New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1073608 = | 171 (0.900) | 11 (0.060) | 8/152 | NT | 6.4% | coding (215/483 nt) | purE | N5‑carboxyaminoimidazole ribonucleotide mutase |
? | USA300TCH1516_ALE | 1073634 = | 160 (0.880) | coding (241/483 nt) | purE | N5‑carboxyaminoimidazole ribonucleotide mutase |
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
AAATGATGGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTTATTATCAATTGTTC > USA300TCH1516_ALE/1073518‑1073697 | tgcaaccggaatacctcctggcatttgaacaattgataagaaagaatctataccctttaaactttttgtttcaatcggcactccaataact > 2:3667867‑M1/91‑91 (MQ=255) aaTGATGGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATg > 1:2981145/1‑91 (MQ=255) tgatgGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGt < 2:2243766/91‑1 (MQ=255) tgGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGc > 2:2007007/1‑91 (MQ=255) tgGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGc > 1:1185113/1‑91 (MQ=255) tgGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGc < 1:1535227/91‑1 (MQ=255) tgGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGc > 1:1581477/1‑91 (MQ=255) ggTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGca > 2:499527/1‑91 (MQ=255) ggTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGca > 1:1693794/1‑91 (MQ=255) gTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGcat > 1:2085731/1‑91 (MQ=255) ttCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGGGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGcatc < 1:821901/91‑1 (MQ=255) tCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGcatca > 1:3271748/1‑91 (MQ=255) aTTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTa < 2:917903/91‑1 (MQ=255) tttGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTaa < 1:1979844/91‑1 (MQ=255) gCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAacga > 2:1106931/1‑91 (MQ=255) ttCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAacgacg < 1:1144406/91‑1 (MQ=255) tCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATGATTAACGACGc > 1:3516141/1‑91 (MQ=255) cTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCt > 1:1469933/1‑91 (MQ=255) tGAAGCGAGAGAAAGGGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTa < 2:3540190/91‑1 (MQ=255) tGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTa < 2:2058614/91‑1 (MQ=255) atttgaacaattgataataaagaatctataccctttaaactttttgtttcaatcggcactccaataacTGGTTGCATCATTAACGACGCTa > 2:1416742‑M1/69‑91 (MQ=255) atttgaacaattgataataaagaatctataccctttaaactttttgtttcaatcggcactccaataacTGGTTGCATCATTAACGACGCTa > 2:1426903‑M1/69‑91 (MQ=255) tttgaacaattgataataaagaatctataccctttaaactttttgtttcaatcggcactccaataacTGGTTGCATCATTAACGACGCTAc > 2:1842794‑M1/68‑91 (MQ=255) tttgaacaattgataataaagaatctataccctttaaactttttgtttcaatcggcactccaataacTGGTTGCATCATTAACGACGCTAc > 2:2514397‑M1/68‑91 (MQ=255) gAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTAc < 2:2157628/91‑1 (MQ=255) gAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTAc < 1:179136/91‑1 (MQ=255) gAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTAc < 1:2659894/91‑1 (MQ=255) ttgaacaattgataataaagaatctataccctttaaactttttgtttcaatcggcactccaataacTGGTTGCATCATTAACGACGCTAcc > 1:3573924‑M1/67‑91 (MQ=255) aaGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTAcc < 2:3271748/91‑1 (MQ=255) tgaacaattgataataaagaatctataccctttaaactttttgtttcaatcggcactccaataacTGGTTGCATCATTAACGACGCTACCa > 2:263814‑M1/66‑91 (MQ=255) tgaacaattgataataaagaatctataccctttaaactttttgtttcaatcggcactccaataacTGGTTGCATCATTAACGACGCTACCa > 1:2121135‑M1/66‑91 (MQ=255) aGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCa < 2:1976960/91‑1 (MQ=255) cGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGt > 1:250600/1‑91 (MQ=255) aacgattgagaataaagaatctataccctttaaactttttgtttcaatcggcactccaataacTGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGt > 1:3485659‑M1/64‑91 (MQ=255) agagaAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTa < 1:858886/91‑1 (MQ=255) agaAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTAtt > 2:3656789/1‑91 (MQ=255) agaAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGACACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTAtt > 2:2997356/1‑91 (MQ=255) gaAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTg < 1:269339/91‑1 (MQ=255) gaAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTg > 1:3283471/1‑91 (MQ=255) gaAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGAGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCACCATTAACGACGCTACCAGTTATTg > 2:3598714/1‑91 (MQ=255) aaaGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTgg < 2:850616/91‑1 (MQ=255) aaaGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTgg < 1:3745874/91‑1 (MQ=255) aaaGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTgg > 2:1382359/1‑91 (MQ=255) agagGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAg > 1:2291282/1‑91 (MQ=255) gagGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGt < 1:344644/91‑1 (MQ=255) gagGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGt < 2:2984683/91‑1 (MQ=255) gagGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGt < 1:2149562/91‑1 (MQ=255) gagGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGt < 2:2085731/91‑1 (MQ=255) agGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTg < 2:245802/91‑1 (MQ=255) gTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGcc > 1:1079572/1‑91 (MQ=255) gTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGcc > 1:3014767/1‑91 (MQ=255) gTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGCTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGcc > 2:3064742/1‑91 (MQ=255) taAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGAt > 2:794127/1‑91 (MQ=255) taAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGAt > 2:2323575/1‑91 (MQ=255) taAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGAt > 1:2948593/1‑91 (MQ=255) taAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGAt > 2:906119/1‑91 (MQ=255) aaCATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTg > 1:603486/1‑91 (MQ=255) ttATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAAc > 2:1071474/1‑91 (MQ=255) aTCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACaa > 1:3819843/1‑91 (MQ=255) aTCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACaa > 1:1617384/1‑91 (MQ=255) aTCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACaa > 1:3637968/1‑91 (MQ=255) tCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACaaa < 2:710040/91‑1 (MQ=255) 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gcTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAgg > 1:573793/1‑91 (MQ=255) gcTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAgg > 2:1750786/1‑91 (MQ=255) cTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAggg < 1:1106931/91‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAggg < 1:2569403/91‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAggg < 2:2928849/91‑1 (MQ=255) cGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGCATGAAACAAACAGTTTAGAGGGtata > 2:3366079/1‑91 (MQ=255) ggTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTAACAGTTATTGGAGTGAAGATTGAAAAAAAAAGTTTAAAGGGTATAg < 2:157732/91‑1 (MQ=255) cGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTc < 2:1823203/91‑1 (MQ=255) 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ttACCAGGTATTGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCTATTTAAACAAAAAGTTTATTGGGTATAGATTCTTtattat < 1:1154750/91‑1 (MQ=255) ttACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTtattat < 2:3313294/91‑1 (MQ=255) aCCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTTATTATCa > 2:2807246/1‑91 (MQ=255) aCCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTTATTATCa < 1:2299347/91‑1 (MQ=255) ccAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAGACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTTATTATCaa > 2:2406158/1‑91 (MQ=255) ccAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTTATTATCaa > 2:1365948/1‑91 (MQ=255) ccAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTTATTATCaa > 1:2303636/1‑91 (MQ=255) taacTGGTAGCGTCGTTAATGATGCAACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTTATTATCAATTg < 1:3084869‑M1/87‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |