| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1361481 | 142 (0.750) | 22 (0.130) | 12/140 | NT | 12.8% | intergenic (+20/+273) | USA300HOU_RS06765/USA300TCH1516_01271 | Putative phosphatase/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1361509 | 176 (1.060) | intergenic (+48/+245) | USA300HOU_RS06765/USA300TCH1516_01271 | Putative phosphatase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
AATATGCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACAT > USA300TCH1516_ALE/1361391‑1361571 | aaTATGCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAAC < 1:2840274‑M1/91‑1 (MQ=255)aaTATGCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAAC > 2:3019759‑M1/1‑91 (MQ=255) atatGCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAaca > 1:496540/1‑91 (MQ=255) atatGCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAaca < 2:2706653/91‑1 (MQ=255) tatGCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAacac < 1:3711060/91‑1 (MQ=255) tatGCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAacac < 1:2596813/91‑1 (MQ=255) tatGCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAacac < 2:3249490/91‑1 (MQ=255) tatGCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAacac < 1:2017049/91‑1 (MQ=255) atGCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAAcaca > 1:1594773/1‑91 (MQ=255) gCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATg < 2:1880439/91‑1 (MQ=255) cAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGa < 2:3664911/91‑1 (MQ=255) aTGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGatat < 1:1452076/91‑1 (MQ=255) gAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATAttt > 1:2687906/1‑91 (MQ=255) gTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGaa > 2:754160/1‑91 (MQ=255) gTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGaa < 2:3633999/91‑1 (MQ=255) gTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGaa > 1:1368907/1‑91 (MQ=255) ttACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAAt > 2:575725/1‑91 (MQ=255) tACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATa > 2:3870844/1‑91 (MQ=255) ttGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGat < 1:1466390/91‑1 (MQ=255) tCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCtt < 1:2485831/91‑1 (MQ=255) tCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATACTTGAATAAGATATCtt > 2:2980848/1‑91 (MQ=255) aaTGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGg < 1:718702‑M2/91‑2 (MQ=255) gAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgtta < 1:717952‑M1/91‑33 (MQ=255) gAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgtta < 2:1039624‑M1/91‑33 (MQ=255) aaaTGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaag < 1:2073886‑M1/91‑35 (MQ=255) aaaTGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaag < 2:2546268‑M2/91‑7 (MQ=255) aaTGGTATTCCACATGCGCTCAAAAGATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaagg < 2:3362329‑M1/91‑36 (MQ=255) tGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggct < 1:1270735‑M2/91‑10 (MQ=255) tGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggct < 2:2586197‑M2/91‑10 (MQ=255) ggTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggctt > 2:2785672‑M2/1‑81 (MQ=255) ggTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggctt > 1:1128397‑M2/1‑81 (MQ=255) gTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggctta < 2:2084354‑M1/91‑40 (MQ=255) gTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggctta < 2:2083192‑M1/91‑40 (MQ=255) gTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggctta < 2:426214‑M1/91‑40 (MQ=255) gTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCttt < 1:2422065/91‑1 (MQ=255) tATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCtttt < 1:3503288/91‑1 (MQ=255) aTTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGACATCTTGTGGTTAAGGCttttt > 2:16117/1‑91 (MQ=255) ttCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTa > 2:676021/1‑91 (MQ=255) ttCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTa < 2:3085402/91‑1 (MQ=255) ccACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtt > 1:631973/1‑91 (MQ=255) cacaTTCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaa < 2:3578240‑M1/91‑46 (MQ=255) cacaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaa < 1:1055136‑M1/91‑46 (MQ=255) cacaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaa < 2:3373762‑M1/91‑46 (MQ=255) cacaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACACGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAttt > 2:3413948/1‑91 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt < 1:902855/91‑1 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt < 1:2828382/91‑1 (MQ=255) aTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTtg < 1:1676565/91‑1 (MQ=255) aTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTtg < 2:1641699/91‑1 (MQ=255) tGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTtgt > 1:3387716/1‑91 (MQ=255) tGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTtgt > 1:833251/1‑91 (MQ=255) tGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTtgt < 2:2139982/91‑1 (MQ=255) cgcTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGa > 1:2281263/1‑91 (MQ=255) cgcTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGa < 1:3539494/91‑1 (MQ=255) gcTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGaa < 2:1032303/91‑1 (MQ=255) cAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAAt > 2:3768838/1‑91 (MQ=255) cAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAAt > 1:240926/1‑91 (MQ=255) aaaaaaTTGTTATAAATTTTAAAATCAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATg < 1:3621412/91‑1 (MQ=255) aaaaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGa < 2:2667369/91‑1 (MQ=255) aaaaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGa > 1:1018730/1‑91 (MQ=255) aTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTc < 2:3280013/91‑1 (MQ=255) tGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAg < 1:3671375/91‑1 (MQ=255) tGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAg > 1:2098655/1‑91 (MQ=255) tGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAg > 2:868117/1‑91 (MQ=255) tGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAg < 2:3519439/91‑1 (MQ=255) gTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGt < 2:910964/91‑1 (MQ=255) tataAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTta > 1:3839627/1‑91 (MQ=255) ataAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGACAATGACTTCAGTtat > 2:203095/1‑91 (MQ=255) ataAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTtat > 2:2183824/1‑91 (MQ=255) aaTTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACt < 2:1464945/91‑1 (MQ=255) aTTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTa < 1:2133517/91‑1 (MQ=255) ttttAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatg < 1:1252162‑M1/91‑73 (MQ=255) ttttAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATAACTTCAGTTATACTAt > 2:2227275/1‑91 (MQ=255) tttAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATg < 1:1623106/91‑1 (MQ=255) tttAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATg < 2:1594773/91‑1 (MQ=255) ttAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtg < 1:3818589‑M2/91‑47 (MQ=255) aaTAGGCCTTAACACATGGTATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggagga < 2:1629527/91‑1 (MQ=255) aaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcgtgtggaat < 2:273019‑M2/91‑51 (MQ=255) aaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggagga < 1:1173560/91‑1 (MQ=255) aaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggagga > 1:2950427/1‑91 (MQ=255) aaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggagga < 2:3173820/91‑1 (MQ=255) aaGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaatacc > 2:829158‑M1/1‑10 (MQ=255) aaGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGAttt > 1:3157892/1‑91 (MQ=255) aaGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGAttt > 2:2291295/1‑91 (MQ=255) aGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaatacca < 2:3312939‑M1/91‑83 (MQ=255) aGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaatacca < 2:2930992‑M1/91‑83 (MQ=255) aGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaatacca < 2:2330992‑M1/91‑83 (MQ=255) cTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccattt < 2:3408155‑M1/91‑86 (MQ=255) cTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGaaa > 2:3128468/1‑91 (MQ=255) cTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGaaa < 1:1922577/91‑1 (MQ=255) ttAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccatttt < 2:263832‑M1/91‑87 (MQ=255) ttAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccatttt < 1:1738884‑M2/91‑59 (MQ=255) ttAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccatttt < 1:2002525‑M2/91‑59 (MQ=255) gtAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTCAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAAt < 2:3834356/90‑1 (MQ=255) tAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccattttc < 1:1597616‑M1/91‑88 (MQ=255) tAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccattttc < 2:565719‑M1/91‑88 (MQ=255) tAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATa < 2:943936/91‑1 (MQ=255) aaCACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGTTTTGAAATAc > 2:1271158/1‑91 (MQ=255) aaCACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATAc > 2:1271980/1‑91 (MQ=255) cacaTGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACat > 2:1547290/1‑91 (MQ=255) cacaTGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACat < 1:2220881/91‑1 (MQ=255) | AATATGCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACAT > USA300TCH1516_ALE/1361391‑1361571 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |