| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | 1975 = | NA (NA) | 504 (0.050) | 23/138 | NT | 14.9% | intergenic (+208/+118) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_012417 | 2042 = | 3344 (0.280) | intergenic (+275/+51) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 9085 total aligned reads displayed.
TGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTC > NC_012417/1952‑2132 | cgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaccttcgtctgcaagcttag > 1:963565‑M2/91‑91 (MQ=255)cgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag < 1:3590569‑M2/1‑1 (MQ=255)cgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag > 2:1303644‑M2/91‑91 (MQ=255)cgttgagcctcgcaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag > 1:2979441‑M2/91‑91 (MQ=255) gttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGt < 1:1506782‑M2/2‑1 (MQ=255) gttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGt > 2:1016802‑M2/90‑91 (MQ=255) ttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGtt > 1:1357264‑M2/89‑91 (MQ=255) tgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTa < 1:445249‑M2/4‑1 (MQ=255) tgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTa > 1:626974‑M2/88‑91 (MQ=255) tgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTa < 1:823180‑M2/4‑1 (MQ=255) tgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTa < 2:867025‑M2/4‑1 (MQ=255) tgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTa > 2:2626827‑M2/88‑91 (MQ=255) gagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTaa < 2:1893359‑M2/5‑1 (MQ=255) gagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTaa > 2:165419‑M2/87‑91 (MQ=255) gagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTaa < 2:1220417‑M2/5‑1 (MQ=255) agcctcggaaccgttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAg < 2:3234493‑M2/6‑1 (MQ=255) agcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAg < 2:2773590‑M2/6‑1 (MQ=255) agcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAg > 1:1860206‑M2/86‑91 (MQ=255) agcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAg > 1:2196532‑M2/86‑91 (MQ=255) gcctcggagcccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg < 2:3377908‑M2/7‑1 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg > 1:2837169‑M2/85‑91 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg > 1:1294560‑M2/85‑91 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg < 2:1728434‑M2/7‑1 (MQ=255) cctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAggg > 1:1735193‑M2/84‑91 (MQ=255) ctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt > 1:312922‑M2/83‑91 (MQ=255) ctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt > 2:3081328‑M2/83‑91 (MQ=255) ctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt > 2:3826165‑M2/83‑91 (MQ=255) tcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGtt < 2:1587087‑M2/10‑1 (MQ=255) cggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTc > 2:2262423‑M2/81‑91 (MQ=255) cggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTc > 2:3538623‑M2/81‑91 (MQ=255) cggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagcttaGTTAAGGGTTc > 1:1566057‑M2/81‑91 (MQ=255) aacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgctgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTCaa > 2:3468255‑M2/71‑91 (MQ=255) aacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTCaa > 1:1221676‑M2/71‑91 (MQ=255) acaatcccaaaactcgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAAc > 2:3295937‑M2/70‑91 (MQ=255) atcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTc > 1:1068019‑M2/67‑91 (MQ=255) ggtcggcttaatagctcacgctatgccgaccattcgaCAAGCTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGa > 2:589912‑M2/38‑91 (MQ=255) gaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAg < 2:526169‑M2/6‑1 (MQ=255) gcttaatagctcacgctatgccgacattcgaCAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 2:2699547‑M2/32‑91 (MQ=255) aTAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata < 1:893149/91‑1 (MQ=32) aTAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAAGTGGaataaata > 1:3511720/1‑91 (MQ=17) tAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAg < 1:559245/91‑1 (MQ=33) atagctcacgctatgccgacCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTa > 1:2550888‑M2/21‑91 (MQ=255) cGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAt > 2:2349109/1‑91 (MQ=37) cGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAt > 2:2550267/1‑91 (MQ=37) tcacgCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc > 2:2412395/5‑91 (MQ=255) tcacgCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc > 2:2924193/5‑91 (MQ=255) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc < 1:2129122/91‑1 (MQ=38) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc < 1:1000212/91‑1 (MQ=38) tGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCt < 2:399822/91‑1 (MQ=39) tGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCt > 2:2042743/1‑91 (MQ=39) gAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTa < 1:3248032/91‑1 (MQ=40) gAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTa > 1:2774222/1‑91 (MQ=40) gAGCTATTAAGCCGA‑CATTCGACAAGTGTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaa < 2:1158708/91‑1 (MQ=255) tATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGt < 1:505358/91‑1 (MQ=255) tATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGt > 1:2698689/1‑91 (MQ=255) ttAATCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAACTaa > 1:3062701/1‑91 (MQ=255) tAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAc < 2:2114241/91‑1 (MQ=255) tAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAc < 1:2319179/91‑1 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc < 2:460091/91‑1 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc > 2:3686258/1‑91 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc > 1:2056135/1‑91 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc < 1:1996820/91‑1 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGCATCTAAAGTAAcc > 1:3875028/1‑91 (MQ=255) aGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAccc < 2:1960246/91‑1 (MQ=255) aGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAccc > 2:1524839/1‑91 (MQ=255) gCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCg > 1:1924880/1‑91 (MQ=255) gCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCg < 1:1143698/91‑1 (MQ=255) gACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAt < 1:3188887/91‑1 (MQ=255) aCCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAtt > 1:760156/1‑91 (MQ=255) ccATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTATCCCGTAttt < 2:2186752/91‑1 (MQ=255) ccATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt > 1:3649861/1‑91 (MQ=255) ccATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt < 1:2632860/91‑1 (MQ=255) ccATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt < 1:3808237/91‑1 (MQ=255) CATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTa < 1:1619543‑M2/91‑1 (MQ=255) ATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTaa < 2:2472339‑M2/91‑1 (MQ=255) ATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTaa < 1:249396‑M2/91‑1 (MQ=255) TCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGa > 1:2913852‑M2/1‑91 (MQ=255) TCGACAACTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTAAACGTCAATACAGCAATTGGAATAAATAGAATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGa > 2:3614205‑M2/1‑91 (MQ=255) CGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAt > 1:2411133‑M2/1‑91 (MQ=255) CGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAt > 2:1380493‑M2/1‑91 (MQ=255) CGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAt < 2:1084787‑M2/91‑1 (MQ=255) CGACAAGTTGTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAt < 1:3717251‑M2/91‑1 (MQ=255) aCAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTa > 2:92796/1‑91 (MQ=255) AGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACAt > 2:3152813‑M2/1‑91 (MQ=255) GTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCTGTCTTTAAGATTACAtt > 1:3320639‑M2/1‑91 (MQ=255) GTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACAtt > 2:2856805‑M2/1‑91 (MQ=255) TTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGt < 1:1675714‑M2/91‑1 (MQ=255) TTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGt < 2:672335‑M2/91‑1 (MQ=255) TTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGt < 2:737240‑M2/91‑1 (MQ=255) TTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGt < 1:3448429‑M2/91‑1 (MQ=255) TTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTa > 1:3390069‑M2/1‑91 (MQ=255) tGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTAc > 2:375991/1‑91 (MQ=255) tGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTAc > 1:693339/1‑91 (MQ=255) gggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACa > 1:22544/1‑91 (MQ=255) ggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACAt < 2:1458422/91‑1 (MQ=255) gATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATc > 2:1812620/1‑91 (MQ=255) gATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATc < 1:1440119/91‑1 (MQ=255) gATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATc > 2:807868/1‑91 (MQ=255) ttGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCt < 1:1811093/91‑1 (MQ=255) tGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCtt < 2:29954/91‑1 (MQ=255) | TGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTC > NC_012417/1952‑2132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |