New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 181969 = | 199 (1.040) | 16 (0.090) | 10/150 | NT | 8.1% | coding (32/1110 nt) | glgA | Glycogen synthase |
? | USA300TCH1516_ALE | 181998 = | 178 (1.000) | coding (61/1110 nt) | glgA | Glycogen synthase |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
ATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTGGAAAATTTAGATT > USA300TCH1516_ALE/181909‑182088 | tttAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGa > 2:2530341/1‑91 (MQ=255) ttAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGaa < 2:3476308/91‑1 (MQ=255) gaattattcattccaacaattttataatcatccgtaacgcctttaattgtttctatttgttcaagacccaagggtacttaaacaaATAGaa < 2:3532772‑M2/6‑1 (MQ=255) gaattattcattccaacaattttataatcatccgtaacgcctttaattgtttctatttgttcaagacccaagggtacttaaacaaATAGaa < 1:1981550‑M2/6‑1 (MQ=255) aaataaaAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAAc < 2:3608071/91‑1 (MQ=255) attattcattccaacaattttataatcatccgtaacgcctttaattgtttctatttgttcaagacccaagggtacttaaacaaATAGAAAc < 1:2205077‑M2/8‑1 (MQ=255) aataaaAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACa < 2:1212564/91‑1 (MQ=255) aataaaAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACa > 2:2952982/1‑91 (MQ=255) aataaaAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACa < 2:2131497/91‑1 (MQ=255) aataaaAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACa < 2:2193659/91‑1 (MQ=255) ataaaAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACaa > 1:1943454/1‑91 (MQ=255) taaaAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAAt < 2:1790615/91‑1 (MQ=255) aaaGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTaa < 2:3284396/91‑1 (MQ=255) aaGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTaaa > 1:2421643/1‑91 (MQ=255) aGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAg < 1:2057162/91‑1 (MQ=255) aTACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCg > 2:3644975/1‑91 (MQ=255) tACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGt > 1:2544756/1‑91 (MQ=255) tACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGt < 1:1001171/91‑1 (MQ=255) aCTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAGGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGtt > 1:3563513/1‑91 (MQ=255) aCTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGtt > 1:1766902/1‑91 (MQ=255) aCTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGtt > 2:1435203/1‑91 (MQ=255) aCTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGtt > 2:1700861/1‑91 (MQ=255) aCTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGtt > 2:2517614/1‑91 (MQ=255) aCTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGtt < 2:3785856/91‑1 (MQ=255) cTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTa < 1:3818347/91‑1 (MQ=255) cTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTa > 2:1298546/1‑91 (MQ=255) tAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACg < 1:1301204/91‑1 (MQ=255) tGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGgat > 2:2362969/1‑91 (MQ=255) tGATATGAGAATATTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGgat > 2:2519645/1‑91 (MQ=255) gATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGgatg > 1:2938620/1‑91 (MQ=255) gATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGgatg < 1:3336667/91‑1 (MQ=255) tatGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGgatgat < 1:2187606/91‑1 (MQ=255) atGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGAtt < 2:651737/91‑1 (MQ=255) atGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGAtt > 2:1586536/1‑91 (MQ=255) tGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATAGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTATACAAATAGAAACGATTAAAGGCGTGACGGATGATta > 2:2963345/1‑91 (MQ=255) gagaATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATtat > 1:1225308/1‑91 (MQ=255) agaATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGgatgatataa > 1:278681/1‑87 (MQ=255) gaATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATaa < 2:1418049/91‑1 (MQ=255) aTTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATaaaa > 2:257143/1‑91 (MQ=255) tttAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAAtt < 2:1823711/91‑1 (MQ=255) tttAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAAtt < 2:2201427/91‑1 (MQ=255) aaaTATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAAttgtt > 2:3315002/1‑91 (MQ=255) aaaTATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAAttgtt > 1:3526774/1‑91 (MQ=255) atatTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTgg > 2:3151818/1‑91 (MQ=255) atTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaa < 1:1121058/91‑1 (MQ=255) atTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaa > 1:2942603/1‑91 (MQ=255) atTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaa < 1:3038948/91‑1 (MQ=255) ttGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaat < 2:3517452/91‑1 (MQ=255) tGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaatg < 2:676853/91‑1 (MQ=255) tGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaatg < 2:1201087/91‑1 (MQ=255) tGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaatg > 2:3219222/1‑91 (MQ=255) tGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaatg < 1:2454149/91‑1 (MQ=255) tATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGgaatgaa < 2:1518549/91‑1 (MQ=255) tCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGaata < 1:3150669/91‑1 (MQ=255) tCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGaata < 1:2344487/91‑1 (MQ=255) cGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGaataa > 2:1994946/1‑91 (MQ=255) gtttctatTTGTTTAAGTACCCTTGGGT‑CTTGAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGaataat < 1:594896‑M1/83‑1 (MQ=255) gAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGaataat > 1:2582991/1‑91 (MQ=255) ttctatTTGTTTAAGTACCCTTGGGT‑CTTGAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTc < 1:580145‑M1/85‑1 (MQ=255) gTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTc > 1:681667/1‑91 (MQ=255) gTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTc < 1:1568042/91‑1 (MQ=255) aaTATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTcac > 1:717106/1‑91 (MQ=255) atatTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTcaca < 1:2517614/91‑1 (MQ=255) atatTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTcaca < 2:53217/91‑1 (MQ=255) tatTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACaa > 2:3764842/1‑91 (MQ=255) atTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAg > 1:3668596/1‑91 (MQ=255) tttgtttaagtacccttgggtcttgaacaaATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAg > 1:2134074‑M2/31‑91 (MQ=255) tttgtttaagtacccttgggtcttgaacaaATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAg > 1:1355900‑M2/31‑91 (MQ=255) TGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGct < 1:2724880‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGct > 1:3254156‑M1/1‑91 (MQ=255) GTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGcta > 2:919791‑M1/1‑91 (MQ=255) GTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGcta < 2:309425‑M1/91‑1 (MQ=255) GTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGcta > 1:1386894‑M1/1‑91 (MQ=255) GTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGcta < 1:308659‑M1/91‑1 (MQ=255) GTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATAGTTGGAATGAATAATTCACAAGcta < 2:309074‑M1/91‑1 (MQ=255) gtttaagtacccttgggtcttgaacaaATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGcta > 2:1083806‑M2/28‑91 (MQ=255) TTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGctac < 2:2705431‑M1/91‑1 (MQ=255) TTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGctac < 1:1412151‑M1/91‑1 (MQ=255) TCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGctact > 2:3385490‑M1/1‑91 (MQ=255) cAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGctacta > 1:1627353/1‑91 (MQ=255) aagtacccttgggtcttgaacaaATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACtaa > 2:344291‑M2/24‑91 (MQ=255) g‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACtaata > 1:1562962/1‑91 (MQ=255) g‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACtaata > 1:933083/1‑91 (MQ=255) cAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCg > 1:1881104/1‑91 (MQ=255) aGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGAt > 2:1757292/1‑91 (MQ=255) gggTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGAtt > 2:2458086/1‑91 (MQ=255) ggTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTg > 1:41384/1‑91 (MQ=255) ggTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTg < 1:1993310/91‑1 (MQ=255) ggTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTg < 2:1315918/91‑1 (MQ=255) cTTAAACAAATAGAAGCAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATTAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTGGaaa < 2:2735260/91‑1 (MQ=255) cTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTGGaaa < 1:2588609/91‑1 (MQ=255) cTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTGGaaa > 1:1452005/1‑91 (MQ=255) ttAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTGGaaaa < 1:3192221/91‑1 (MQ=255) tAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTGGAAAAt < 1:809918/91‑1 (MQ=255) aaaCAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTGGAAAAtt < 1:1594589/91‑1 (MQ=255) acaaATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTGGAAAATTTa < 1:3602225‑M2/87‑1 (MQ=255) caaATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTGGAAAATTTAg > 2:420697‑M2/4‑91 (MQ=255) aaATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATGAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTGGAAAATTTAGa < 1:1811449‑M2/89‑1 (MQ=255) aATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTGGAAAATTTAGAt > 2:2789231‑M2/2‑91 (MQ=255) aTAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTGGAAAATTTAGAtt < 2:354757/91‑1 (MQ=255) | ATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGATATGAGAATTTTAAATATTGTATCGAGTAATATTGTTCAAG‑ACCCAAGGGTACTTAAACAAATAGAAACAATTAAAGGCGTTACGGATGATTATAAAATTGTTGGAATGAATAATTCACAAGCTACTAATAAGCGATTGGAAAATTTAGATT > USA300TCH1516_ALE/181909‑182088 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |