| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 940821 | 169 (0.890) | 30 (0.170) | 13/148 | NT | 17.5% | intergenic (+2/+54) | USA300HOU_RS04680/ptlE | Putative esterase/Neopentalenolactone D synthase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 940872 | 126 (0.720) | intergenic (+53/+3) | USA300HOU_RS04680/ptlE | Putative esterase/Neopentalenolactone D synthase | |||||
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
TTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGT > USA300TCH1516_ALE/940782‑940962 | aTGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTtt > 2:1232679‑M2/1‑89 (MQ=255) aTGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTtt > 2:784062‑M2/1‑89 (MQ=255) tGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTttt < 1:2258594‑M2/91‑4 (MQ=255) gCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTtttt < 1:1308951‑M2/91‑5 (MQ=255) gCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTtttt > 2:3073126‑M2/1‑87 (MQ=255) gCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTtttt < 2:1594488‑M2/91‑5 (MQ=255) ggTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATgc < 2:572241/91‑1 (MQ=255) ggTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATgc < 2:1038389/91‑1 (MQ=255) tACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATgcgc < 1:3123357/91‑1 (MQ=255) tACAGTTGCTATCAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATgcgc < 2:2628738/91‑1 (MQ=255) tACAGTTGCTATCAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATgcgc < 2:2628725/91‑1 (MQ=255) aCAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCt < 1:2502217/91‑1 (MQ=255) cAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCta > 2:2970339/1‑91 (MQ=255) aaaactacaacaatatagcgcataaaaaAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCtat > 1:1062518‑M1/29‑91 (MQ=255) aGTTGCTATTAAACCTGTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGACTAGCAGTTTTATTATGCGCtat > 2:2799073/1‑91 (MQ=255) gTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCtata > 2:1310454/1‑91 (MQ=255) ttGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTatat > 1:1291542/1‑91 (MQ=255) tGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAtt < 1:2069519/91‑1 (MQ=255) gCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAttg < 1:2276718/91‑1 (MQ=255) gCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAttg < 1:3783040/91‑1 (MQ=255) gCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAttg < 1:3153871/91‑1 (MQ=255) cTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAttgt < 1:2454868/91‑1 (MQ=255) tATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAttgtt < 2:1196080/91‑1 (MQ=255) aaTTAATCCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAATTGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAttgtt < 1:638473/90‑1 (MQ=255) aTTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAttgttg < 1:988968/91‑1 (MQ=255) ccTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGttt < 2:184741/91‑1 (MQ=255) ccTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGttt < 1:3048281/91‑1 (MQ=255) cTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTttttattttaaaggtttaatagcaact < 1:699932‑M2/91‑28 (MQ=255) cTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGtttt < 2:543558/91‑1 (MQ=255) tttAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTa > 2:1975354/1‑91 (MQ=255) taaaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTttttattttaaaggtttaatagcaactgta < 2:888663‑M2/91‑31 (MQ=255) taaaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGa > 1:1378491/1‑91 (MQ=255) taaaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGa > 1:1422158/1‑91 (MQ=255) taaaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGa > 1:2606105/1‑91 (MQ=255) aaaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGaa > 2:1925457/1‑91 (MQ=255) aaaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGaa < 1:2257649/91‑1 (MQ=255) aaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGaaa > 1:731227/1‑91 (MQ=255) aataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAAt < 2:3699044/91‑1 (MQ=255) aataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAAt < 2:643644/91‑1 (MQ=255) ataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATg > 2:2457160/1‑91 (MQ=255) taaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGc < 1:2136027/91‑1 (MQ=255) aaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTttttattttaaaggtttaatagcaactgtaccacgc < 2:3558574‑M2/91‑37 (MQ=255) aaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTttttattttaaaggtttaatagcaactgtaccacgc < 1:3829043‑M2/91‑37 (MQ=255) aaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTttttattttaaaggtttaatagcaactgtaccacgca < 1:1743117‑M2/91‑38 (MQ=255) aaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTttttattttaaaggtttaatagcaactgtaccacgca < 1:1743219‑M2/91‑38 (MQ=255) aaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTg < 2:3252396/91‑1 (MQ=255) gAACTTCTGGGTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGtt < 2:3585588/91‑1 (MQ=255) gAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGtt > 1:956360/1‑91 (MQ=255) aactgctagccgtagttatgaatatctcataacatttcagctagcagttCTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTc > 1:2946526‑M2/50‑91 (MQ=255) aaCTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTCttttattttaaaggtttaatagcaactgtaccacgcataac < 2:473042‑M2/91‑42 (MQ=255) AACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTc > 2:324950‑M1/1‑91 (MQ=255) AACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTc > 2:3652435‑M1/1‑91 (MQ=255) actgctagccgtagttatgaatatctcataacatttcagctagcagttTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCa > 1:1437611‑M2/49‑91 (MQ=255) aCTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTttttattttaaaggtttaatagcaactgtaccacgcataact < 2:3492345‑M2/91‑43 (MQ=255) ACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCGTAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGttt < 2:3386335‑M1/75‑1 (MQ=255) ACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGttt > 1:3386335‑M1/1‑75 (MQ=255) ACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCa > 2:3355138‑M1/1‑91 (MQ=255) ctgctagccgtagttatgaatatctcataacatttcagctagcagttTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCaa > 1:481267‑M2/48‑91 (MQ=255) CTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCaa > 1:1982884‑M1/1‑91 (MQ=255) TGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGTAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAAt > 2:3413527‑M1/1‑91 (MQ=255) CTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGc < 2:1026695‑M1/91‑1 (MQ=255) TAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCg < 1:2792536‑M1/91‑1 (MQ=255) gCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTCttttattttaaaggtttaatagcaactgtaccacgcataactgtaatta < 1:1114861‑M2/91‑50 (MQ=255) GCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGtt > 2:1294448‑M1/1‑91 (MQ=255) tGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCg < 1:1632785/91‑1 (MQ=255) aaTGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCa < 2:533237/91‑1 (MQ=255) aaTGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCa > 1:60882/1‑91 (MQ=255) gTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCt < 2:28954/91‑1 (MQ=255) ttATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCtt < 2:196601/91‑1 (MQ=255) tATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATTCGTTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCttt > 2:1422708/1‑91 (MQ=255) tATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCttt < 2:2805128/91‑1 (MQ=255) tATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCttt < 1:1226854/91‑1 (MQ=255) aTGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTa < 1:3191505/91‑1 (MQ=255) tGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTttttattttaaaggtttaatagcaactgtaccacgcataactgtaattaattgttctttgt < 1:781591‑M2/91‑62 (MQ=255) tGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTAc < 2:3124599/91‑1 (MQ=255) tGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGATATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTAc > 2:1130466/1‑91 (MQ=255) gagaTATTCATAACTACGGCTAGTAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACg < 1:3442839/91‑1 (MQ=255) agaTATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACgg < 1:3512466/91‑1 (MQ=255) gaTATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGc < 2:1900362/91‑1 (MQ=255) gaTATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGc > 2:1770519/1‑91 (MQ=255) atatTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGcc > 1:2010280/1‑91 (MQ=255) atatTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGcc < 2:3107586/91‑1 (MQ=255) atTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCAc < 1:3730283/91‑1 (MQ=255) tCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCAccc < 1:2784295/91‑1 (MQ=255) cATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCa < 2:3766402/91‑1 (MQ=255) cATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCa > 2:1574403/1‑91 (MQ=255) aaCTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATaa < 2:134230/91‑1 (MQ=255) aCTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAAc < 2:2671704/91‑1 (MQ=255) aCTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAAc > 2:2166767/1‑91 (MQ=255) ggCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTc > 1:2826805/1‑91 (MQ=255) agcagttTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTAcc < 2:2270499‑M2/84‑1 (MQ=255) gcagttTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCa > 2:2875452‑M2/7‑91 (MQ=255) gcagttTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCa > 2:209961‑M2/7‑91 (MQ=255) gcagttTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCa < 1:2635516‑M2/85‑1 (MQ=255) ttTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATg < 1:2688282‑M2/89‑1 (MQ=255) ttTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATg > 1:669043‑M2/3‑91 (MQ=255) tTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATgg < 1:1633957‑M2/90‑1 (MQ=255) tTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATgg > 1:2333697‑M2/2‑91 (MQ=255) tTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATgg > 1:101258‑M2/2‑91 (MQ=255) tttttATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGt < 1:762322/91‑1 (MQ=255) | TTATGCGTGGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGT > USA300TCH1516_ALE/940782‑940962 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |