New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1199293 | 128 (0.670) | 14 (0.080) | 9/144 | NT | 9.7% | intergenic (+20/‑63) | USA300HOU_RS05980/USA300HOU_RS05985 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1199312 | 147 (0.860) | intergenic (+39/‑44) | USA300HOU_RS05980/USA300HOU_RS05985 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
CAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGATATTTA > USA300TCH1516_ALE/1199223‑1199402 | cAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAg < 2:3283108‑M2/91‑2 (MQ=255) cAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAg < 2:3396040‑M2/91‑2 (MQ=255) aaaaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgc > 1:2142857‑M2/1‑89 (MQ=255) aaaaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAAGAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgc > 2:143514‑M2/1‑89 (MQ=255) aaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGACAAGGGTACATGATACTTTATcca > 2:1764782/1‑90 (MQ=255) aaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATCGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcct > 2:3600433‑M2/1‑87 (MQ=255) aaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctc > 1:1131162‑M2/1‑86 (MQ=255) aaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctc < 2:2528985‑M2/91‑6 (MQ=255) aaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctc > 1:195562‑M2/1‑86 (MQ=255) gggTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgt > 1:2068587‑M2/1‑84 (MQ=255) ggTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgtt < 2:3095520‑M2/91‑9 (MQ=255) ggTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgtt > 2:442910‑M2/1‑83 (MQ=255) ggTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgtt < 2:483461‑M2/91‑9 (MQ=255) ggTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgtt < 2:732501‑M2/91‑9 (MQ=255) ggTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgtt < 2:2038233‑M2/91‑9 (MQ=255) ggTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgtt < 2:844701‑M2/91‑9 (MQ=255) ggTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTCAgcctcgtt < 1:3716044‑M2/91‑9 (MQ=255) gTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGttt > 2:3519672/1‑91 (MQ=255) ttACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGtttt > 2:1319427/1‑91 (MQ=255) ttACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGtttt > 2:157155/1‑91 (MQ=255) ttACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGtttt > 1:2656285/1‑91 (MQ=255) tACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGttttt > 2:752587/1‑91 (MQ=255) tACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGtttta > 2:3838443/1‑90 (MQ=255) aCTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTg > 2:2607027/1‑91 (MQ=255) cAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGatat < 1:2323921/91‑1 (MQ=255) aaTCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGc < 1:3409223/91‑1 (MQ=255) tCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAt < 2:3646363/91‑1 (MQ=255) ttAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAtttt < 1:2296111/91‑1 (MQ=255) aaTTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTc > 1:504099/1‑91 (MQ=255) aTTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAata > 2:3312473/1‑91 (MQ=255) ttttAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattg < 2:1374670‑M2/91‑33 (MQ=255) ttttAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAatat < 2:33614/91‑1 (MQ=255) ttttAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAatat < 1:3020431/91‑1 (MQ=255) ttAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAATGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAGTTTTCTGAATATaa < 1:2586299/91‑1 (MQ=255) ttAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATaa > 2:2406061/1‑91 (MQ=255) aaTTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAgg > 1:964458/1‑91 (MQ=255) aaTTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAgg > 1:827243/1‑91 (MQ=255) aaTTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAgg < 2:2140196/91‑1 (MQ=255) ttCAATTGCAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGc < 1:1931280/91‑1 (MQ=255) tCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCa > 2:377976/1‑91 (MQ=255) tCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCCGAATATAAGGGCa > 1:3876512/1‑91 (MQ=255) aTTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATa > 1:2432530/1‑91 (MQ=255) tACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGa < 2:1251791/91‑1 (MQ=255) aCAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGAt > 2:603331/1‑91 (MQ=255) cAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATg > 2:1746855/1‑91 (MQ=255) cAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATg > 1:1251066/1‑91 (MQ=255) aaTAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATgg < 2:599114/91‑1 (MQ=255) aaTAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATgg < 1:3294624/91‑1 (MQ=255) aaTAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATgg < 2:1476653/91‑1 (MQ=255) aaTAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATgg > 1:3633221/1‑91 (MQ=255) aTAAATTAATCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGt < 2:646620/91‑1 (MQ=255) aaaTTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAt > 2:1970322/1‑91 (MQ=255) ttAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAtttt < 1:716934/91‑1 (MQ=255) ttAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAtttt < 1:1199967/91‑1 (MQ=255) ttAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTCTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAtttt < 1:987091/91‑1 (MQ=255) aaGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTtat > 1:2245291/1‑91 (MQ=255) aGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTtata > 2:1089581/1‑91 (MQ=255) gCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATaa < 2:1030580/91‑1 (MQ=255) gACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTAATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAAtt < 2:1999570/91‑1 (MQ=255) aTAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAAttttt < 1:1662326/91‑1 (MQ=255) tAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAAtttttt < 2:3000722/91‑1 (MQ=255) aCGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTa < 1:767755/91‑1 (MQ=255) aCGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTa < 2:1331902/91‑1 (MQ=255) cGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTaa > 2:3768140/1‑91 (MQ=255) gAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAg < 2:91405/91‑1 (MQ=255) gAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAg < 1:2637820/91‑1 (MQ=255) gAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAg > 1:3341218/1‑91 (MQ=255) aGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaacccttt < 1:35152‑M2/91‑69 (MQ=255) aGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaacccttt < 1:546717‑M2/91‑69 (MQ=255) ggCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccctttt < 1:1112442‑M2/91‑70 (MQ=255) gCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaacccttttt < 1:2883704‑M2/91‑71 (MQ=255) cAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAg < 2:2196119/91‑1 (MQ=255) aaGGGTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccctttttgg < 2:276976‑M2/91‑73 (MQ=255) aGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTg > 1:1253269/1‑91 (MQ=255) aGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTg > 1:1458609/1‑91 (MQ=255) aGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTg > 1:3536298/1‑91 (MQ=255) aGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTg > 1:660933/1‑91 (MQ=255) aGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTg > 2:861618/1‑91 (MQ=255) aGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTg < 2:2321472/91‑1 (MQ=255) aGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTg < 2:1121347/91‑1 (MQ=255) gggTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGa > 2:3159566/1‑91 (MQ=255) gggTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGa < 1:1768833/91‑1 (MQ=255) ggTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGAt < 2:3883532/91‑1 (MQ=255) gTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGAtt > 1:1675818/1‑91 (MQ=255) aCATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTaa > 1:1059589/1‑91 (MQ=255) aCATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTaa > 1:3656268/1‑91 (MQ=255) aTGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACa < 1:2485768/91‑1 (MQ=255) aTGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGCATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACa > 1:3154182/1‑91 (MQ=255) gATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAACGTAGTGATTAACATa < 1:3312473/91‑1 (MQ=255) gATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATGTTTCTGAATATAGGGGGGATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATa < 1:2233540/91‑1 (MQ=255) aTACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAg > 2:1812321/1‑91 (MQ=255) aCTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGat < 1:258204/91‑1 (MQ=255) aCTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGat > 2:1887905/1‑91 (MQ=255) aCTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGat < 1:732501/91‑1 (MQ=255) tttAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATGACTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGatat > 1:3105836/1‑91 (MQ=255) ttAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATCTAACGGCAATAGCTGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGATAtt > 1:3093841/1‑91 (MQ=255) tAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGATAttt > 2:2873442/1‑91 (MQ=255) tAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGATAttt > 2:2598894/1‑91 (MQ=255) tAGCCTCGTTTGTGATATGCATTTTTCGGAAGATACGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTGTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGATAttt < 1:189456/91‑1 (MQ=255) aGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGATATTTa < 1:234584/91‑1 (MQ=255) | CAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGATATTTA > USA300TCH1516_ALE/1199223‑1199402 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |