New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1507967 = | 183 (0.960) | 25 (0.160) | 15/128 | NT | 17.2% | intergenic (‑392/+83) | ald1/ypcP | Alanine dehydrogenase 1/5'‑3' exonuclease |
? | USA300TCH1516_ALE | 1508010 = | 95 (0.630) | intergenic (‑435/+40) | ald1/ypcP | Alanine dehydrogenase 1/5'‑3' exonuclease |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
TATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTCATGTTCGTT > USA300TCH1516_ALE/1507921‑1508100 | tatcAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTtat < 2:1354772/91‑1 (MQ=255) tatcAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTtat > 2:1176515/1‑91 (MQ=255) atcAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGTAAAAAGACTATTTCTACCTTGTGTCGATAGAAATAGTCTTTTtata < 1:3071272/91‑1 (MQ=255) ttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATAc > 1:2163100‑M1/45‑91 (MQ=255) cAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACt < 1:2402836/91‑1 (MQ=255) aaaTTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTa > 1:499539/1‑91 (MQ=255) aaTTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTaa > 2:844781/1‑91 (MQ=255) aTTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAAt < 1:3341986/91‑1 (MQ=255) tCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTg > 2:1373949/1‑91 (MQ=255) cGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTgg < 2:2194756/91‑1 (MQ=255) cGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTgg > 2:290351/1‑91 (MQ=255) ggCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGt < 1:3543199/91‑1 (MQ=255) ggCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGt < 2:2376194/91‑1 (MQ=255) cTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGttt > 1:432610/1‑91 (MQ=255) cTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGttt < 2:3669995/91‑1 (MQ=255) tattCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAAtttt < 2:1489376/91‑1 (MQ=255) attCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAAttttt < 2:941787/91‑1 (MQ=255) attCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTATATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAAttttt > 2:3475514/1‑91 (MQ=255) tCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCa < 1:293181/91‑1 (MQ=255) tCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCa < 1:2774131/91‑1 (MQ=255) gtctctGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCAt < 2:1580418/89‑1 (MQ=255) tctGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATaaa > 2:525175/1‑91 (MQ=255) gACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATc < 2:3885610/91‑1 (MQ=255) gACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATc > 1:1906607/1‑91 (MQ=255) aCATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCt > 2:1710008/1‑91 (MQ=255) aCATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCt > 2:3678605/1‑91 (MQ=255) aCATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCt > 1:3025486/1‑91 (MQ=255) atatCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTta > 1:1608406/1‑91 (MQ=255) tatCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTtat < 1:2012879/91‑1 (MQ=255) atCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTtata < 1:1369443/91‑1 (MQ=255) aaaTACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑ttt < 1:841649/91‑1 (MQ=255) aaTACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑tttt < 1:1228361/91‑1 (MQ=255) aaTACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑tttt < 1:2224924/91‑1 (MQ=255) tACGCAAAAAGACAATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTa < 2:3307803/91‑1 (MQ=255) agtataaaaagactatttctatcgatacaaggtagaaatagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTa > 1:1386366‑M2/49‑91 (MQ=255) cGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTaaa > 1:1608292/1‑91 (MQ=255) cGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTaaa < 1:576418/91‑1 (MQ=255) gCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTaaaa > 1:1298426/1‑91 (MQ=255) gCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTaaaa > 2:2280585/1‑91 (MQ=255) ataaaaagactatttctatcgatacaaggtagaaatagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTaaaa > 1:941032‑M2/46‑91 (MQ=255) AAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAAt < 2:3173981‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAAt > 1:3686666‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCa > 1:1106616‑M1/1‑66 (MQ=255) AAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATg < 1:3229363‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATgg < 2:2354411‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATgg > 1:3447297‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATgg < 1:1662707‑M1/91‑1 (MQ=255) agattatttctatcgatccaaggtagaaatagtcttcttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAAtgggg > 2:3442692‑M2/40‑90 (MQ=255) AGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGa > 1:3419489‑M1/1‑91 (MQ=255) gactatttctatcgatacaaggtagaaatagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGAt > 2:1967121‑M2/39‑91 (MQ=255) ctatttctatcgatacaaggtagaaatagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGa > 2:2395464‑M2/37‑91 (MQ=255) CTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTACAC‑TTTTTAAAAATGGGATGa < 1:2533730‑M1/91‑1 (MQ=255) TATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGaa < 1:894141‑M1/91‑1 (MQ=255) ttttctatcgattcaaggtagaaatagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGaaa < 2:1066315‑M2/57‑1 (MQ=255) ATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGaaa > 2:3617574‑M1/1‑91 (MQ=255) ATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGaaa > 2:2470582‑M1/1‑91 (MQ=255) ATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGaaa < 2:730291‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGaaa > 2:201296‑M1/1‑91 (MQ=255) ATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTATATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGaaa < 2:3804446‑M1/91‑1 (MQ=255) TTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAat > 2:1447236‑M1/1‑91 (MQ=255) TTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAata > 1:2186570‑M1/1‑91 (MQ=255) ctatcgatacaaggtagaaatagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAatata > 1:2221646‑M2/31‑91 (MQ=255) ctatcgatacaaggtagaaatagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAatata > 1:1008606‑M2/31‑91 (MQ=255) CTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAatata > 2:1568478‑M1/1‑91 (MQ=255) TACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAatatat < 1:1366666‑M1/91‑1 (MQ=255) atcgatacaaggtagaaatagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATAtt > 2:3093578‑M2/29‑91 (MQ=255) ACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATAtt < 2:2227599‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATAtt < 1:2836498‑M1/91‑1 (MQ=255) ttGTATCGATAGAAATAGTCTTTCTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTAGAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTc < 2:2965045/91‑1 (MQ=255) gTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCt > 1:2271082/1‑91 (MQ=255) gTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCt < 1:3523397/91‑1 (MQ=255) gTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCt > 1:1408789/1‑91 (MQ=255) aTCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGa > 1:1337010/1‑91 (MQ=255) tCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAAt < 1:988262/68‑1 (MQ=255) gATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAAc > 2:2139846/1‑91 (MQ=255) gATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAAc < 1:2730913/91‑1 (MQ=255) gATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAAc > 1:2882199/1‑91 (MQ=255) aTAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑ATATAAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACa < 2:2985324/91‑1 (MQ=255) tagaaatagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACAt > 2:2570284‑M2/17‑91 (MQ=255) tagaaatagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACAt > 1:2036688‑M2/17‑91 (MQ=255) aatagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTaa > 2:3304624‑M2/13‑91 (MQ=255) aatagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTaa > 2:1108575‑M2/13‑91 (MQ=255) aatagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTaa < 1:1344424‑M2/79‑1 (MQ=255) atagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAAt < 1:678722‑M2/80‑1 (MQ=255) atagtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAAt > 2:596762‑M2/12‑91 (MQ=255) agtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCTTATTATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTc > 2:1855463‑M2/10‑91 (MQ=255) agtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTc > 2:1851269‑M2/10‑91 (MQ=255) agtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTc < 2:3191652‑M2/82‑1 (MQ=255) agtctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTc > 2:2546989‑M2/10‑91 (MQ=255) tctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTCAt < 1:1637503‑M2/84‑1 (MQ=255) tctttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTCAt < 2:2782011‑M2/84‑1 (MQ=255) tttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTCATGt < 2:2342472‑M2/86‑1 (MQ=255) ttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATTTTATACTTTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTCATGt < 1:377312‑M2/87‑1 (MQ=255) ttttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTCATGtt > 1:186925‑M2/5‑91 (MQ=255) tttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTCATGTTc > 2:3395197‑M2/4‑91 (MQ=255) tttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTCATGTTc < 1:2280585‑M2/88‑1 (MQ=255) ttATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTCATGTTCg < 2:3522418‑M2/89‑1 (MQ=255) tATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTCATGTTCGt < 1:2267838‑M2/90‑1 (MQ=255) tATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTCATGTTCGt < 2:174431‑M2/90‑1 (MQ=255) ataCTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTCATGTTCGtt < 1:290351/91‑1 (MQ=255) | TATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATAC‑TTTTTAAAAATGGGATGAAATATATTTTCCTGAAACATGTAATTCATGTTCGTT > USA300TCH1516_ALE/1507921‑1508100 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |