New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1149564 = | 166 (0.870) | 10 (0.060) | 7/142 | NT | 6.5% | intergenic (+150/+21) | pheT_1/rnhC | Phenylalanine‑‑tRNA ligase beta subunit/Ribonuclease HIII |
? | USA300TCH1516_ALE | 1149598 = | 139 (0.820) | coding (926/939 nt) | rnhC | Ribonuclease HIII |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
TTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGAAATGGTATCTAAA > USA300TCH1516_ALE/1149474‑1149654 | cgccaaaattataaaaaaatacggtctttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaatttta > 1:391893‑M1/91‑91 (MQ=255) cgccaaaattataaaaaaatacggtctttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaatttta > 1:1048279‑M1/91‑91 (MQ=255) cgccaaaattataaaaaaatacggtctttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaatttta < 2:2360101‑M1/1‑1 (MQ=255) cgccaaaattataaaaaaatacggtctttcacgtttagaaaaaattacaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaatttta > 2:642845‑M1/91‑91 (MQ=255) ccaaaattataaaaaaatacggtctttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaattttaaa < 2:858360‑M1/3‑1 (MQ=255) aTTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATaaaa < 1:3120669/91‑1 (MQ=255) aTTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATaaaa < 1:644101/91‑1 (MQ=255) aTTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATaaaa > 1:3144078/1‑91 (MQ=255) tttttGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAg > 1:3325158/1‑91 (MQ=255) aaaattataaaaaaatacggtctttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaattttAAAGc > 1:1819211‑M1/87‑91 (MQ=255) aaattataaaaaaatacggtctttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaattttAAAGcc < 1:860251‑M1/6‑1 (MQ=255) ttGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCct < 2:3244575/91‑1 (MQ=255) ttGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCct < 2:490768/91‑1 (MQ=255) aattataaaaaaatacggtctttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaattttAAAGCct > 2:1503318‑M1/85‑91 (MQ=255) aattataaaaaaatacggtctttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaattttAAAGCct > 2:712871‑M1/85‑91 (MQ=255) tGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCctc > 2:93405/1‑91 (MQ=255) attataaaaaaatacggtctttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaattttAAAGCctc < 1:271281‑M1/8‑1 (MQ=255) attataaaaaaatacggtctttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaattttAAAGCctc > 1:3352480‑M1/84‑91 (MQ=255) ttataaaaaaatacggtctttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaattttAAAGCctct > 1:161272‑M1/83‑91 (MQ=255) ttataaaaaaatacggtctttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaattttAAAGCctct < 2:102488‑M1/9‑1 (MQ=255) ttataaaaaaatacggtctttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaattttAAAGCctct > 2:368589‑M1/83‑91 (MQ=255) ttCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAAt > 1:513125/1‑91 (MQ=255) cACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGa < 1:815115/91‑1 (MQ=255) cACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGa < 1:2229593/91‑1 (MQ=255) aaaaatacggtctttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaattttAAAGCCTCTAATGAt > 2:223016‑M1/77‑91 (MQ=255) aCCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGAt < 1:2642833/91‑1 (MQ=255) aCCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGAt < 2:1730446/91‑1 (MQ=255) aCCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGAt > 1:1373506/1‑91 (MQ=255) ccAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGAtt > 1:712993/1‑91 (MQ=255) cAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTa < 2:2778625/91‑1 (MQ=255) aTTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTaaa > 1:1678255/1‑91 (MQ=255) tttGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCCAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTaaaa > 2:2215164/1‑91 (MQ=255) tttGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTaaaa > 1:2367274/1‑91 (MQ=255) tttGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTaaaa > 1:2366513/1‑91 (MQ=255) tttGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTaaaa > 2:1407807/1‑91 (MQ=255) ttgggTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAATCCTCTAATGATTaaaa < 1:1554591/88‑1 (MQ=255) ggTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATc < 2:1172913/91‑1 (MQ=255) gTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCa > 1:1703731/1‑91 (MQ=255) gTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACAGCATAAAAGCCACTAATGATTAAAAATCa > 2:3044892/1‑91 (MQ=255) tttcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaattttAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAag > 1:683283‑M1/65‑91 (MQ=255) ccAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAag > 2:3656781/1‑91 (MQ=255) cAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAaga > 1:352707/1‑91 (MQ=255) tcacgtttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaattttAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAagag > 2:1247573‑M1/63‑91 (MQ=255) aaTGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTGAAAATCAAagag < 2:3325158/91‑1 (MQ=255) aTGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAGAATCAAAGAgg > 1:3760008/1‑91 (MQ=255) tttagataccatttcaaaaaagcattttaaaaatcgtgaaaaagcccaaaaaattttAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCttt > 2:144750‑M1/58‑91 (MQ=255) aTTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCttt < 1:2052466/91‑1 (MQ=255) aTTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCttt < 1:2216308/91‑1 (MQ=255) ttAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTaa > 1:1426837/1‑91 (MQ=255) aaaaGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAAt > 2:340936/1‑91 (MQ=255) aaaaGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAAt > 2:1007200/1‑91 (MQ=255) aaaGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAAtt > 2:1127433/1‑91 (MQ=255) aaaGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAAtt > 2:2032500/1‑91 (MQ=255) aaGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAAttt < 2:2560266/91‑1 (MQ=255) gTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAAttttt > 1:363605/1‑91 (MQ=255) cAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTg < 1:2700408/91‑1 (MQ=255) cAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTg < 1:2383389/91‑1 (MQ=255) cAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTg > 2:745578/1‑91 (MQ=255) cAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTg > 2:660599/1‑91 (MQ=255) cAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTGTTTg > 1:3229803/1‑91 (MQ=255) aaaGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTgg < 2:776238/91‑1 (MQ=255) aaaGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTgg > 2:538499/1‑91 (MQ=255) aaGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTggg < 1:1104250/91‑1 (MQ=255) aaGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTggg > 1:1595997/1‑91 (MQ=255) ggAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCttt > 1:3075817/1‑91 (MQ=255) aaCAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCttttt > 1:1298274/1‑91 (MQ=255) aCAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTc < 2:1924354/91‑1 (MQ=255) cAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCa > 2:1150556/1‑91 (MQ=255) cAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCa > 2:1639777/1‑91 (MQ=255) aGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCAc < 1:1148941/91‑1 (MQ=255) aGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCAc > 2:2423348/1‑91 (MQ=255) gCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACg < 2:3152605/91‑1 (MQ=255) aaTACAGATGATGCTACGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGAttt < 1:744125/91‑1 (MQ=255) cAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTaa < 1:2903601/91‑1 (MQ=255) aGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTaaa < 2:3535238/91‑1 (MQ=255) aGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTaaa < 2:2666165/91‑1 (MQ=255) gatgatGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTaaaa > 1:1003907/1‑91 (MQ=255) gatgatGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTaaaa < 2:1991005/91‑1 (MQ=255) atgatgCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAAt < 1:1506844/91‑1 (MQ=255) gatgCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGc > 1:102488/1‑91 (MQ=255) gCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCttt < 1:943677/91‑1 (MQ=255) cTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCtttt < 2:2367274/91‑1 (MQ=255) ttCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCttttt > 1:284694/1‑91 (MQ=255) cGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCttttttt > 2:249363/1‑90 (MQ=255) cGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTg > 2:3728613/1‑91 (MQ=255) cGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTg > 1:403533/1‑91 (MQ=255) gCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGa < 1:1724081/91‑1 (MQ=255) cacaACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGaa < 1:1471885/91‑1 (MQ=255) cacaACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGaa < 1:436001/91‑1 (MQ=255) aaCTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGAAATg < 1:239343/91‑1 (MQ=255) aaCTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGAAATg > 1:1430708/1‑91 (MQ=255) cTGCATAAAAGCATCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGAAATGGt > 1:2971554/1‑91 (MQ=255) tGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGAAATGGTa < 2:62406/91‑1 (MQ=255) tGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGAAATGGTa < 2:1760759/91‑1 (MQ=255) tGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGAAATGGTa > 2:899049/1‑91 (MQ=255) tAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGAAATGGTATc > 2:3771502/1‑89 (MQ=255) tAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGAAATGGTATCTa > 1:1186696/1‑91 (MQ=255) tAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGAAATGGTATCTa < 1:1808933/91‑1 (MQ=255) tAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGAAATGGTATCTa > 2:237160/1‑91 (MQ=255) tAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTACACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGAAATGGTATCTa > 2:3831110/1‑91 (MQ=255) | TTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATGATTAAAAATCAAAGAGGCTTTAAAATTTTTTGGGCTTTTTCACGATTTTTAAAATGCTTTTTTGAAATGGTATCTAAA > USA300TCH1516_ALE/1149474‑1149654 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |