New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 110692 | 280 (1.470) | 13 (0.070) | 5/150 | NT | 5.4% | coding (551/771 nt) | USA300HOU_RS00515 | putative lipoprotein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 112333 | 192 (1.080) | coding (536/771 nt) | USA300HOU_RS00525 | putative lipoprotein |
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
AAATCGAAAACTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGC > USA300TCH1516_ALE/112243‑112423 | aaaTCGAAAACTTTAAGTTCTTTGTTCAAGATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGt < 2:2471532/91‑1 (MQ=255) aaTCGAAAACTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTg > 2:2136325‑M2/1‑90 (MQ=255) aTCGAAAACTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgc > 2:869853‑M2/1‑89 (MQ=255) aTCGAAAACTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgc > 2:3314306‑M2/1‑89 (MQ=255) aTCGAAAACTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgc > 1:2197639‑M2/1‑89 (MQ=255) tCGAAAACTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgcc > 2:1687368‑M2/1‑88 (MQ=255) tCGAAAACTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgcc > 2:1446235‑M2/1‑88 (MQ=255) tCGAAAACTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgcc > 1:802111‑M2/1‑88 (MQ=255) gAAAACTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgccga > 1:100637‑M2/1‑86 (MQ=255) aaaaCTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAg < 2:3863202/91‑1 (MQ=255) aaaCTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGt < 2:3159453/91‑1 (MQ=255) aaCTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgccgaata > 1:1222951‑M2/1‑83 (MQ=255) aCTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTa > 2:1658569/1‑91 (MQ=255) cTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgccgaataac > 1:1799649‑M2/1‑81 (MQ=255) cTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTAt < 1:1433479/91‑1 (MQ=255) cTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTAt < 2:2788962/91‑1 (MQ=255) tttAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgccgaataact > 1:1241162‑M2/1‑80 (MQ=255) tttAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgccgaataact > 1:2952372‑M2/1‑80 (MQ=255) tttAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgccgaataact > 1:2677825‑M2/1‑80 (MQ=255) tttAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgccgaataact > 1:1311931‑M2/1‑80 (MQ=255) ttAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgccgaataactc > 1:1686309‑M2/1‑79 (MQ=255) tAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCg < 1:2141261/91‑1 (MQ=255) tAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCg < 1:1565274/91‑1 (MQ=255) tAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCg < 1:1536869/91‑1 (MQ=255) tAAGTTCATTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCg < 1:1945986/91‑1 (MQ=255) aaGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCgg > 2:3829044/1‑91 (MQ=255) aaGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCgg < 2:2319637/91‑1 (MQ=255) aaGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCgg < 1:542780/91‑1 (MQ=255) aGTTGTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGc > 1:3065237/1‑91 (MQ=255) aGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTgccgaataactcggc > 1:612089‑M2/1‑76 (MQ=255) aGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGc < 1:300220/91‑1 (MQ=255) gTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCt > 1:261738/1‑91 (MQ=255) tCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTaa < 1:3537450/91‑1 (MQ=255) cTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTaaa > 2:2447205/1‑91 (MQ=255) cTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTaaa > 2:3563707/1‑91 (MQ=255) tttGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAat < 2:1336441/91‑1 (MQ=255) ttGTTCAATATCGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAata < 1:3523072/91‑1 (MQ=255) ttCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCAGATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCa < 1:3284299/91‑1 (MQ=255) cAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAAt > 2:651094/1‑91 (MQ=255) aaTATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAAtt < 1:2104874/91‑1 (MQ=255) atatGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTa > 2:1814640/1‑91 (MQ=255) atatGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTa > 1:3448166/1‑91 (MQ=255) tatGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTaa < 2:45457/91‑1 (MQ=255) atGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAAc < 1:627528/91‑1 (MQ=255) atGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAAc < 2:2394168/91‑1 (MQ=255) ggAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTa > 1:408570/1‑91 (MQ=255) ggAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTa > 1:2710292/1‑91 (MQ=255) gAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTaa < 2:309505/91‑1 (MQ=255) gAAACGTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTaa < 2:1114965/91‑1 (MQ=255) aaCTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAatg < 1:2428255/91‑1 (MQ=255) aCTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAGCTAatga > 2:3442934/1‑91 (MQ=255) aCTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAatga < 1:3231409/91‑1 (MQ=255) tttAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAatgatg < 2:3770847/91‑1 (MQ=255) ttAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAAtgatga > 2:1063131/1‑91 (MQ=255) ttAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAAtgatga < 2:1405390/91‑1 (MQ=255) ttAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAAtgatga > 2:488629/1‑91 (MQ=255) tAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATgatgat < 2:1463497/91‑1 (MQ=255) aaaGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGAtt > 1:3759321/1‑91 (MQ=255) aaGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTa < 1:2985838/91‑1 (MQ=255) aGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTAc > 2:2706130/1‑91 (MQ=255) aGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTAc > 2:772369/1‑91 (MQ=255) tGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGt < 1:1405371/91‑1 (MQ=255) cGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTaaa > 2:1309964/1‑91 (MQ=40) gAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAg < 2:2326858/91‑1 (MQ=40) aGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCa > 1:3595626/1‑91 (MQ=40) aGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCa > 2:1514415/1‑91 (MQ=40) aGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCa > 2:449416/1‑91 (MQ=40) aGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCa > 1:720425/1‑91 (MQ=40) gTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCaa < 2:1019378/91‑1 (MQ=40) ataAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAAtt < 1:31813/91‑1 (MQ=39) taAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTa > 1:454298/1‑91 (MQ=39) aaaGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTAc > 1:48933/1‑91 (MQ=39) aaaGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTAc > 2:2598388/1‑91 (MQ=38) aaGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACg < 2:3642976/91‑1 (MQ=39) aCGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTaa < 2:2898848/91‑1 (MQ=255) cGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTaaa < 2:3468738/91‑1 (MQ=255) gagaTATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTAATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAg > 2:3804492/1‑91 (MQ=255) agaTATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGa < 1:3729100/91‑1 (MQ=255) agaTATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGa > 1:227361/1‑91 (MQ=255) atatTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGata > 2:2111882/1‑91 (MQ=255) atatTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGata > 2:2739866/1‑91 (MQ=255) tatTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGatat > 1:2233844/1‑91 (MQ=255) tttCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGa > 1:591433/1‑91 (MQ=255) tttCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGa < 1:1397241/91‑1 (MQ=255) cATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACAt < 1:3652692/91‑1 (MQ=255) cATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACAt < 1:3429084/91‑1 (MQ=255) atatAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATa < 1:1021904/91‑1 (MQ=255) atatAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATa > 2:1569654/1‑91 (MQ=255) atatAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATa < 2:1725609/91‑1 (MQ=255) tataATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATAc < 2:3724686/91‑1 (MQ=255) ataATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATAcc < 2:1740387/91‑1 (MQ=255) ataATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATAcc < 1:1670546/91‑1 (MQ=255) tCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATACcaaca < 1:2486917/91‑1 (MQ=255) tCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATACcaaca < 1:3094588/91‑1 (MQ=255) ccAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATACcaacaa < 1:2041932/91‑1 (MQ=255) cAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACaaa > 2:1940448/1‑91 (MQ=255) agGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATaa < 1:1841092/91‑1 (MQ=255) agGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATaa < 1:3800650/91‑1 (MQ=255) gTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAg < 1:2739866/91‑1 (MQ=255) tGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGc > 2:2291491/1‑91 (MQ=255) | AAATCGAAAACTTTAAGTTCTTTGTTCAATATGGAAACTTTAAAGATTTGTCGAAGTATAAAGACGGAGATATTTCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTACAATGTAAAGCAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGC > USA300TCH1516_ALE/112243‑112423 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |