| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 633311 = | 143 (0.750) | 16 (0.100) | 12/134 | NT | 10.8% | intergenic (+35/‑509) | proP/yhfT | Proline/betaine transporter/putative acyl‑‑CoA ligase YhfT |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 633354 = | 146 (0.920) | intergenic (+78/‑466) | proP/yhfT | Proline/betaine transporter/putative acyl‑‑CoA ligase YhfT | |||||
Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
ATTATGCAGAACATCCAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATACA > USA300TCH1516_ALE/633221‑633401 | ccctctttcccccattgcgataatcattgcagtgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaa < 1:373784‑M1/1‑1 (MQ=255)ccctctttcccccattgcgataatcattgcagtgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaa < 1:386839‑M1/1‑1 (MQ=255)ccctctttcccccattgcgataatcattgcagtgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaa < 1:474420‑M1/1‑1 (MQ=255)ccctctttcccccattgcgataatcattgcagtgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaa < 1:198781‑M1/1‑1 (MQ=255)attatGCAGAACATCCAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATA > 2:386839‑M1/1‑91 (MQ=255) cctctttcccccattgcgataatcattgcagtgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaaa > 1:1035982‑M1/90‑91 (MQ=255) tatGCAGAACATCCAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAG < 1:2140229‑M1/91‑1 (MQ=255) tatGCAGAACATCCAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAG > 1:1550679‑M1/1‑91 (MQ=255) atGCAGAACATCCAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGC > 2:2875778‑M1/1‑91 (MQ=255) tGCAGAACATCCAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCA > 1:1915832‑M1/1‑91 (MQ=255) ctttcccccattgcgataatcattgcagtgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCa > 1:2418855‑M1/87‑91 (MQ=255) tttcccccattgcgataatcattgcagtgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCAc < 2:1387515‑M1/6‑1 (MQ=255) ttcccccattgtgataatcattgcagtgggggtttatgtatatacaaaaactttattactgctaattacagttctcaatttaaaAAGCACt > 2:2961099‑M1/85‑91 (MQ=255) ttcccccattgcgataatcattgcagtgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCACt > 2:1300636‑M1/85‑91 (MQ=255) gAACATCCAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTT < 1:300245‑M1/91‑1 (MQ=255) gAACATCCAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTT < 1:2228389‑M1/91‑1 (MQ=255) ccccattgcgataatcattgcagtgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCACTTTa < 2:3399506‑M1/10‑1 (MQ=255) aaCATCCAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTA > 2:1958383‑M1/1‑91 (MQ=255) aCATCCAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAA > 2:1907216‑M1/1‑91 (MQ=255) ccattgcgataatcattgcagtgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCACTTTaaa < 1:341382‑M1/12‑1 (MQ=255) cATCCAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAA < 1:831599‑M1/91‑1 (MQ=255) cattgcgataatcattgcagtgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCACTTTAAAg < 1:368406‑M1/13‑1 (MQ=255) cactgcaatgattatcgcaatgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCACTTTAAAg < 1:1244302‑M1/13‑1 (MQ=255) aTCCAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAG > 1:1957309‑M1/1‑91 (MQ=255) ccAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCt < 1:516286/91‑1 (MQ=255) ccAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCt > 2:3055907/1‑91 (MQ=255) ccAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCt > 1:3508071/1‑91 (MQ=255) aagaagCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCtagta > 2:2097116/1‑91 (MQ=255) aagCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGt < 1:449998/91‑1 (MQ=255) aagCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGt > 2:563946/1‑91 (MQ=255) tcattgcagtgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCACTTAAAAGCTAGTAGGTTc > 2:2969734‑M1/68‑91 (MQ=255) gCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTc > 1:905634/1‑91 (MQ=255) gCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTc > 2:518239/1‑91 (MQ=255) cattgcagtgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCa < 1:3161790‑M1/5‑1 (MQ=255) cATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCt > 1:73501/1‑91 (MQ=255) ttATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGc < 2:1807366/91‑1 (MQ=255) tATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCt < 1:2779455/91‑1 (MQ=255) tATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCt < 1:55218/91‑1 (MQ=255) ggtggGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAAc < 2:430609‑M2/91‑2 (MQ=255) ggtggGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAAc > 1:782949‑M2/1‑90 (MQ=255) ggtggGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAAc < 1:663246‑M2/91‑2 (MQ=255) ggtggGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAAc > 1:508531‑M2/1‑90 (MQ=255) gtggGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGttagcagaacctactagct < 1:1868472‑M1/91‑20 (MQ=255) tgggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACtt > 2:2047635‑M1/59‑91 (MQ=255) tggGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGttagcagaacctactagctt < 2:11067‑M1/91‑21 (MQ=255) tggGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAActt < 2:1330542‑M2/91‑4 (MQ=255) gggggtttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACttt > 2:2544534‑M1/58‑91 (MQ=255) ggTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAActtta < 2:3092118‑M2/91‑6 (MQ=255) ggTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAActtta < 1:2747325‑M2/91‑6 (MQ=255) gTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAActttaa > 1:1330542‑M2/1‑85 (MQ=255) ttAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAActttaaa > 1:1316624‑M2/1‑84 (MQ=255) tttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTTTGCTAACTTTAAAGt > 2:2663035‑M1/53‑91 (MQ=255) tttatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGt > 1:116930‑M1/53‑91 (MQ=255) aaaGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGttagcagaacctactagctttgaagt < 1:3056722‑M1/91‑27 (MQ=255) aaaGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAActttaaagt > 1:2939609‑M2/1‑82 (MQ=255) tatgtatatacaaaaactttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCACt > 2:360538‑M1/51‑57 (MQ=255) aGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAActttaaagtgc > 1:502737‑M2/1‑80 (MQ=255) aCGTAAGAATTCGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGttagcagaacctactagctttaaagtgctta < 1:3524597‑M1/91‑32 (MQ=255) aCGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCttt > 2:3036125/1‑91 (MQ=255) gAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAAt > 1:1821775/1‑91 (MQ=255) gAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAAt > 2:3781601/1‑91 (MQ=255) tAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTgag > 1:2272078/1‑91 (MQ=255) agagATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTgaga > 1:1445231/1‑91 (MQ=255) gagaTTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGaa > 2:925132/1‑91 (MQ=255) ttattacggctaattacagttctcaatttaaaAAGCACttt < 2:1553228‑M1/9‑1 (MQ=255) ttttAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGt < 2:1836521/91‑1 (MQ=255) ttttAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGt < 2:285768/91‑1 (MQ=255) aattAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGt < 2:2715322/89‑1 (MQ=255) tttAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTa < 2:2436447/91‑1 (MQ=255) taataaAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAAt > 2:1251509/1‑91 (MQ=255) taataaAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAAt < 1:3807078/91‑1 (MQ=255) aataaAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAAtt > 1:2178255/1‑91 (MQ=255) aataaAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAAtt < 2:80553/91‑1 (MQ=255) aataaAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAAtt > 2:2768709/1‑91 (MQ=255) ataaAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTa > 2:3681685/1‑91 (MQ=255) ataaAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTa > 2:3466784/1‑91 (MQ=255) aaaaaGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGc < 1:1553467/91‑1 (MQ=255) aaaaaGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGc < 1:442106/91‑1 (MQ=255) aaaaGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAActttaaagtgcttatatacgattgatttatacttttta < 1:1238331‑M2/91‑39 (MQ=255) aaGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAATAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGt > 1:3282919/1‑91 (MQ=255) gTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGtaa > 1:208153/1‑91 (MQ=255) gTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGtaa > 1:2531307/1‑91 (MQ=255) tataAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGtaat < 2:3505592/91‑1 (MQ=255) ataAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCAAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGtaata < 2:1128536/91‑1 (MQ=255) taAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGtaataa < 1:2677557/91‑1 (MQ=255) taAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTATTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGtaataa > 1:3326513/1‑91 (MQ=255) aaaTCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATaaa < 1:2966625/91‑1 (MQ=255) aaaTCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATaaa > 1:1733785/1‑91 (MQ=255) aatcaatcGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAg < 2:334580/91‑1 (MQ=255) aatcaatcGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAg < 2:710338/91‑1 (MQ=255) aatcaatcGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAg < 2:615719/91‑1 (MQ=255) atcaatcGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGt > 1:2200582/1‑91 (MQ=255) atcaatcGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGt > 2:193298/1‑91 (MQ=255) aatcGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGtttt < 2:169853/91‑1 (MQ=255) gTATATAAGCACTTTAAAGctagtaggttctgctaactttaaagtgcttatatacgattgatttatactttttattaaaatctctaattct > 1:1149587‑M1/1‑19 (MQ=255) gTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAActttaaagtgcttatatacgattgatttatactttttattaaaatctctaattct < 1:2605040‑M2/91‑56 (MQ=255) atataAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGtata > 1:3535009/1‑91 (MQ=255) taAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATAc > 2:373784/1‑91 (MQ=255) AAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATACa < 1:2095249‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATACa > 2:2169588‑M1/1‑91 (MQ=255) | ATTATGCAGAACATCCAAAAGAAGCATTATGGTGGGTTAAAGAACGTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATACA > USA300TCH1516_ALE/633221‑633401 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |