| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1662000 = | 222 (1.170) | 28 (0.170) | 19/136 | NT | 14.3% | intergenic (‑87/+68) | USA300HOU_RS08275/rpmG2_2 | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase/50S ribosomal protein L33 2 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1662039 = | 146 (0.900) | intergenic (‑126/+29) | USA300HOU_RS08275/rpmG2_2 | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase/50S ribosomal protein L33 2 | |||||
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
TCATTATGTTGTCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAG > USA300TCH1516_ALE/1661910‑1662090 | gaaatgaagaaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataaa < 2:300861‑M1/2‑1 (MQ=255) gaaatgaagaaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataaa > 1:3417303‑M1/90‑91 (MQ=255) aaatgaagaaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataaaa > 1:526512‑M1/89‑91 (MQ=255) ttATGTTGTCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTaaaa < 1:359458/91‑1 (MQ=255) ttATGTTGTCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTaaaa < 2:1364673/91‑1 (MQ=255) atgaagaaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataaaaaa < 2:1423675‑M1/5‑1 (MQ=255) atgaagaaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataaaaaa < 1:3523494‑M1/5‑1 (MQ=255) tgaagaaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAg > 2:2654627‑M1/86‑91 (MQ=255) tgttgtCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAgg < 1:3867343/91‑1 (MQ=255) tgttgtCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCCTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAgg > 2:3232169/1‑91 (MQ=255) gttgtCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGt < 2:800219/91‑1 (MQ=255) gttgtCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGt > 1:2550468/1‑91 (MQ=255) aagaaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGt > 2:370696‑M1/84‑91 (MQ=255) ttgtCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTg > 2:1038217/1‑91 (MQ=255) agaaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTg > 1:298628‑M1/83‑91 (MQ=255) tgtCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATTATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGa > 1:2348829/1‑91 (MQ=255) gaaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGa < 1:2734097‑M1/10‑1 (MQ=255) gaaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAACGTGa < 1:3232169‑M1/10‑1 (MQ=255) gtCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGaa > 1:3281494/1‑91 (MQ=255) aaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGaa < 2:2835477‑M1/11‑1 (MQ=255) aaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGaa > 2:610335‑M1/81‑91 (MQ=255) atgatgAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAAcc < 2:3317938/91‑1 (MQ=255) atgatgAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAAcc > 1:1259203/1‑91 (MQ=255) tgatgaATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACct > 1:1139737/1‑91 (MQ=255) gatgaATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACctc < 2:2414574/91‑1 (MQ=255) gatgaATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACctc < 2:556435/91‑1 (MQ=255) gatgaATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACctc > 1:3038770/1‑91 (MQ=255) gatgaATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGAATAAATAAAAAGGTGAAACctc < 2:2753026/91‑1 (MQ=255) tgaATTATGCGACAATTCTAAAAGTTATTATTTGAATCGAAAATCTCTTATCATTTCATGCGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCtt > 1:3096518/1‑91 (MQ=255) aaTTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCTTAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTAt > 1:3623670/1‑91 (MQ=255) aaTTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTAt > 2:1935592/1‑91 (MQ=255) aaTTATGAGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTAt < 2:3447672/91‑1 (MQ=255) aTTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTAtt > 2:3013401/1‑91 (MQ=255) tATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTAtttt > 2:1509558/1‑91 (MQ=255) tATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTAtttt < 1:2107222/91‑1 (MQ=255) gtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTg > 1:2812109‑M1/68‑91 (MQ=255) aTGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTg < 2:3451646/91‑1 (MQ=255) gCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTgag < 1:3405548/91‑1 (MQ=255) gACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGAt < 1:563982/91‑1 (MQ=255) cAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGAttt < 1:3757889/91‑1 (MQ=255) cAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGAttt > 2:764254/1‑91 (MQ=255) acaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGAttt > 1:651848‑M1/62‑91 (MQ=255) ttCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCAc < 1:558270/91‑1 (MQ=255) ttCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCAc > 2:3528724/1‑91 (MQ=255) tCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCAcc < 2:1015363/91‑1 (MQ=255) caaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCt > 2:892448‑M1/57‑91 (MQ=255) tAAGATGTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCtt < 2:1236805/91‑1 (MQ=18) aaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCtt > 2:3875231‑M1/56‑91 (MQ=255) aaaaTTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCttt < 2:47323/91‑1 (MQ=21) aaaaTTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCttt < 2:1685726/91‑1 (MQ=255) aTTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCtttttt > 2:2102030/1‑91 (MQ=255) ttattTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGt > 1:2626064/1‑91 (MQ=255) ttattTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGt > 1:1027407/1‑91 (MQ=255) gattTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGCGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGtt < 2:3834551/90‑1 (MQ=255) cgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaattAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTa > 2:2179395‑M1/45‑91 (MQ=255) attTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTa < 1:1060438/91‑1 (MQ=255) tttCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATAAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaa > 1:2486456/1‑91 (MQ=255) ttCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaat > 1:1105371/1‑91 (MQ=255) aaTTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaattta > 1:1175049/1‑91 (MQ=255) aTTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaa > 1:873576/1‑91 (MQ=255) aTTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaa < 2:3573683/91‑1 (MQ=255) aTTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaa > 1:680557/1‑91 (MQ=255) gAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaaatt < 2:3141417/91‑1 (MQ=255) aaataatcattaaaattaaatttaaattaacaattAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaaatt > 1:1724834‑M1/36‑91 (MQ=255) aaaaTCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaaattt < 1:1609320/91‑1 (MQ=255) aaaaTCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaaattt > 2:1993542/1‑91 (MQ=255) taatcattaaaattaaatttaaattaacaattAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAatttaaatttaa > 1:2031165‑M1/33‑91 (MQ=255) aaTCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAatttaaatttaa > 1:2867698/1‑91 (MQ=255) tCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAaatttaatt < 2:968846/91‑1 (MQ=255) tCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAaatttaatt < 2:3585394/91‑1 (MQ=255) cTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAaatttaattt > 1:1937055/1‑91 (MQ=255) ttttATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAAtttaatttt > 2:3879144/1‑91 (MQ=255) tttATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAAtttaatttta < 1:777242/91‑1 (MQ=255) ttATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAAtttaattttaa > 1:1874030/1‑91 (MQ=255) aTCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATg < 1:1462817/91‑1 (MQ=255) tCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGa < 1:910072/91‑1 (MQ=255) cATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTATTAATTTAAATTTAATTTTAATGat > 1:3617205/1‑91 (MQ=255) aattaaatttaaattaacaattAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTGACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGat > 2:2237497‑M1/23‑91 (MQ=255) aTTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGatt > 1:816205/1‑91 (MQ=255) ttCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGattat > 2:2777169/1‑91 (MQ=255) tCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTCATGattatt > 1:3717610/1‑91 (MQ=255) cATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTAttt < 2:1133211/91‑1 (MQ=255) cATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTAttt < 2:1892494/91‑1 (MQ=255) cATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTAttt > 1:2399911/1‑91 (MQ=255) tACGTGTGCCTAATTAAAAAGGTGAAACCTCTCATTTTGAGATTTCACCTCTTTTATTGTTCCTTTAAATTTAATTCTACTGATTTTTTTg > 2:3650956/1‑91 (MQ=255) tACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTg < 1:1810303/91‑1 (MQ=255) aCGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGt > 1:2277978/1‑91 (MQ=255) aCGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGt < 1:1376090/91‑1 (MQ=255) cGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGtt > 2:2806101/1‑91 (MQ=255) tgCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCAc > 2:1745406/1‑91 (MQ=255) gCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACg < 2:2048884/91‑1 (MQ=255) aacaataAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACgg < 2:3374560‑M1/84‑1 (MQ=255) tAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGgtg > 2:1549143/1‑91 (MQ=255) aaTTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGgtgt < 2:2156705/91‑1 (MQ=255) aaTTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGgtgt < 2:680557/91‑1 (MQ=255) ttAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTaa > 1:3823156/1‑91 (MQ=255) ttAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTaa < 1:1347579/91‑1 (MQ=255) AAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAg < 1:2884924‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAg < 2:2560293‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAACTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAg < 2:3830886‑M1/91‑1 (MQ=255) | TCATTATGTTGTCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAG > USA300TCH1516_ALE/1661910‑1662090 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |