat < 2:699396‑M2/91‑37 (MQ=255) ccccAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaat < 1:2201497‑M2/91‑37 (MQ=255) ccccAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaat < 2:539890‑M2/91‑37 (MQ=255) cccAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataactgaaaatc < 1:1936018‑M2/91‑38 (MQ=255) cccAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatc < 1:1415836‑M2/91‑38 (MQ=255) ccAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatca < 2:1742797‑M2/91‑39 (MQ=255) cAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaa < 1:2065402‑M2/91‑40 (MQ=255) cAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaa < 1:605409‑M2/91‑40 (MQ=255) aGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaag < 2:2384882‑M2/91‑41 (MQ=255) ttgatattatTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTAGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaaga > 2:3828497‑M2/4‑50 (MQ=255) gTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaaga > 1:2128786‑M2/1‑50 (MQ=255) ttATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagat > 1:1740643‑M2/1‑49 (MQ=255) ttATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagat < 2:210961‑M2/91‑43 (MQ=255) atatTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataa < 2:2177267‑M2/91‑45 (MQ=255) atatTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataa > 2:2599218‑M2/1‑47 (MQ=255) tattaAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaa > 1:1346925‑M2/1‑43 (MQ=255) tattaAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaa > 2:927072‑M2/1‑43 (MQ=255) tattaAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaa < 1:3432031‑M2/91‑49 (MQ=255) attaAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaa > 1:2886396‑M2/1‑42 (MQ=255) attaAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaa < 1:1863570‑M2/91‑50 (MQ=255) taAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacg < 2:132147‑M2/91‑52 (MQ=255) ggTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgtta > 2:1457436‑M2/1‑37 (MQ=255) tgtCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaa < 1:2543537‑M2/91‑57 (MQ=255) tCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaag < 1:3774527‑M2/91‑59 (MQ=255) cGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgtt > 2:3753784‑M2/1‑32 (MQ=255) aTCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatat < 2:3544446‑M2/91‑63 (MQ=255) tCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagcagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatacg < 2:1594512‑M2/91‑64 (MQ=255) ttAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatatagtactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgac > 2:3053436‑M2/1‑26 (MQ=255) ttAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgac > 2:318615‑M2/1‑26 (MQ=255) tAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacg > 2:3465231‑M2/1‑25 (MQ=255) atataatactGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacga > 1:67011‑M2/3‑24 (MQ=255) aaaTAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacga < 1:1801644‑M2/91‑68 (MQ=255) aaaTAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacga < 1:3152170‑M2/91‑68 (MQ=255) aataatACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaa > 2:2822927‑M2/1‑23 (MQ=255) taCTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtg < 1:3840452‑M2/91‑74 (MQ=255) | TACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/3018‑3125 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |