| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1005781 = | 204 (1.070) | 29 (0.180) | 13/138 | NT | 15.4% | intergenic (+417/+43) | pepF1_1/USA300HOU_RS04965 | Oligoendopeptidase F, plasmid/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1005817 = | 142 (0.870) | intergenic (+453/+7) | pepF1_1/USA300HOU_RS04965 | Oligoendopeptidase F, plasmid/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
GTTAAATTCGAAAAATATCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATC > USA300TCH1516_ALE/1005691‑1005871 | ccattcaacaaaaaattgaaaaacttaaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaatta > 1:1004533‑M1/91‑91 (MQ=255) cattcaacaaaaaattgaaaaacttaaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattaa < 1:3529254‑M1/2‑1 (MQ=255) tAAATTCGAAAAATATCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTaaaaa < 1:194301/91‑1 (MQ=255) attcaacaaaagattgaaaaacttaaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattaaa > 2:2866828‑M1/89‑91 (MQ=255) aaTTCGAAAAATATCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGa > 2:2762908/1‑91 (MQ=255) caacaaaaaattgaaaaacttaaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGAc > 1:265968‑M1/86‑91 (MQ=255) aacaaaaaattgaaaaacttaaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGAcc < 1:1487485‑M1/7‑1 (MQ=255) aacaaaaaattgaaaaacttaaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGAcc > 1:1186782‑M1/85‑91 (MQ=255) acaaaaaattgaaaaacttaaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCt > 2:941226‑M1/84‑91 (MQ=255) acaaaaaagtgaaaaacttaaatatccagatggcaatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaagaaattAAAGACCt > 2:1511244‑M1/84‑91 (MQ=255) caaaaaattgaaaaacttaaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTc < 2:2287809‑M1/9‑1 (MQ=255) caaaaaattgaaaaacttaaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTc > 2:882016‑M1/83‑91 (MQ=255) caaaaaattgaaaaacttaaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTc > 2:1031753‑M1/83‑91 (MQ=255) gAAAAATATCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCg > 2:390418/1‑91 (MQ=255) gAAAAATATCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCg > 2:3754841/1‑91 (MQ=255) aaaaattgaaaaacttaaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGt < 2:1240189‑M1/11‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGt < 1:1707048/91‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGt < 2:3818914/91‑1 (MQ=255) aaaaTATCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGtt < 1:3359473/91‑1 (MQ=255) aaaaTATCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGta > 1:3042544/1‑90 (MQ=255) aaaTATCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAGTGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTa < 1:3274514/91‑1 (MQ=255) aaTATCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTAc < 1:1843623/91‑1 (MQ=255) aaTATCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTAc < 1:2449696/91‑1 (MQ=255) aaTATCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTAc < 2:1113519/91‑1 (MQ=255) atatCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACa > 2:1409650/1‑91 (MQ=255) atatCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACa < 2:345839/91‑1 (MQ=255) atCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACAtt < 1:2289174/91‑1 (MQ=255) tCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACAttt > 1:2544251/1‑91 (MQ=255) cACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTa < 1:486408/91‑1 (MQ=255) aCTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTAt > 1:3197218/1‑91 (MQ=255) cTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATg < 1:2394530/91‑1 (MQ=255) cTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATg < 1:3803736/91‑1 (MQ=255) aacttaaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATgg > 1:2774269‑M1/70‑91 (MQ=255) cttaaatatccagatggcgatttctagaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcgaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGgtg > 1:3606724‑M1/68‑91 (MQ=255) tatatTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGgtgt < 1:4995/91‑1 (MQ=255) taaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTa > 1:2379645‑M1/66‑91 (MQ=255) taaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTa > 1:1662004‑M1/66‑91 (MQ=255) taaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTa > 2:2405212‑M1/66‑91 (MQ=255) tatTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTAc > 1:2521702/1‑91 (MQ=255) aaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTAc > 2:2713669‑M1/65‑91 (MQ=255) ttAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAg > 1:3439393/1‑91 (MQ=255) ttAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAg < 1:1801599/91‑1 (MQ=255) tatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAg > 2:3307805‑M1/62‑91 (MQ=255) tatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAg > 1:933575‑M1/62‑91 (MQ=255) tAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAGATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACGTTTATGGTGTACGAgg < 2:3607475/91‑1 (MQ=255) tAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAgg > 1:2274976/1‑91 (MQ=255) gATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTc > 1:1240677/1‑91 (MQ=255) cagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCt > 1:2914965‑M1/58‑91 (MQ=255) tCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCtt > 2:3516910/1‑91 (MQ=255) gATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTa > 2:1224051/1‑91 (MQ=255) gATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTa > 1:2075010/1‑91 (MQ=255) gATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTa > 2:1526/1‑91 (MQ=255) aTGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTaa < 2:3434783/91‑1 (MQ=255) aTGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTaa > 2:2452066/1‑91 (MQ=255) aTGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTaa > 2:2752611/1‑91 (MQ=255) gtgtAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAatt < 1:659605/91‑1 (MQ=255) tttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAatttatt > 1:711437‑M1/48‑91 (MQ=255) tgtctggagatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaatagattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAatttatt > 2:1595244‑M1/48‑91 (MQ=255) aCATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAatttattt < 2:1734261/91‑1 (MQ=255) aCGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTAtttt < 1:591902/91‑1 (MQ=255) cGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATtttg > 2:1327013/1‑91 (MQ=255) cGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATtttg > 2:2589919/1‑91 (MQ=255) gTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATtttga > 1:2137146/1‑91 (MQ=255) ttCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATtttgat < 2:1627673/91‑1 (MQ=255) tCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATtttgatt < 2:1192018/91‑1 (MQ=255) cTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATtttgattt > 1:3739213/1‑91 (MQ=255) taataaTTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAACAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATtttgatttg < 2:3062469/91‑1 (MQ=255) taatTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTtgatttgatt < 2:3170278/91‑1 (MQ=255) aatTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTgatttgattt > 2:1987448/1‑91 (MQ=255) ttAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAg < 1:432799/91‑1 (MQ=255) tGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCAt > 1:3840714/1‑91 (MQ=255) tGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCAt > 2:801019/1‑91 (MQ=255) tGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCAt > 1:1595622/1‑91 (MQ=255) gTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCAtt > 2:1924731/1‑91 (MQ=255) gCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTa < 1:1082459/91‑1 (MQ=255) acaTTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGAt > 1:2733312/3‑91 (MQ=255) ttAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTc > 2:2273345/1‑91 (MQ=255) ttAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTc < 1:885530/91‑1 (MQ=255) tAAGAGTCAGTAAAATGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTCTTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTcc > 1:3305708/1‑91 (MQ=255) tAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTcc > 2:456000/1‑91 (MQ=255) aaGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCa > 2:514101/1‑91 (MQ=255) aaGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCa < 1:173884/91‑1 (MQ=255) agagTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAg > 2:600798/1‑91 (MQ=255) agagTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAg > 1:2128449/1‑91 (MQ=255) agagTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAg > 1:2844619/1‑91 (MQ=255) agagTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAg > 2:320221/1‑91 (MQ=255) gagTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGa > 2:765592/1‑91 (MQ=255) gagTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGa < 2:1812672/91‑1 (MQ=255) gagTCAGTAAAAAGACATCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGa < 2:2973106/91‑1 (MQ=255) agTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGaa > 1:2121277/1‑91 (MQ=255) agTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGaa > 1:1886614/1‑91 (MQ=255) aGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCg > 1:3808322/1‑91 (MQ=255) tAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGcc > 2:607727/1‑91 (MQ=255) aaaaaGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCa < 1:1409650/91‑1 (MQ=255) aaaaaGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCa > 2:2664799/1‑91 (MQ=255) aaaaaGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCa > 2:2548176/1‑91 (MQ=255) aaaaGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCAt < 2:1805531/91‑1 (MQ=255) aaaaGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCAt > 2:2190751/1‑91 (MQ=255) AAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATc > 1:1204695‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATc < 1:275904‑M1/91‑1 (MQ=255) | GTTAAATTCGAAAAATATCACTAATATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATC > USA300TCH1516_ALE/1005691‑1005871 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |