| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1404080 | 172 (0.900) | 15 (0.090) | 9/148 | NT | 9.3% | intergenic (+218/‑274) | ysdC_1/trpE | Putative aminopeptidase YsdC/Anthranilate synthase component 1 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1404111 | 132 (0.750) | intergenic (+249/‑243) | ysdC_1/trpE | Putative aminopeptidase YsdC/Anthranilate synthase component 1 | |||||
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
AAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACACCGAGATTAA > USA300TCH1516_ALE/1404022‑1404201 | aaaaCAAGTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATg > 2:3256015‑M2/1‑90 (MQ=255) actttctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagaCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTAtgt > 1:3863209‑M1/53‑91 (MQ=255) aaaCAATTGAATTAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgt > 2:3233651‑M2/1‑89 (MQ=255) aaaCAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgt < 1:1191225‑M2/91‑3 (MQ=255) ctttctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagaCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTAtgtg > 2:308163‑M1/52‑91 (MQ=255) aCAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtgg < 2:1772516‑M2/91‑5 (MQ=255) aCAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtgg > 1:2394850‑M2/1‑87 (MQ=255) aCAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtgg < 2:2427870‑M2/91‑5 (MQ=255) aCAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGCTATgtgg < 2:1772625‑M2/91‑5 (MQ=255) tctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagaCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtggtg > 2:2110911‑M1/49‑91 (MQ=255) aaTTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtggtg > 2:1830061‑M2/1‑85 (MQ=255) ttGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTc < 1:786958/91‑1 (MQ=255) ttGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTc < 1:2911337/91‑1 (MQ=255) gttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagaCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCt > 1:3034511‑M1/46‑91 (MQ=255) ttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagaCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCtt > 1:957967‑M1/45‑91 (MQ=255) gAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCtt > 1:5939/1‑91 (MQ=255) gAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCtt > 2:643462/1‑91 (MQ=255) aaTGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACGGGTATATGCGTTATGTGGTGTCttt > 1:3020203/1‑91 (MQ=255) aaTGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCttt < 1:1872724/91‑1 (MQ=255) aTGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCtttt > 1:1266514/1‑91 (MQ=255) tGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCttttt < 1:284094/91‑1 (MQ=255) aGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTtttat > 2:3696414/1‑91 (MQ=255) ttttGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTtttattt > 1:1104861/1‑91 (MQ=255) ttttGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTtttattt > 2:415027/1‑91 (MQ=255) tGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGa > 2:476862/1‑91 (MQ=255) tGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGa < 1:1265196/91‑1 (MQ=255) aaGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACaa < 1:45416/91‑1 (MQ=255) aaGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACaa < 2:1603905/91‑1 (MQ=255) aaGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACaa < 1:3428379/91‑1 (MQ=255) gTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACaaaa > 1:823429/1‑91 (MQ=255) tGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAAt > 1:3810823/1‑91 (MQ=255) tGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAAt > 1:3403123/1‑91 (MQ=255) aaCATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATgt < 2:329380/91‑1 (MQ=255) aaCATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATgt < 1:1841495/91‑1 (MQ=255) cATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATgtag > 1:655133/1‑91 (MQ=255) gAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGtagtag < 1:3336331/91‑1 (MQ=255) aaTTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTagtagt < 1:1293859/91‑1 (MQ=255) aaTTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTagtagt < 1:2711935/91‑1 (MQ=255) aTTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATGTGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGtt < 1:349148/91‑1 (MQ=255) aTTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGtt < 1:297142/91‑1 (MQ=255) tATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTACATGCGTCATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGttat > 1:405817/1‑90 (MQ=255) aTGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGttaat < 1:1701051/91‑1 (MQ=255) aTGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGttaat < 1:980198/91‑1 (MQ=255) tGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGttaatt < 2:1444483/91‑1 (MQ=255) tGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGttaatt < 2:2093725/91‑1 (MQ=255) gTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTCATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGttaatta > 2:747167/1‑91 (MQ=255) tAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTaaa > 1:2356913/1‑91 (MQ=255) aCTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAgg < 1:273976/91‑1 (MQ=255) cTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGt > 1:1360717/1‑91 (MQ=255) cTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGt > 1:2238088/1‑91 (MQ=255) cTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGt < 2:2840245/91‑1 (MQ=255) cTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGt < 2:3548240/91‑1 (MQ=255) aaGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACGGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAg < 2:3020203/91‑1 (MQ=255) aaGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtggtgccaccttagttaacataattcatgttcactttcaaaactca < 1:3519977‑M2/91‑48 (MQ=255) aGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGc < 1:1456425/91‑1 (MQ=255) aGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGc > 1:2160739/1‑91 (MQ=255) aGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGc > 1:2621012/1‑91 (MQ=255) ggTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCa > 1:3583794/1‑91 (MQ=255) gTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCaa > 2:871224/1‑91 (MQ=255) tGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAAc < 1:1010762/91‑1 (MQ=255) ggCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACa < 1:2601535/91‑1 (MQ=255) gCACCACGGTAACGCGTCCTTACTTGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTAAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTTGCAACAg < 2:3614221/91‑1 (MQ=255) gCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtggtgtcaccttagttaacataattcatgttcactttcaaaactcattcaat < 2:1398595‑M2/91‑54 (MQ=255) gCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAg < 2:1789068/91‑1 (MQ=255) gCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAg > 2:1936468/1‑91 (MQ=255) gCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAg > 2:551906/1‑91 (MQ=255) CACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGa > 2:1708074‑M1/1‑91 (MQ=255) CACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGa > 2:2174284‑M1/1‑91 (MQ=255) ACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGaa < 1:1810420‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAACGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGaa < 1:3113337‑M1/91‑1 (MQ=255) acGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtggtgccacctcagttaacataattcatgttcactttcaatactcattcacttgttt < 2:3702370‑M2/91‑59 (MQ=255) CGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGtt > 2:224873‑M1/1‑91 (MQ=255) CGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTG‑TGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTa < 2:675307‑M1/91‑1 (MQ=255) ggTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtggtgccaccttagttaacataattcatgttcactttcaaaactcattcaattgttttc < 2:799244‑M2/91‑61 (MQ=255) gTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtggtgccaccttagttaacataattcatgttcactttcaaaactcattcaattgttttcc < 1:769410‑M2/91‑62 (MQ=255) tAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGt > 2:3475550/1‑91 (MQ=255) tAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGt < 2:3467183/91‑1 (MQ=255) aCGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtggtgccaccttagttaacataattcatgttcactttcaaaactcattcaattgttttccaaa < 2:1897476‑M2/91‑65 (MQ=255) aCGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTgg > 1:2257915/1‑91 (MQ=255) cgcgTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGga < 2:67690/91‑1 (MQ=255) cgcgTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGga < 1:2078767/91‑1 (MQ=255) cgcgTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGga < 1:1326039/91‑1 (MQ=255) tACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGa < 1:2189442/91‑1 (MQ=255) cAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTAATGAGACAAAATGTAGTAGTGAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAAc < 2:1130449/91‑1 (MQ=255) ggTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTa > 1:1526796/1‑91 (MQ=255) ggTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTa < 1:1936468/91‑1 (MQ=255) atGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACAcc < 2:2743468/91‑1 (MQ=255) atGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACAcc < 2:2530408/91‑1 (MQ=255) atGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACAcc < 2:2126959/91‑1 (MQ=255) tGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACACCg < 2:1119711/91‑1 (MQ=255) tGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACACCg > 2:1525509/1‑91 (MQ=255) tGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACACCg > 2:1782040/1‑91 (MQ=255) cGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACACCgag < 1:1566150/91‑1 (MQ=255) gTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACACCgaga > 1:1986416/1‑91 (MQ=255) ttATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACACCGAGAt > 1:526616/1‑91 (MQ=255) tactgtggtgccaccttagttaacataattcatgttcactttcaaaactcattcaattgttttccaaagtccaattcacaagatatggcgt < 2:2645693‑M2/88‑88 (MQ=255) tATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACACCGAGAtt < 1:313128/91‑1 (MQ=255) tATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACACCGAGAtt < 1:3274820/91‑1 (MQ=255) aTGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACACCGAGATTa > 1:115776/1‑91 (MQ=255) tgtgGTGTCTTTTTATTTTGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACACCGAGATTaa > 2:2308206/1‑91 (MQ=255) | AAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACACCGAGATTAA > USA300TCH1516_ALE/1404022‑1404201 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |