| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2270512 = | 168 (0.880) | 14 (0.080) | 9/144 | NT | 9.0% | intergenic (‑155/+77) | ylmA/glmS | putative ABC transporter ATP‑binding protein YlmA/Glutamine‑‑fructose‑6‑phosphate aminotransferase [isomerizing] |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2270545 = | 133 (0.780) | intergenic (‑188/+44) | ylmA/glmS | putative ABC transporter ATP‑binding protein YlmA/Glutamine‑‑fructose‑6‑phosphate aminotransferase [isomerizing] | |||||
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
ATTGTCAGACTATTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAATTATTCCACAGTAA > USA300TCH1516_ALE/2270422‑2270602 | tgttgataaaccacgtaaccttgctaaatcagttactgtggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgg < 1:2446679‑M1/1‑1 (MQ=255)aTTGTCAGACTATTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAg > 2:2665645/1‑91 (MQ=255) gttgataaaccacgtaaccttgctaaatcagttactgtggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgGc > 1:599478‑M1/90‑91 (MQ=255) ttgataaaccacgtaaccttgctaaatcagttactgtggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgGCa > 2:767623‑M1/89‑91 (MQ=255) ttgataaaccacgtaaccttgctaaatcagttactgtggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgGCa < 2:2504813‑M1/3‑1 (MQ=255) ttgataaaccacgtaaccttgctaaatcagttactgtggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgGCa > 2:122567‑M1/89‑91 (MQ=255) tGTCAGACTATTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCa > 1:983385/1‑91 (MQ=255) gTCAGACTATTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCAc > 1:3480832/1‑91 (MQ=255) gTCAGACTATTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCAc > 1:2035798/1‑91 (MQ=255) tCAGACTATTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCAcc < 2:806567/91‑1 (MQ=255) tCAGACTATTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCAcc > 1:554268/1‑91 (MQ=255) gataaaccacgtaaccttgctaaatcagttactgtggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgGCAcc > 2:3748008‑M1/87‑91 (MQ=255) gataaaccacgtaaccttgctaaatcagttactgtggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgGCAcc < 2:1641561‑M1/5‑1 (MQ=255) taaaccacgtaaccttgctaaatcagttactgtggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgGCACCCt < 1:2753042‑M1/7‑1 (MQ=255) taaaccacgtaaccttgctaaatcagttactgtggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgGCACCCt > 2:3423647‑M1/85‑91 (MQ=255) aGACTATTTAAATAAATAAAACACTTAATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCt > 2:2209833/1‑91 (MQ=255) gACTATTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCtt < 2:3198803/91‑1 (MQ=255) aCTATTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCttt < 1:2287049/91‑2 (MQ=255) cTATTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCt < 1:1199711/91‑1 (MQ=255) accacgtaaccttgctaaatcagttactgtggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatggcacccgttt < 1:3127511‑M1/10‑5 (MQ=255) tATTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTa > 1:339544/1‑91 (MQ=255) tATTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTa > 2:3328513/1‑91 (MQ=255) aTTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAg < 1:2994337/91‑1 (MQ=255) aTTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAg < 1:2625958/91‑1 (MQ=255) aTTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAg > 1:1809720/1‑91 (MQ=255) aTTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAg < 2:1792296/91‑1 (MQ=255) tttAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGt > 2:2021133/1‑91 (MQ=255) tttAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGt < 2:1807597/91‑1 (MQ=255) ataaataaaACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGAtt > 1:825813/1‑91 (MQ=255) ataaataaaACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGAtt > 1:1076961/1‑91 (MQ=255) ataaataaaACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGAtt > 2:1483624/1‑91 (MQ=255) aaataaaACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTaa > 1:2504813/1‑91 (MQ=255) taaaACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGGCCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCt < 2:3813859/91‑1 (MQ=255) taaaACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCt < 2:3659031/91‑1 (MQ=255) taaaACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCt < 2:2392380/91‑1 (MQ=255) ctaaatcagttactgtggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTa > 2:3158267‑M1/68‑91 (MQ=255) aaaaCACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTa < 1:878959/91‑1 (MQ=255) taaatcagttactgtggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTaa > 1:3763717‑M1/67‑91 (MQ=255) taaatcagttactgtggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTaa > 1:1746312‑M1/67‑91 (MQ=255) aaaCACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTaa < 1:3270476/91‑1 (MQ=255) aaaCACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTaa < 2:2896823/91‑1 (MQ=255) aaaCACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTaa < 2:2299751/91‑1 (MQ=255) acacTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTaaaa > 2:1675360/1‑91 (MQ=255) acacTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTaaaa > 1:1358605/1‑91 (MQ=255) ttCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGt > 2:2753042/1‑91 (MQ=255) cATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGc < 1:3086154/91‑1 (MQ=255) cATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGc > 1:1472470/1‑91 (MQ=255) cATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGc > 2:1094549/1‑91 (MQ=255) aTTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGcc < 1:3573010/91‑1 (MQ=255) aTTGTTACTCATTTCTGCCCAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGcc < 2:1365486/91‑1 (MQ=255) ttttACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCat < 2:2485447/91‑1 (MQ=255) ttttACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCat < 1:1314304/91‑1 (MQ=255) tttACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCata < 2:286961/91‑1 (MQ=255) ttACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCatat < 2:1023298/91‑1 (MQ=255) gtggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCatat > 1:2989023‑M1/54‑91 (MQ=255) tggaataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCAtata > 1:2191267‑M1/53‑91 (MQ=255) tACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGTAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCAtata > 2:1879900/1‑91 (MQ=255) aCGCACTTCTGCCACATTAAGACGAAGTAAAATCTAAGTTGACCTAAAAAAGCACACTTCTAGTCGATTAATCTAAACGGGTGCCATATAc > 2:1147804/1‑91 (MQ=255) gCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACtt > 1:945211/1‑91 (MQ=255) aataattcacttttttagaatcaatcatgtattaaaattagagtatatgGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACtt > 1:3297898‑M1/50‑91 (MQ=255) aTTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACttta < 1:2144694/91‑1 (MQ=255) gCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACtttaatttta > 1:2006631/1‑91 (MQ=255) gCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACtttaatttta < 2:1809720/91‑1 (MQ=255) gCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACtttaatttta < 2:1445678/91‑1 (MQ=255) cttttttagaatcaatcatgtattaaaattaaagtatatgGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACtttaattttaa > 1:1005048‑M1/41‑91 (MQ=255) aaTTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATAc < 2:1278124/91‑1 (MQ=255) ttAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACAt < 2:2308903/91‑1 (MQ=255) aaGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACAtga > 2:1087572/1‑91 (MQ=255) aaGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGAGTGCCATATACTTTAATTTTAATACAtga > 1:3118509/1‑91 (MQ=255) aGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACAtgat > 2:3868867/1‑91 (MQ=255) gATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACAtgatt > 2:579725/1‑91 (MQ=255) gATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACAtgatt < 1:108131/91‑1 (MQ=255) gATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACAtgatt > 1:1641561/1‑91 (MQ=255) gAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACAtgattgat < 1:2121765/91‑1 (MQ=255) aGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTc < 1:1585491/91‑1 (MQ=255) aGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTc > 1:1718653/1‑91 (MQ=255) aaaaGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTaa > 2:3236420/1‑91 (MQ=255) aaaaGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTaa < 2:3013512/91‑1 (MQ=255) aaaGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTaaa < 2:2118412/91‑1 (MQ=255) aaGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTaaaa < 1:1879900/91‑1 (MQ=255) cTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAg > 1:3416000/1‑91 (MQ=255) tAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGt > 1:1376188/1‑91 (MQ=255) ggaGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGt < 1:113267/89‑1 (MQ=255) aGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGa > 2:431657/1‑91 (MQ=255) aGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGa > 2:3483494/1‑91 (MQ=255) tCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAat < 2:2760402/91‑1 (MQ=255) cGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAatt < 2:7380/91‑1 (MQ=255) gACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAatta < 2:3557487/91‑1 (MQ=255) cTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAATTATTc < 2:1911134/91‑1 (MQ=255) tAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAATGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAATTATTcc < 1:1783937/91‑1 (MQ=255) tAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAATTATTcc > 1:3703004/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAATTATTCca > 1:1660815/1‑91 (MQ=255) aaaaGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAATTATTCcaca > 2:918659/1‑91 (MQ=255) aaaaGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAATTATTCcaca > 1:963908/1‑91 (MQ=255) aaGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAATTATTCCACAGt < 1:933936/91‑1 (MQ=255) aaGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAATTATTCCACAGt < 1:2565851/91‑1 (MQ=255) aGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAATTATTCCACAGTa > 2:2087767/1‑91 (MQ=255) GCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAATTATTCCACAGTaa < 1:482924‑M1/91‑1 (MQ=255) GCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAATTATTCCACAGTaa > 1:3868867‑M1/1‑91 (MQ=255) GCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATACACTTTAATCTTAATACATGATCGATTCTAAAAAAGTGAATTATTCCACAGTaa < 1:1169537‑M1/91‑1 (MQ=255) | ATTGTCAGACTATTTAAATAAATAAAACACTTCATTTTTACGCATTTCTGCCAAATTAAGATGAAGTAAAAGCTAAGTCGACCTAAAAAAGCACCCTTCTAGTCGATTAATCTAAAAGGGTGCCATATACTTTAATTTTAATACATGATTGATTCTAAAAAAGTGAATTATTCCACAGTAA > USA300TCH1516_ALE/2270422‑2270602 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |