| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 482264 | 125 (0.660) | 19 (0.110) | 8/146 | NT | 14.0% | intergenic (+61/‑622) | USA300HOU_RS02285/USA300HOU_RS02295 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 482286 | 119 (0.690) | intergenic (+83/‑600) | USA300HOU_RS02285/USA300HOU_RS02295 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
CTTGAGGATAATTTGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAA > USA300TCH1516_ALE/482174‑482354 | ttGAGGATAATTTGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAgcg < 1:3748757/91‑1 (MQ=255) tGAGGATAATTTGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAgcgc < 2:2597809/91‑1 (MQ=255) gAGGATAATTTGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCa > 1:640864/1‑91 (MQ=255) gAGGATAATTTGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCa > 2:385587/1‑91 (MQ=255) ggATAATTTGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGTAAc > 1:3005139/1‑91 (MQ=255) gATAATTTGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACg > 2:1498271/1‑91 (MQ=255) gATAATTTGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACg > 2:3143956/1‑91 (MQ=255) gATAATTTGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTATGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACg > 1:3362183/1‑91 (MQ=255) aTTTGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCat < 1:1508567/91‑1 (MQ=255) tttGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCata < 2:2709436/91‑1 (MQ=255) tttGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCata < 1:3340624/91‑1 (MQ=255) ttGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCatat > 1:2880951/1‑91 (MQ=255) ttGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCatat < 1:359700/91‑1 (MQ=255) tGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCatata < 1:2462374/91‑1 (MQ=255) gAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATAtt > 2:621167/1‑91 (MQ=255) aaGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTgg < 1:3266748/91‑1 (MQ=255) aGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCacacccaaatatatggcgt < 1:2634579‑M1/91‑20 (MQ=255) gCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCacacccaaatatatggcgtt < 2:2321589‑M1/91‑21 (MQ=255) gCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGgt < 2:1789410/91‑1 (MQ=255) atatTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCacacccaaatatatggcgttgc < 1:3684460‑M1/91‑23 (MQ=255) atatTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCacacccaaatatatggcgttgc < 1:3240167‑M1/91‑23 (MQ=255) atatTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCacacccaaatatatggcgttgc < 1:1735216‑M1/91‑23 (MQ=255) atatTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGgtgt < 2:2174229/91‑1 (MQ=255) atatTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGgtgt < 1:792281/91‑1 (MQ=255) tatTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCacacccaaatatatggcgttgcg < 1:739968‑M1/91‑24 (MQ=255) tatTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCacacccaaatatatggcgttgcg < 1:1225654‑M1/91‑24 (MQ=255) tatTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTg < 2:1505669‑M2/91‑2 (MQ=255) tttAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgct < 2:1109182‑M2/91‑4 (MQ=255) tttAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgct < 2:1109398‑M2/91‑4 (MQ=255) tttAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgct < 1:996753‑M2/91‑4 (MQ=255) tttAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgct < 1:1375554‑M2/91‑4 (MQ=255) ttAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCacacccaaatatatggcgttgcgctg < 2:167286‑M1/91‑27 (MQ=255) ttAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCacacccaaatatatggcgttgcgctg < 1:2287825‑M1/91‑27 (MQ=255) ttAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCacacccaaatatatggcgttgcgctg < 1:2511089‑M1/91‑27 (MQ=255) ttAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCacacccaaatatatggcgttgcgctg < 1:2511073‑M1/91‑27 (MQ=255) tAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgctgt > 2:640864‑M2/1‑86 (MQ=255) gaagGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGtttt < 1:1807110/91‑1 (MQ=255) gaagGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCCGtttt > 2:3572741/1‑91 (MQ=255) agGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTc < 1:780546/91‑1 (MQ=255) agGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTc < 2:3322725/91‑1 (MQ=255) ggTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCt > 2:454593/1‑91 (MQ=255) ggTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCt < 2:2199576/91‑1 (MQ=255) ggTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCt < 1:812773/91‑1 (MQ=255) gTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaacca < 1:2929961‑M2/91‑13 (MQ=255) gTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTa > 1:1603093/1‑91 (MQ=255) gTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTa < 2:1592985/91‑1 (MQ=255) ttAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTAt < 1:1177908/91‑1 (MQ=255) tATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACat < 2:3788844/91‑1 (MQ=255) gCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACatgat > 1:2500251/1‑91 (MQ=255) gCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACatgat > 1:1331951/1‑91 (MQ=255) tCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGAtgtg < 2:1165298/91‑1 (MQ=255) tgctgGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGtt > 1:150220/1‑91 (MQ=255) ctgGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTtta > 1:910234/1‑91 (MQ=255) tgGCTTATTGAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTttat < 1:3710850/91‑1 (MQ=255) tgGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTttat > 1:2574369/1‑91 (MQ=255) ggCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTttatt < 1:94518/91‑1 (MQ=255) ggCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTttatt > 1:2915546/1‑91 (MQ=255) ttattaAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACg < 1:612391/91‑1 (MQ=255) attaAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTg < 1:1781294/91‑1 (MQ=255) attaAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTg < 1:2073587/91‑1 (MQ=255) taAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGa > 2:893232/1‑91 (MQ=255) taAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGa < 2:1942975/91‑1 (MQ=255) taAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGa < 2:2010158/91‑1 (MQ=255) aaaGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCacacccaaatatatggcgttgcgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagc < 1:233507‑M1/91‑61 (MQ=255) aaaGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGAt > 1:3577074/1‑91 (MQ=255) aaGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATg < 1:2386758/91‑1 (MQ=255) aGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGa > 2:940641/1‑91 (MQ=255) cTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAAt < 2:1569847/91‑1 (MQ=255) tataGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATg > 2:119098/1‑91 (MQ=255) taGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCg < 1:1117398/91‑1 (MQ=255) aGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGt < 2:1845676/91‑1 (MQ=255) aGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTggg > 2:2464848/1‑91 (MQ=255) gTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGt < 2:3526107/91‑1 (MQ=255) tATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTc > 2:2785680/1‑91 (MQ=255) tGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTg > 2:2664822/1‑91 (MQ=255) tGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTg < 2:2701139/91‑1 (MQ=255) gCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGa < 2:2937326/91‑1 (MQ=255) cTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGaa < 1:489021/91‑1 (MQ=255) tGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAata > 1:1029119/1‑91 (MQ=255) ggTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATCTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAatat > 2:3058221/1‑91 (MQ=255) ttAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAg > 2:2361060/1‑91 (MQ=255) aaaCAGCacacccaaatatatggcgttgcgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttct < 2:1101953‑M1/91‑85 (MQ=255) aaCAGCacacccaaatatatggcgttgcgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttctt > 2:1774909‑M1/1‑6 (MQ=255) aaCAGCacacccaaatatatggcgttgcgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttctt < 1:2011663‑M1/91‑86 (MQ=255) aaCAGCacacccaaatatatggcgttgcgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttctt > 1:1772166‑M1/1‑6 (MQ=255) aaCAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGccc > 1:195958/1‑91 (MQ=255) cAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaa < 1:140582‑M2/91‑66 (MQ=255) cAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGt > 2:3471940/1‑91 (MQ=255) cAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTACTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGt > 2:3256218/1‑91 (MQ=255) aGCacacccaaatatatggcgttgcgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaa < 2:2742401‑M1/91‑89 (MQ=255) aGCacacccaaatatatggcgttgcgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaa < 2:1785275‑M1/91‑89 (MQ=255) aGCacacccaaatatatggcgttgcgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaa < 2:871172‑M1/91‑89 (MQ=255) gcgcAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaat < 1:3514904‑M2/91‑68 (MQ=255) gcgcAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcataccgaaccttcttaaat < 1:3878445‑M2/91‑68 (MQ=255) gcgcAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGa < 1:1919420/91‑1 (MQ=255) gCacacccaaatatatggcgttgcgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaat > 2:424383‑M1/1‑2 (MQ=255) gCacacccaaatatatggcgttgcgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaat > 2:3618718‑M1/1‑2 (MQ=255) gCacacccaaatatatggcgttgcgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaat < 2:2266761‑M1/91‑90 (MQ=255) cgcAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaata < 1:29466‑M2/91‑69 (MQ=255) cgcAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGaa > 1:3160797/1‑91 (MQ=255) | CTTGAGGATAATTTGGAAAAGCATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAA > USA300TCH1516_ALE/482174‑482354 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |