| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 940823 = | 172 (0.900) | 12 (0.070) | 8/140 | NT | 7.7% | intergenic (+4/+52) | USA300HOU_RS04680/ptlE | Putative esterase/Neopentalenolactone D synthase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 940872 = | 137 (0.820) | intergenic (+53/+3) | USA300HOU_RS04680/ptlE | Putative esterase/Neopentalenolactone D synthase | |||||
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
CATGTATGGGATATAAAAATTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTC > USA300TCH1516_ALE/940733‑940913 | ccatttggtagaaatgttatgggtggccgtaaagctgccgaacgcattgaacaagcatttctaaaactacaacaatatagcgcataaaaaa > 1:2333788‑M1/91‑91 (MQ=255)ccatttggtagaaatgttatgggtggccgtaaagctgccgaacgcattgaacaagcatttctaaaactacaacaatatagcgcataaaaaa > 1:101258‑M1/91‑91 (MQ=255)caTGTATGGGATATAAAAATTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGa > 2:3176233/1‑91 (MQ=255)caTGTATGGGATATAAAAATTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGa < 2:3482215/91‑1 (MQ=255)caTGTATGGGATATAAAAATTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGa > 2:2038757/1‑91 (MQ=255) tGTATGGGATATAAAAATTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAAc < 2:2123797/91‑1 (MQ=255) atttggtagaaatgttatgggtggccgtaaagctgccgaacgcattgaacaagcatttctaaaactacaacaatatagcgcataaaaaAAc > 1:280411‑M1/89‑91 (MQ=255) gTATGGGATATAAAAATTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACt < 2:2646762/91‑1 (MQ=255) ttggtagaaatgttatgggtggccgtaaagctgccgaacgcattgaacaagcatttctaaaactacaacaatatagcgcataaaaaAACTg > 2:699969‑M1/87‑91 (MQ=255) tggtagaaatgttatgggtggccgtaaagctgccgaacgcattgaacaagcatttctaaaactacaacaatatagcgcataaaaaAACTGc > 1:596946‑M1/86‑91 (MQ=255) ggtagaaatgttatgggtggccgtaaagctgccgaacgcattgaacaagcatttctaaaactacaacaatatagcgcataaaaaAACTGCt < 2:2270499‑M1/7‑1 (MQ=255) gtagaaatgttatgggtggccgtaaagctgccgaacgcattgaacaagcatttctaaaactacaacaatatagcgcataaaaaAACTGCTa < 2:677364‑M1/8‑1 (MQ=255) gtagaaatgttatgggtggccgtaaagctgccgaacgcattgaacaagcatttctaaaactacaacaatatagcgcataaaaaAACTGCTa < 2:3678008‑M1/8‑1 (MQ=255) gggATATAAAAATTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTa < 2:463800/91‑1 (MQ=255) ggATATAAAAATTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAg < 1:3723013/91‑1 (MQ=255) gATATAAAAATTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGc > 1:481582/1‑91 (MQ=255) atatAAAAAGTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTAAAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCt < 2:2628524/91‑1 (MQ=255) taAAAATTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGaa > 2:1642817/1‑91 (MQ=255) taAAAATTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGaa < 1:1328374/91‑1 (MQ=255) taAAAATTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTT‑AAATAAAAGAACTGCTAGCTGaaa > 2:3560878/1‑91 (MQ=255) aaaaaTTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGaaa < 2:314931/91‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAAt > 1:1701597/1‑91 (MQ=255) aTTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGtt < 2:1117348/91‑1 (MQ=255) ttAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAAGAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTa > 1:3620958/1‑91 (MQ=255) aaGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATg > 1:2298856/1‑91 (MQ=255) aGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATga > 1:1277630/1‑91 (MQ=255) gAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATgag > 2:2183434/1‑91 (MQ=255) gAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATgag > 1:1904514/1‑91 (MQ=255) gAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATgag < 1:3220950/91‑1 (MQ=255) tGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGata > 1:1724487/1‑91 (MQ=255) gACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGatat > 2:3069047/1‑91 (MQ=255) aaaGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCa < 1:1039812/91‑1 (MQ=255) aagctgccgaacgcattgaacaagcatttctaaaactacaacaatatagcgcataaaagAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCAt > 1:834836‑M1/60‑91 (MQ=255) aaGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCAt < 1:2234206/91‑1 (MQ=255) aaGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCAt < 2:1294941/91‑1 (MQ=255) aGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATa > 2:202746/1‑91 (MQ=255) gAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATaa < 1:1609310/91‑1 (MQ=255) aCAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATAAGATATTCATAACt > 2:3730283/1‑91 (MQ=255) cAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTa > 1:27310/1‑91 (MQ=255) aattaattACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTAc > 1:1164213/1‑91 (MQ=255) attaattaCAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAACGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACg < 2:3595416/91‑1 (MQ=255) attaattaCAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACg > 1:2486407/1‑91 (MQ=255) ttaattaCAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACgg > 1:3089414/1‑91 (MQ=255) attaCAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTa > 1:432219/1‑91 (MQ=255) ttaCAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAg < 2:1978106/91‑1 (MQ=255) taCAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGc < 1:628899/91‑1 (MQ=255) taCAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACCGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGc > 2:3410135/1‑91 (MQ=255) ttgaacaagcatttctaaaactacaacaatatagcgcataaaaaAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAg > 2:3735016‑M1/45‑91 (MQ=255) cAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAg > 2:1631836/1‑91 (MQ=255) aGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGt < 1:3456969/91‑1 (MQ=255) aGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGt < 1:3398697/91‑1 (MQ=255) gaacaagcatttctaaaactacaacaatatagcgcataaaagAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGtt > 1:2946526‑M1/43‑91 (MQ=255) gTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGtt > 2:3555440/1‑91 (MQ=255) ttATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGttt < 1:2717644/91‑1 (MQ=255) aTGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTtt > 2:1232679‑M2/1‑89 (MQ=255) gCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTtttt < 1:1308951‑M2/91‑5 (MQ=255) gCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTtttt < 2:1592596‑M2/91‑5 (MQ=255) ggTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATgc < 2:1038389/91‑1 (MQ=255) tACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATgcgc < 1:3123357/91‑1 (MQ=255) tACAGTTGCTATCAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTGTTATgcgc < 2:2628726/91‑1 (MQ=255) aCAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCt > 2:1821220/1‑91 (MQ=255) aCAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCt > 1:2170655/1‑91 (MQ=255) aCAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCt < 2:1938981/91‑1 (MQ=255) aCAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCt < 2:1203941/91‑1 (MQ=255) aCAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCt < 2:1419743/91‑1 (MQ=255) gTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCtata > 2:1310454/1‑91 (MQ=255) cTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAttgt < 1:2454868/91‑1 (MQ=255) tATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAttgtt < 1:2643584/91‑1 (MQ=255) aaTTAATCCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAATTGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAttgtt < 1:638473/90‑1 (MQ=255) tAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTa < 2:849930/91‑1 (MQ=255) ccTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGttt < 1:1204483/91‑1 (MQ=255) ccTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGttt < 1:3048281/91‑1 (MQ=255) ccTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGttt < 2:184741/91‑1 (MQ=255) cTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTttttattttaaaggtttaatagcaact < 1:699908‑M2/91‑28 (MQ=255) cTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGtttt < 2:543244/91‑1 (MQ=255) cTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCAATATTGTTGTAGtttt > 1:2024625/1‑91 (MQ=255) tttAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTttttattttaaaggtttaatagcaactg < 2:545404‑M2/91‑29 (MQ=255) tttAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTa < 1:994483/91‑1 (MQ=255) taaaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGa > 1:1420795/1‑91 (MQ=255) taaaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGa > 1:1422207/1‑91 (MQ=255) taaaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGa > 1:2606105/1‑91 (MQ=255) aaaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGaa < 1:2258648/91‑1 (MQ=255) aaaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGaa < 1:2257649/91‑1 (MQ=255) aaaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGaa > 2:1925457/1‑91 (MQ=255) aaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGaaa > 1:731227/1‑91 (MQ=255) aataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAAt < 1:2912979/91‑1 (MQ=255) aataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAAt > 2:2836248/1‑91 (MQ=255) aataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAAt < 2:643644/91‑1 (MQ=255) ataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATg > 2:2457160/1‑91 (MQ=255) taaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGc < 2:2381323/91‑1 (MQ=255) taaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTCttttattttaaaggtttaatagcaactgtaccacg < 1:2077730‑M2/91‑36 (MQ=255) aaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTttttattttaaaggtttaatagcaactgtaccacgc < 1:3829043‑M2/91‑37 (MQ=255) aaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTttttattttaaaggtttaatagcaactgtaccacgca < 1:1743219‑M2/91‑38 (MQ=255) aaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTg < 2:3252396/91‑1 (MQ=255) gAACTTCTGGGTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGtt < 2:3585588/91‑1 (MQ=255) gAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGtt > 1:956360/1‑91 (MQ=255) aaCTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTCttttattttaaaggtttaatagcaactgtaccacgcataac < 2:2878341‑M2/91‑42 (MQ=255) aaCTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTCttttattttaaaggtttaatagcaactgtaccacgcataac < 2:473278‑M2/91‑42 (MQ=255) AACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTTATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTc < 2:3387863‑M1/91‑1 (MQ=255) AACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTc < 2:3274088‑M1/91‑1 (MQ=255) | CATGTATGGGATATAAAAATTAAGAATGACAAAGAACAATTAATTACAGTTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTC > USA300TCH1516_ALE/940733‑940913 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |