| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 482264 | 125 (0.660) | 19 (0.110) | 8/146 | NT | 14.0% | intergenic (+61/‑622) | USA300HOU_RS02285/USA300HOU_RS02295 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 482286 | 119 (0.690) | intergenic (+83/‑600) | USA300HOU_RS02285/USA300HOU_RS02295 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
ATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAAAGGCGTATGTCATAAAATTTGC > USA300TCH1516_ALE/482196‑482376 | atatTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGgtgt < 2:1273190/91‑1 (MQ=255)atatTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGgtgt < 2:2174372/91‑1 (MQ=255)atatTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGgtgt < 2:2734043/91‑1 (MQ=255)atatTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGgtgt < 1:792281/91‑1 (MQ=255) tatTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTg < 2:1505669‑M2/91‑2 (MQ=255) atTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgc > 2:3618718‑M2/1‑89 (MQ=255) atTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgc < 2:2266761‑M2/91‑3 (MQ=255) atTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgc > 2:424383‑M2/1‑89 (MQ=255) tttAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgct < 2:1109182‑M2/91‑4 (MQ=255) tttAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgct < 1:1375554‑M2/91‑4 (MQ=255) tttAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgct < 2:1785275‑M2/91‑4 (MQ=255) tttAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgct < 1:996753‑M2/91‑4 (MQ=255) tttAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgct < 2:871172‑M2/91‑4 (MQ=255) tAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgctgt > 2:640864‑M2/1‑86 (MQ=255) aagaagGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtt > 1:1772166‑M2/1‑85 (MQ=255) gaagGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGtttt < 1:1807110/91‑1 (MQ=255) gaagGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCCGtttt > 2:3572741/1‑91 (MQ=255) aagGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGttttt < 2:152772/91‑1 (MQ=255) agGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTc < 1:780546/91‑1 (MQ=255) ggTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCt > 2:454593/1‑91 (MQ=255) ggTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCt < 1:353877/91‑1 (MQ=255) ggTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCt < 2:2199576/91‑1 (MQ=255) ggTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCt < 1:812862/91‑1 (MQ=255) gTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaacca < 1:2929961‑M2/91‑13 (MQ=255) ttAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTAt < 1:1177908/91‑1 (MQ=255) tGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACatga < 2:2649619/91‑1 (MQ=255) tGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACatga < 1:1559710/91‑1 (MQ=255) gCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACatgat > 1:2500251/1‑91 (MQ=255) gCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACatgat < 1:2895369/91‑1 (MQ=255) gCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACatgat > 1:1331951/1‑91 (MQ=255) tCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGAtgtg < 2:1165298/91‑1 (MQ=255) tgctgGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGtt > 1:150220/1‑91 (MQ=255) ctgGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTtta > 1:910234/1‑91 (MQ=255) tgGCTTATTGAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTttat < 1:3710850/91‑1 (MQ=255) ggCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTttatt < 1:94518/91‑1 (MQ=255) ggCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTttatt < 2:915269/91‑1 (MQ=255) gCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaaccaagcatacttctatagcttt < 1:233507‑M2/91‑32 (MQ=255) gCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTttattg > 2:3850206/1‑90 (MQ=255) ttattaAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACg < 1:612391/91‑1 (MQ=255) attaAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTg < 1:2073587/91‑1 (MQ=255) attaAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTg < 1:1781294/91‑1 (MQ=255) taAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGa < 2:1942975/91‑1 (MQ=255) aaaGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGAt > 1:616238/1‑91 (MQ=255) aGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGa < 2:2916720/91‑1 (MQ=255) aGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGa > 2:3646813/1‑91 (MQ=255) aGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGa > 2:944382/1‑91 (MQ=255) gCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGaa < 1:1998473/91‑1 (MQ=255) cTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAAt < 2:1569848/91‑1 (MQ=255) ataGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGc > 1:1212187/1‑91 (MQ=255) taGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCg < 1:1117398/91‑1 (MQ=255) aGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGt < 2:1845676/91‑1 (MQ=255) aGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTggg > 2:2464848/1‑91 (MQ=255) gTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGt < 2:3526107/91‑1 (MQ=255) tATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTc > 2:2785680/1‑91 (MQ=255) tGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTg > 2:2664822/1‑91 (MQ=255) tGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTg < 2:2701402/91‑1 (MQ=255) gCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGa < 2:2937326/91‑1 (MQ=255) cTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGaa > 1:103081/1‑91 (MQ=255) cTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGaa < 1:489021/91‑1 (MQ=255) ttGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAat < 1:2132015/91‑1 (MQ=255) tGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAata > 1:1029119/1‑91 (MQ=255) tGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAata > 1:1497298/1‑91 (MQ=255) ggTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATCTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAatat > 2:3058221/1‑91 (MQ=255) ttAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAg > 1:2739220/1‑91 (MQ=255) ttAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAg > 2:2361060/1‑91 (MQ=255) aaaCAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGcc > 1:80241/1‑91 (MQ=255) aCAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCg > 1:169586/1‑91 (MQ=255) cAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaa < 1:2511073‑M2/91‑66 (MQ=255) cAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaa < 1:2511089‑M2/91‑66 (MQ=255) cAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGt < 1:3240307/91‑1 (MQ=255) cAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGt > 2:3471940/1‑91 (MQ=255) cAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTACTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGt > 2:3256218/1‑91 (MQ=255) cAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGGGCTGTTTTTCTATTGCATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGt < 2:1723796/91‑1 (MQ=255) aGCGCAACGCCAGATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTg > 1:2973937/1‑91 (MQ=255) gcgcAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcataccgaaccttcttaaat < 1:3878445‑M2/91‑68 (MQ=255) gcgcAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGa < 1:1919420/91‑1 (MQ=255) cgcAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaata < 1:29466‑M2/91‑69 (MQ=255) cgcAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaata < 1:739968‑M2/91‑69 (MQ=255) cgcAACGCCATATATTTGGGTGTGCTTTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGaa > 2:2121076/1‑91 (MQ=255) cgcAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGaa < 2:1603093/91‑1 (MQ=255) cgcAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGaa > 1:2438440/1‑91 (MQ=255) cgcAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGaa > 1:3160797/1‑91 (MQ=255) gcAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaatat < 1:3582855‑M2/91‑70 (MQ=255) gcAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaatat < 1:3684460‑M2/91‑70 (MQ=255) gcAACGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaatat < 1:2574576‑M2/91‑70 (MQ=255) gcAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGaaa > 1:2188756/1‑91 (MQ=255) aaCGCCATATATTTGGGTGTgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaatatgc < 2:2321589‑M2/91‑72 (MQ=255) aaCGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAAAgg > 2:332354/1‑91 (MQ=255) aaCGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAAAgg < 2:2500251/91‑1 (MQ=255) gCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAAAGGCGt < 1:3572741/91‑1 (MQ=255) atatTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAAAGGCGTATGTc > 1:491309/1‑91 (MQ=255) atatTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAAAGGCGTATGTc > 2:1035085/1‑91 (MQ=255) atatTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAAAGGCGTATGTc < 1:2280944/91‑1 (MQ=255) tatTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAAAGGCGTATGTCa > 2:2009691/1‑91 (MQ=255) atTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAAAGGCGTATGTCAt < 2:1838851/91‑1 (MQ=255) ttGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAAAGGCGTATGTCATaa > 2:2690852/1‑91 (MQ=255) tGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAg < 1:3176853/67‑1 (MQ=255) tGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAg > 2:3176853/1‑67 (MQ=255) tgtgCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAAAGGCGTATGTCATAAAAttt < 1:861213/91‑1 (MQ=255) gtgCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAAAGGCGTATGTCATAAAATTTg < 1:3507387/91‑1 (MQ=255) | ATATTTAAGAAGGTTAGGTATGCTTCTGCTGGCTTATTAAAGCTATAGAAGTATGCTTGGTTAAACAGCGCAACGCCATATATTTGGGTGTGCTGTTTTTCTATTACATGATGTGTTTATTACGTGGATGAATGCGTGGGTCTGAATATAGCCCGTGAAAGGCGTATGTCATAAAATTTGC > USA300TCH1516_ALE/482196‑482376 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |