New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 181969 = | 199 (1.040) | 16 (0.090) | 10/150 | NT | 8.1% | coding (32/1110 nt) | glgA | Glycogen synthase |
? | USA300TCH1516_ALE | 181998 = | 178 (1.000) | coding (61/1110 nt) | glgA | Glycogen synthase |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
GCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGC > USA300TCH1516_ALE/181879‑182059 | gCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATCTTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAatat > 2:3801993/1‑91 (MQ=255) gCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAatat < 2:2472802/91‑1 (MQ=255) gCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAatat < 2:3758239/91‑1 (MQ=255) gCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAatat > 2:1832039/1‑91 (MQ=255) atctaaattttccaatcgcttattagtagcttgtgaattattcattccaacaattttataatcatccgtaacgcctttaattgtttctatt > 2:2789231‑M1/91‑91 (MQ=255) tctaaattttccaatcgcttattagtagcttgtgaattattcattccaacaatttcataatcatccgtaacgcctttaattgtttctattt < 1:1811449‑M1/2‑1 (MQ=255) ccTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATAtt > 1:1287658/1‑91 (MQ=255) ccTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATAtt < 2:1927850/91‑1 (MQ=255) ccTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATAtt > 2:1038982/1‑91 (MQ=255) ccTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATAtt < 2:2330369/91‑1 (MQ=255) ctaaattttccaatcgcgtattagtagcttgtgaattactcattccaacaattttataatcatccgtaacgcctttaattgtttctatTTg > 1:1577422‑M1/89‑91 (MQ=255) taaattttccaatcgcttattagtagcttgtgaattattcattccaacaattttataatcatccgtaacgcctttaattgtttctatTTGt < 2:163008‑M1/4‑1 (MQ=255) taaattttccaatcgcttattagtagcttgtgaattattcattccaacaattttataatcatccgtaacgcctttaattgtttctatTTGt < 1:3602225‑M1/4‑1 (MQ=255) tGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGt < 2:2728892/91‑1 (MQ=255) aaattttccaatcacttattagtagcttgtgaattattcattcgaacaattttataatcatccgtaacgcctttaattgtttctatTTGtt > 1:3878446‑M1/87‑91 (MQ=255) aCAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTc < 2:1751387/91‑1 (MQ=255) cAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCa > 1:2201427/1‑91 (MQ=255) aaaCTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCaa < 1:1722001/91‑1 (MQ=255) aaaCTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCaa > 1:3140915/1‑91 (MQ=255) aCTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑a > 1:3785856/1‑91 (MQ=255) cTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑Ac < 2:3634749/91‑1 (MQ=255) tAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑Acc < 2:600133/91‑1 (MQ=255) tAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑Acc < 1:2739517/91‑1 (MQ=255) aaaaGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑Accc < 1:2321915/91‑1 (MQ=255) aaaGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATCTTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCa > 1:3117328/1‑91 (MQ=255) aaaGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCa > 1:53357/1‑91 (MQ=255) aaaGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCa < 2:1239631/91‑1 (MQ=255) ggATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCGAAgg < 1:3067858/91‑1 (MQ=255) tttCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTCCAAG‑ACCCAAGGGTAc > 2:3708932/1‑91 (MQ=255) ttCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACt < 2:3278224/91‑1 (MQ=255) ttCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACt < 2:3451052/91‑1 (MQ=255) tagtagcttgtgaattattcattccaacaattttataatcatccgtaacgcctttaattgtttctatTTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTa > 1:754717‑M1/68‑91 (MQ=255) cGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTa < 1:1749433/91‑1 (MQ=255) cGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTa < 1:618347/91‑1 (MQ=255) ggTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTaa < 1:2344257/91‑1 (MQ=255) gtagcttgtgaattattcattccaacaattttataatcatccgtaacgcctttaattgtttctatTTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTaaa > 2:1408990‑M1/66‑91 (MQ=255) ttGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAAc < 1:525748/91‑1 (MQ=255) tGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACa < 2:2134979/91‑1 (MQ=255) tGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACa < 2:209730/91‑1 (MQ=255) tGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACa < 2:745258/91‑1 (MQ=255) atTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAg < 1:1832466/91‑1 (MQ=255) tttAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGa < 2:330464/91‑1 (MQ=255) tttAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGa > 2:2530091/1‑91 (MQ=255) ttAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGaa < 2:3476308/91‑1 (MQ=255) taactaaaAGGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGaaa < 1:3484294/91‑1 (MQ=255) aaataaaAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGaaaa < 1:1499035/91‑2 (MQ=255) aaataaaAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAACATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAAc > 2:2981697/1‑91 (MQ=255) aataaaAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACa < 2:2193659/91‑1 (MQ=255) aataaaAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACa > 2:2588609/1‑91 (MQ=255) ataaaAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACaa > 1:1943454/1‑91 (MQ=255) aaaaaGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAAtt > 2:3548737/1‑91 (MQ=255) aaaaaGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAAtt < 2:1768156/91‑1 (MQ=255) aaaaGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTa > 2:880064/1‑91 (MQ=255) aaGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTaaa < 2:2357529/91‑1 (MQ=255) aaGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTaaa > 1:2421643/1‑91 (MQ=255) aaGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTaaa < 1:2564193/91‑1 (MQ=255) aGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAg < 1:2057162/91‑1 (MQ=255) aGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAg > 1:2489036/1‑91 (MQ=255) tACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGt < 1:1001171/91‑1 (MQ=255) tACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGt < 1:2615896/91‑1 (MQ=255) tACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGt > 1:2544756/1‑91 (MQ=255) aCTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGtt < 2:3785856/91‑1 (MQ=255) aCTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGtt > 2:2517614/1‑91 (MQ=255) aCTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGtt > 2:1435203/1‑91 (MQ=255) aCTTAATGACATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGtt > 1:1951251/1‑91 (MQ=255) cTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTa > 2:1298546/1‑91 (MQ=255) ttAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTAc > 1:3164311/1‑91 (MQ=255) tGATATGAGAATATTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGgat > 2:2519645/1‑91 (MQ=255) gATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGgatg > 1:2938620/1‑91 (MQ=255) gATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGgatg < 1:3336667/91‑1 (MQ=255) tatGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGgatgat < 1:2187477/91‑1 (MQ=255) tGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATta > 2:1110836/1‑91 (MQ=255) tGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATta > 1:1364881/1‑91 (MQ=255) gagaATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATtat > 1:1225346/1‑91 (MQ=255) agaATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGgatgatataa > 1:278681/1‑87 (MQ=255) gaATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATaa > 2:1568042/1‑91 (MQ=255) ttttAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAAt < 1:1431710/91‑1 (MQ=255) tttAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAAtt < 2:1823438/91‑1 (MQ=255) aaaTATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAAttgtt > 1:3526774/1‑91 (MQ=255) atatTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAAttgtttg > 2:2540736/1‑89 (MQ=255) atatTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTgg > 2:3151818/1‑91 (MQ=255) atatTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTgg > 2:3243333/1‑91 (MQ=255) atTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaa < 1:1121058/91‑1 (MQ=255) atTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaa > 1:2942603/1‑91 (MQ=255) atTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaa < 1:3038948/91‑1 (MQ=255) ttGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaat < 2:3517274/91‑1 (MQ=255) tGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaatg < 2:676853/91‑1 (MQ=255) tGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaatg < 2:1201087/91‑1 (MQ=255) gTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaatga < 2:503538/91‑1 (MQ=255) tCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGaata > 2:1485572/1‑91 (MQ=255) tttctatTTGTTTAAGTACCCTTGGGT‑CTTGAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAAtt < 2:334264‑M1/84‑1 (MQ=255) ttctatTTGTTTAAGTACCCTTGGGT‑CTTGAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTc < 2:3532772‑M1/85‑1 (MQ=255) ttctatTTGTTTAAGTACCCTTGGGT‑CTTGAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTc < 1:580145‑M1/85‑1 (MQ=255) gTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTc < 1:446103/91‑1 (MQ=255) gTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTc > 1:681667/1‑91 (MQ=255) atatTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTcaca < 1:2517614/91‑1 (MQ=255) atatTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTcaca < 2:53874/91‑1 (MQ=255) atTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAg > 1:3668596/1‑91 (MQ=255) atTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAACAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAg > 2:2960057/1‑91 (MQ=255) TTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGc > 1:3721980‑M1/1‑91 (MQ=255) | GCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGC > USA300TCH1516_ALE/181879‑182059 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |