New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_012417 | = 1983 | 2631 (0.220) | 172 (0.010) | 26/154 | NT | 6.3% | intergenic (+216/+110) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_012417 | = 1995 | 2596 (0.230) | intergenic (+228/+98) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 7022 total aligned reads displayed.
TGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAA > NC_012417/1905‑2085 | tGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCG < 1:1414001‑M1/91‑1 (MQ=255) aaGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGgc < 2:2605590‑M2/91‑3 (MQ=255) aaGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGgc < 2:3481335‑M2/91‑3 (MQ=255) aGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAGCCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGgca > 2:3805257‑M2/1‑88 (MQ=255) aGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGgca > 2:789508‑M2/1‑88 (MQ=255) aGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGgca > 2:3316808‑M2/1‑88 (MQ=255) gataatAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCAt < 1:438989‑M2/85‑1 (MQ=255) gataatAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCAt < 2:2090552‑M2/85‑1 (MQ=255) taatAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAg < 1:772973‑M2/87‑1 (MQ=255) atAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCg < 2:1411799‑M2/89‑1 (MQ=255) atAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCg < 1:941987‑M2/89‑1 (MQ=255) atAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCg < 1:826335‑M2/89‑1 (MQ=255) atAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCg > 1:502648‑M2/3‑91 (MQ=255) tAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGt < 2:2388143‑M2/90‑1 (MQ=255) tAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGt > 2:2878578‑M2/2‑91 (MQ=255) aaaaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCttaatagc < 2:615843‑M1/91‑9 (MQ=255) aaaaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTg < 2:2323082/91‑1 (MQ=255) aaaaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTg < 1:3750033/91‑1 (MQ=255) aaaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGa < 1:3258044/91‑1 (MQ=255) aaaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGa < 1:3378806/91‑1 (MQ=255) aaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAg > 2:1499503/1‑91 (MQ=255) aaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAg > 2:3014704/1‑91 (MQ=255) aaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAg > 2:720601/1‑91 (MQ=255) aaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGc > 1:3601087/1‑91 (MQ=255) aaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGc > 2:541516/1‑91 (MQ=255) aaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGc > 2:1936782/1‑91 (MQ=255) aaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGc > 1:1706232/1‑91 (MQ=255) aaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGc > 1:1952250/1‑91 (MQ=255) aaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCt < 1:2493722/91‑1 (MQ=255) aaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCt > 1:1261078/1‑91 (MQ=255) aaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCATTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCt > 2:1562629/1‑91 (MQ=255) aTAGACGACGCGTTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTa < 1:3524321/91‑1 (MQ=255) aTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTa < 1:3066036/91‑1 (MQ=255) tAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTAt < 1:1480301/91‑1 (MQ=255) tAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTAt > 2:2798048/1‑91 (MQ=255) tAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTAt > 1:2928191/1‑91 (MQ=255) tAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTAt < 2:1278780/91‑1 (MQ=255) tAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTAt < 1:2192416/91‑1 (MQ=255) aGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTAtt < 1:1764993/91‑1 (MQ=40) aGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTAtt > 2:1353837/1‑91 (MQ=40) aGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTAtt > 1:569630/1‑91 (MQ=40) gacgacGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTa < 1:878748/91‑1 (MQ=39) gacgacGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTa > 1:1898102/1‑91 (MQ=39) gacgacGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTa > 2:2938758/1‑91 (MQ=39) gacgacGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTa > 2:1699932/1‑91 (MQ=39) gacgacGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTa > 2:2024308/1‑91 (MQ=39) gacgacGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTa > 1:1551763/1‑91 (MQ=39) acgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTaa < 2:1196752/91‑1 (MQ=38) acgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTaa > 1:1197037/1‑91 (MQ=37) acgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTaa > 1:3679966/1‑91 (MQ=38) acgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTaa > 1:207746/1‑91 (MQ=38) acgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCG < 2:164921‑M1/72‑1 (MQ=255) cgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAg < 2:3636442‑M2/91‑2 (MQ=255) cgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAg < 2:1856355‑M2/91‑2 (MQ=255) cgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAg < 1:2441282‑M2/91‑2 (MQ=255) cgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAg > 1:2869908‑M2/1‑90 (MQ=255) gacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCttaatagctcacgctatgc < 2:3402675‑M1/91‑20 (MQ=255) gacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgc < 2:2256205‑M2/91‑3 (MQ=255) gacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgc > 2:3240035‑M2/1‑89 (MQ=255) gacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgc > 2:1010270‑M2/1‑89 (MQ=255) acgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGGGTGAGCTATTAAgcc > 1:3312963‑M2/1‑88 (MQ=255) acgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAggt < 1:712706‑M2/91‑4 (MQ=255) cgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgccg < 1:2806286‑M2/91‑5 (MQ=255) cgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgccg < 1:2693919‑M2/91‑5 (MQ=255) cgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgccg > 1:2316735‑M2/1‑87 (MQ=255) gCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgccga > 2:2171484‑M2/1‑86 (MQ=255) gCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgccga < 1:388177‑M2/91‑6 (MQ=255) aTTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGAcc > 1:1000505/1‑91 (MQ=34) aTTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGAcc < 1:3129510/91‑1 (MQ=33) aTTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGAcc < 1:2561928/91‑1 (MQ=34) tttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCa > 2:2464698/1‑91 (MQ=33) ttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCAt > 2:317174/1‑91 (MQ=34) ttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCAt > 2:471424/1‑91 (MQ=34) tATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCAtt < 1:1061678/91‑1 (MQ=34) tATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCAtt < 2:253452/91‑1 (MQ=34) aTGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTc > 2:3565153/1‑91 (MQ=34) aTGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTc > 1:298929/1‑91 (MQ=34) gCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa < 1:380861/91‑1 (MQ=34) gCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa > 1:3452677/1‑91 (MQ=34) gagaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaa < 2:2667591‑M2/91‑4 (MQ=255) gagaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaa < 2:2724716‑M2/91‑4 (MQ=255) gagaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaa < 1:635348‑M2/91‑4 (MQ=255) gaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaagt < 1:2258806‑M2/91‑6 (MQ=255) gaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaagt > 1:2373378‑M2/1‑86 (MQ=255) aaaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaagtt > 1:2753870‑M2/1‑85 (MQ=255) aaaTTTATTGATGTTGCGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaagttt > 2:3703314‑M2/1‑84 (MQ=255) aaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaagttt > 2:3885029‑M2/1‑84 (MQ=255) aaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaagttt < 1:1352237‑M2/91‑8 (MQ=255) aaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaagttt < 1:1128777‑M2/91‑8 (MQ=255) aTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAg < 2:844062‑M2/70‑2 (MQ=255) cTTGCAGACGAATGTCGgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattat < 1:1829601‑M2/91‑75 (MQ=255) gTCGGCttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatg < 1:1635180‑M1/91‑86 (MQ=255) tCGGCttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgc > 2:1789470‑M1/1‑5 (MQ=255) tCGGCttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgc > 1:2630138‑M1/1‑5 (MQ=255) tCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgc < 1:3187296‑M2/91‑70 (MQ=255) cGGCttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcg > 1:2125349‑M1/1‑4 (MQ=255) cGGCttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcg > 2:3077035‑M1/1‑4 (MQ=255) cGGCttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcg > 2:938137‑M1/1‑4 (MQ=255) ggCttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgt > 1:2012978‑M1/1‑3 (MQ=255) ggCATAGCGTGAGCTATTAAgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgt < 2:1094982‑M2/91‑72 (MQ=255) | TGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAA > NC_012417/1905‑2085 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |