| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1662000 = | 222 (1.170) | 28 (0.170) | 19/136 | NT | 14.3% | intergenic (‑87/+68) | USA300HOU_RS08275/rpmG2_2 | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase/50S ribosomal protein L33 2 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1662039 = | 146 (0.900) | intergenic (‑126/+29) | USA300HOU_RS08275/rpmG2_2 | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase/50S ribosomal protein L33 2 | |||||
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
ATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTTCAA > USA300TCH1516_ALE/1661949‑1662129 | aTTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCtttttt > 2:2099160/1‑91 (MQ=255)aTTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCtttttt > 1:2618350/1‑91 (MQ=255) tttATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTa > 2:2178464/1‑91 (MQ=255) ttattaTTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTAt > 1:1251362/1‑91 (MQ=255) tattatTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTAtt > 2:136353/1‑91 (MQ=255) ttattTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGt > 1:1027407/1‑91 (MQ=255) ttattTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGt > 1:944714/1‑91 (MQ=255) cccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataaaaaaggtgaaacctcttattttgagatttcacctttttTATTGt < 2:3042886‑M2/6‑1 (MQ=255) gattTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGCGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGtt < 2:3834551/90‑1 (MQ=255) ccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataaaaaaggtgaaacctcttattttgagatttcacctttttTATTGtt < 2:511773‑M2/7‑1 (MQ=255) cgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaattAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTa > 2:2179534‑M1/45‑91 (MQ=255) attTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTa < 1:1060438/91‑1 (MQ=255) tttCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaa < 1:3010501/91‑1 (MQ=255) tttCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATAAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaa > 1:2486456/1‑91 (MQ=255) gtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaattAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaa > 1:1854038‑M1/44‑91 (MQ=255) tCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatt < 1:1737348/91‑1 (MQ=255) tCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatt > 2:885613/1‑91 (MQ=255) aTTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaa > 1:680557/1‑91 (MQ=255) aTTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaa < 2:3573683/91‑1 (MQ=255) tGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaaat < 2:1626074/91‑1 (MQ=255) gAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaaatt < 2:3141417/91‑1 (MQ=255) aaataatcattaaaattaaatttaaattaacaattAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaaatt > 1:1724834‑M1/36‑91 (MQ=255) aaTCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAatttaaatttaa > 1:2867698/1‑91 (MQ=255) aaTCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAatttaaatttaa > 1:2881197/1‑91 (MQ=255) aTCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAaatttaat > 2:1174188/1‑91 (MQ=255) tCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAaatttaatt < 2:2662169/91‑1 (MQ=255) tCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAaatttaatt < 2:3585394/91‑1 (MQ=255) atcattaaaattaaatttaaattaacaataaaaaaggtcaaatctcaaaataagaggtttcacctttttAATTGTTAATTTAaatttaatt > 2:2237497‑M2/70‑91 (MQ=255) cTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAaatttaattt > 2:1045718/1‑91 (MQ=255) cTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAaatttaattt > 1:1937055/1‑91 (MQ=255) ttttATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAAtttaatttt > 2:3878151/1‑91 (MQ=255) tttATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAAtttaatttta < 1:777242/91‑1 (MQ=255) tATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAAtttaattttaat > 1:2667691/1‑91 (MQ=255) tATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGATGAAACCACTTATTTTGAGATTTCACCTTATTTATTGTTAATTTAAAtttaattttaat > 2:3664273/1‑91 (MQ=255) cATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTATTAATTTAAATTTAATTTTAATGat > 1:3617210/1‑91 (MQ=255) aattaaatttaaattaacaattAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGat > 2:2236993‑M1/23‑91 (MQ=255) aTTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGatt > 1:662393/1‑91 (MQ=255) ttaaatttaaattaacaataaaaaaggtgaaatctcaaaataagaggtttcacctttttAATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGatta > 1:2030263‑M2/60‑91 (MQ=255) ttCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGattat < 1:3528724/91‑1 (MQ=255) ttCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGattat > 1:3721080/1‑91 (MQ=255) ttCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGattat > 1:2089960/1‑91 (MQ=255) cATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTAttt > 1:2399911/1‑91 (MQ=255) cATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTAttt < 2:1892494/91‑1 (MQ=255) aCGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGt > 1:887303/1‑91 (MQ=255) aCGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGt > 1:3252575/1‑91 (MQ=255) cGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGtt > 1:1423675/1‑91 (MQ=255) cGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGtt > 2:2806101/1‑91 (MQ=255) tgtgCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTc > 1:855230/1‑91 (MQ=255) tgtgCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTc > 1:3847537/1‑91 (MQ=255) aattaacaataaaaaaggtgaaatctcaaaataagaggtttcacctttttAATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTc > 2:916215‑M2/51‑91 (MQ=255) ttaacaataaaaaaggtgaaatctcaaaataagaggtttcacctttttAATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCAc > 1:1854958‑M2/49‑91 (MQ=255) tgCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGatt < 1:3211762/79‑1 (MQ=255) tgCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCAc < 1:1133995/91‑1 (MQ=255) tgCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCAc < 1:1366714/91‑1 (MQ=255) tcATAATTTAAAAGCTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCTCCTTTTTTATTGTTAATTTAAGTTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACg < 2:3370599/90‑1 (MQ=255) gCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACg < 2:1937055/91‑1 (MQ=255) aTAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGgt < 2:2472001/91‑1 (MQ=255) aTAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGgt > 1:576865/1‑91 (MQ=255) tAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGgtg > 2:1549143/1‑91 (MQ=255) tAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGgtg > 2:3536261/1‑91 (MQ=255) aaTTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGgtgt < 2:2156705/91‑1 (MQ=255) aaTTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGgtgt < 2:680557/91‑1 (MQ=255) aTTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTa > 1:3759893/1‑91 (MQ=255) ttAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTaa < 1:1347579/91‑1 (MQ=255) ttAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTaa < 2:373003/91‑1 (MQ=255) taaaaaaggtgaaatctcaaaataagaggtttcacctttttTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTaa > 1:2707091‑M2/42‑91 (MQ=255) AAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAg < 2:2560293‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgt < 2:1732458‑M1/91‑1 (MQ=255) aatgTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgttt < 2:3494924/88‑1 (MQ=255) aaggtgaaatctcaaaataagaggtttcacctttttTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgttt > 2:3875200‑M2/37‑91 (MQ=255) AAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgttt > 1:2324442‑M1/1‑91 (MQ=255) AAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgttt < 2:2052169‑M1/91‑1 (MQ=255) AGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgtttg > 1:1567201‑M1/1‑91 (MQ=255) GTGAAACCTCTTGTTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgtttgtt > 2:3227772‑M1/1‑91 (MQ=255) GTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgtttgtt > 1:190726‑M1/1‑91 (MQ=255) TGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgtttgttt < 1:388495‑M1/91‑1 (MQ=255) aaaaCCTCTTATTTTAAGATTTCACCTTTTTTATTTTTAATTTAAATTTAATTTTAATTATTATTTTCTTTCACAGTTTAAAatttttttt < 2:361528/90‑2 (MQ=255) GAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgtttgtttg > 2:668976‑M1/1‑91 (MQ=255) GAAACCTCTTAGTTTGAGATTTCGCCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgtttgtttg > 2:2959898‑M1/1‑91 (MQ=255) AAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgtttgtttgt > 2:3656501‑M1/1‑91 (MQ=255) AAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgtttgtttgt > 1:3445300‑M1/1‑91 (MQ=255) aatctcaaaataagaggtttcacctttttTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgtttgtttgtt > 1:2422628‑M2/30‑91 (MQ=255) ACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTCTTTTGTTTCACGGTGTAAAgtttgtttgttt < 2:458627‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgtttgtttgttt < 2:2113071‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAgtttgtttgttt < 2:139470‑M1/91‑1 (MQ=255) ccTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGtttt > 1:1643099/1‑91 (MQ=255) ctctTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTc < 2:913180/91‑1 (MQ=255) ctcaaaataagagccttcacctttctTTTTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTCTTTCACGGTGTAACGTTTGTTTGTTTTc > 2:598376‑M2/27‑91 (MQ=255) tcaaaataagaggtttcacctttttTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCa > 1:2766476‑M2/26‑91 (MQ=255) caaaataagaggtttcacctttttTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCAc > 2:2032843‑M2/25‑91 (MQ=255) aTTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCCCGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTg > 2:781994/1‑91 (MQ=255) tttGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGaa > 2:3641254/1‑91 (MQ=255) ttGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTCAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAAc < 2:3412221/91‑1 (MQ=255) tGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACa < 1:3395571/91‑1 (MQ=255) gagaTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAg > 1:712250/1‑91 (MQ=255) gagaTTTCACCTATTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAg > 1:2978705/1‑91 (MQ=255) ttcacctttttTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAAttt < 2:2764773‑M2/80‑1 (MQ=255) ttcacctttttTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAAttt < 2:2835477‑M2/80‑1 (MQ=255) cctttttTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATttcttc > 1:1609390‑M2/8‑91 (MQ=255) ttTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTTc < 2:300861‑M2/89‑1 (MQ=255) | ATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTTCAA > USA300TCH1516_ALE/1661949‑1662129 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |