New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 374491 = | 136 (0.710) | 16 (0.090) | 11/144 | NT | 11.1% | intergenic (+109/+133) | lip2/USA300HOU_RS01705 | Lipase 2/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 374527 = | 135 (0.790) | intergenic (+145/+97) | lip2/USA300HOU_RS01705 | Lipase 2/hypothetical protein |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
CAGATATAAGTAGCATCACAGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTAAAATAAT > USA300TCH1516_ALE/374437‑374617 | gATATAAGTAGCATCACAGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTAt < 2:658438/91‑1 (MQ=255) gATATAAGTAGCATCACAGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTAt > 2:1594602/1‑91 (MQ=255) tattcgatcaaccatattattcatacaatttattaagctcataaacagataCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATc > 1:1914589‑M1/52‑91 (MQ=255) taAGTAGCATCACAGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGt > 2:3269590/1‑91 (MQ=255) gaTCACAGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAg > 1:309935/2‑91 (MQ=255) aTCACAGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGc < 1:39275/91‑1 (MQ=255) cacaGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCtt > 1:911354/1‑91 (MQ=255) cacaGTGTTGAAGTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCtt > 1:2977663/1‑91 (MQ=255) acaGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTta > 1:2816263/1‑91 (MQ=255) caGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTtaa > 2:983066/1‑91 (MQ=255) caGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTtaa < 1:3741836/91‑1 (MQ=255) caGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTtaa > 1:1141667/1‑91 (MQ=255) aGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTtaat < 1:1856861/91‑1 (MQ=255) aGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTtaat < 2:3454708/91‑1 (MQ=255) aGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTtaat < 2:1388335/91‑1 (MQ=255) aGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTtaat < 1:215891/91‑1 (MQ=255) tgtTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTtaataa > 1:3497418/1‑91 (MQ=255) gtTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATaaa > 1:2408633/1‑91 (MQ=255) gtTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATaaa > 1:1219237/1‑91 (MQ=255) ttGAATTTATAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAAt < 1:3723334/91‑1 (MQ=255) ttGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAAt < 1:518253/91‑1 (MQ=255) tGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAAtt > 2:2531138/1‑91 (MQ=255) tAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGa < 2:3630093/91‑1 (MQ=255) aaaaaTAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGaa < 2:2297740/91‑1 (MQ=255) aaTAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGaataa > 2:1731511/1‑91 (MQ=255) aaTAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCATATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGaataa > 1:462711/1‑91 (MQ=255) aTAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGaataat > 2:409203/1‑91 (MQ=255) tAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAataata < 2:1230943/91‑1 (MQ=255) tAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAataata > 1:896891/1‑91 (MQ=255) aGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAatat > 1:1834226/1‑91 (MQ=255) gtcaaGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACCAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGCATAATATg > 2:174702/4‑91 (MQ=255) gTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATg < 1:2704941/91‑1 (MQ=255) tAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATgg < 2:3593552/91‑1 (MQ=255) tAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATgg > 2:2401903/1‑91 (MQ=255) aaaGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGt > 2:1275649/1‑91 (MQ=255) aaaGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGt > 2:1967965/1‑91 (MQ=255) aaaGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGt > 2:67829/1‑91 (MQ=255) aaaGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGt > 1:2238009/1‑91 (MQ=255) gTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGAGAAACATAAAGGGACAGGCGTATCTGCTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGa > 2:2522835/1‑91 (MQ=255) tGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGAt < 2:3349382/91‑1 (MQ=255) gAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATc < 2:2816263/91‑1 (MQ=255) aaaTAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGGGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCg > 1:2495854/1‑91 (MQ=255) aaaTAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCg > 2:105276/1‑91 (MQ=255) aTAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGaat > 1:1425364/1‑75 (MQ=255) aTAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGaat < 2:3046056/75‑1 (MQ=255) aTAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGaat < 2:1425364/75‑1 (MQ=255) aTAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGaa < 2:3491426/91‑1 (MQ=255) aaGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATaa > 1:1264173/1‑91 (MQ=255) aaGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATaa < 2:1998738/91‑1 (MQ=255) gcgcCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACt > 1:134404/1‑91 (MQ=255) aCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGGGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACt > 1:2277494‑M1/2‑91 (MQ=255) cgcctgtccctttagttttcgctaatgagacaggcgTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTg > 1:3513447‑M2/37‑91 (MQ=255) CGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTg < 1:3127952‑M1/91‑1 (MQ=255) CGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTg < 2:387123‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTa > 1:1720289‑M1/1‑91 (MQ=255) TGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTa < 1:1251351‑M1/91‑1 (MQ=255) tcATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCat < 2:3497418/91‑1 (MQ=255) ctttagttttcgctaatgagacaggcgTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCatg > 2:117033‑M2/28‑91 (MQ=255) ttAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCatgat > 2:1829904/1‑91 (MQ=255) ttAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCatcat < 1:1124560/91‑4 (MQ=255) ttAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGATTATGAGCTTAATAAATGGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCatgat > 2:885361/1‑91 (MQ=255) tggCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCatgatg > 2:1419907/3‑91 (MQ=255) tagttttcgctaatgagacaggcgTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCatgatg > 1:625546‑M2/25‑91 (MQ=255) tAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCatgatg > 1:2002683/1‑91 (MQ=255) tAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCatgatg < 1:3294161/91‑1 (MQ=255) tAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCatcatg < 1:642424/91‑1 (MQ=255) aGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCAtgatga > 1:2242456/1‑91 (MQ=255) cGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTATTTATCATCATGATa < 2:1524027/91‑1 (MQ=255) gAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATaa > 2:2259259/1‑91 (MQ=255) aaaCTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAAt > 2:628011/1‑91 (MQ=255) aaaCTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAAt < 1:1549231/91‑1 (MQ=255) aaaCTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAAt < 1:2543065/91‑1 (MQ=255) aaCTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAAtt > 2:493432/1‑91 (MQ=255) aaCTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAAtt > 1:2144917/1‑91 (MQ=255) aaCTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAAtt < 1:1669929/91‑1 (MQ=255) aaCTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAAtt > 1:2579813/1‑91 (MQ=255) aaCTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAAtt < 1:3433279/91‑1 (MQ=255) aaCTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAAtt > 2:150455/1‑91 (MQ=255) aCTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTg > 2:296884/1‑91 (MQ=255) aCTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTg < 1:3653270/91‑1 (MQ=255) tAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAg < 1:852520/91‑1 (MQ=255) aaaGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGt > 2:1857959/1‑91 (MQ=255) aaGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGtt > 2:2189712/1‑91 (MQ=255) aaGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGtt > 1:602934/1‑91 (MQ=255) aGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGttt > 1:2284458/1‑91 (MQ=255) gggACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGtttt > 1:2058554/1‑91 (MQ=255) acaggcgTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTa < 2:1914589‑M2/84‑1 (MQ=255) caggcgTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTaa > 2:545116‑M2/7‑91 (MQ=255) aggcgTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTaaa > 2:2493293‑M2/6‑91 (MQ=255) aggcgTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTaaa > 2:1615914‑M2/6‑91 (MQ=255) ggcgTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTaaaa > 1:1175910‑M2/5‑91 (MQ=255) ggcgTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTaaaa < 1:1289761‑M2/87‑1 (MQ=255) gcgTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTAAaat > 1:3700728‑M2/4‑91 (MQ=255) cgTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTAAaata > 2:732561‑M2/3‑91 (MQ=255) gTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTAAaataa > 2:1639002‑M2/2‑91 (MQ=255) gTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTAAaataa > 2:2100861‑M2/2‑91 (MQ=255) gTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTAAaataa < 2:3249508‑M2/90‑1 (MQ=255) tATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTAAaataat < 1:1013250/91‑1 (MQ=255) tATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTAAaataat > 1:2630746/1‑91 (MQ=255) tATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTAAaataat > 2:2451813/1‑91 (MQ=255) | CAGATATAAGTAGCATCACAGTGTTGAATTTAAAAATAGTAAAGTGAAATAAAGCGCCTGTCTCATTAGCGAAAACTAAAGGGACAGGCGTATCTGTTTATGAGCTTAATAAATTGTATGAATAATATGGTTGATCGAATAACTGTTTATCATGATGATAAATTGAGTTTTTTAAAATAAT > USA300TCH1516_ALE/374437‑374617 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |