New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1853635 = | 205 (1.080) | 17 (0.100) | 10/144 | NT | 8.9% | intergenic (+38/+60) | acuC/ccpA | Acetoin utilization protein AcuC/Catabolite control protein A |
? | USA300TCH1516_ALE | 1853683 = | 162 (0.950) | intergenic (+86/+12) | acuC/ccpA | Acetoin utilization protein AcuC/Catabolite control protein A |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
AATAAGTAACCTAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCTTTTCATCGTTCATATAT > USA300TCH1516_ALE/1853593‑1853773 | gaattgaataccgaggaactacaaaataaattcacaaaattAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTaa > 1:2815491‑M1/42‑91 (MQ=255) tAAGTAACCTAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAAt < 2:1805665/91‑1 (MQ=255) tAAGTAACCTAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAAt > 1:201377/1‑91 (MQ=255) aGTAACCTAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAAttt > 2:3114735/1‑91 (MQ=255) aGTAACCTAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAAttt > 1:633159/1‑91 (MQ=255) tAACCTAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTtg < 2:3077842/91‑1 (MQ=255) tAACCTAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTtg > 1:670834/1‑91 (MQ=255) aaCCTAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTtgt < 1:112808/91‑1 (MQ=255) aaCCTAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTtgt < 1:1379806/91‑1 (MQ=255) aaCCTAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTtgt > 1:95585/1‑91 (MQ=255) aCCTAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTtgtg < 1:3382207/91‑1 (MQ=255) aCCTAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTtgtg > 1:1863204/1‑91 (MQ=255) cTAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGaa < 2:2465816/91‑1 (MQ=255) tAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAat < 1:930845/91‑1 (MQ=255) tAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAat < 1:3821690/91‑1 (MQ=255) aaTCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAatt > 1:3647963/1‑91 (MQ=255) aaTCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAatt > 2:3791048/1‑91 (MQ=255) aaTCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAatt < 2:2093642/91‑1 (MQ=255) aaTCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAatt > 1:282155/1‑91 (MQ=255) cTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAatttat > 2:1586001/1‑91 (MQ=255) cAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTAtttt > 1:3446807/1‑91 (MQ=255) aCGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACGCCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGt > 1:3282772/1‑91 (MQ=255) aCGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGt > 2:1117943/1‑91 (MQ=255) aCGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGt < 1:3218866/91‑1 (MQ=255) cGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTa < 2:2872539/91‑1 (MQ=255) gATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAg > 2:824377/1‑91 (MQ=255) tttAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTc > 2:2938796/1‑91 (MQ=255) tttAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTc > 2:3530783/1‑91 (MQ=255) tttAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTc > 2:3520458/1‑91 (MQ=255) ttAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTcc > 2:2278522/1‑91 (MQ=255) ttAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTcc < 2:3739649/91‑1 (MQ=255) tAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCt > 1:30704/1‑91 (MQ=255) tAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAAGTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTccc > 2:3181900/1‑90 (MQ=255) aaaaGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTc > 2:2926877/1‑91 (MQ=255) aaaaGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTc > 2:2617847/1‑91 (MQ=255) aaaaGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTc < 2:3208167/91‑1 (MQ=255) aaaGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCg > 1:209672/1‑91 (MQ=255) aGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGt > 2:3635676/1‑91 (MQ=255) taaataaaAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTAtt > 2:1956609/1‑91 (MQ=255) aaataaaAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTc < 2:384738/91‑1 (MQ=255) aaataaaAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTc < 1:408884/91‑1 (MQ=255) aataaaAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCa > 2:429217/1‑91 (MQ=255) ataaaAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCaa < 2:2651901/91‑1 (MQ=255) taaaAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAAt > 2:3560922/1‑91 (MQ=255) taaaAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAAt > 2:1037480/1‑91 (MQ=255) attaggcattcatctaacgacccaaattatatgggtgttggaagaatgcctAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAAtt > 2:1217312‑M2/52‑91 (MQ=255) aaaaGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAAtt > 2:1656207/1‑91 (MQ=255) aaGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCt < 1:1413481/91‑1 (MQ=255) aaGGCATTCCTCCAACACCCCAATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTCATTTTGTGAATATATTTTTTAGTTCCTCGGTATTCAATTCt > 1:3799163/1‑91 (MQ=255) AGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCtg < 1:772938‑M1/91‑1 (MQ=255) ggcattcatctaacgacccacattatatgggtgttggaagaatgcctAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCtgt > 2:174731‑M2/48‑91 (MQ=255) gcattcatctaacgacccaaattatatgggtgttggaagaatgcctAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCtgtg > 2:2309557‑M2/47‑91 (MQ=255) gcattcatctaacgacccaaattatatgggtgttggaagaatgcctAATTTTGTGAAATTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCtgtg > 1:3178803‑M2/47‑91 (MQ=255) cattcatctaacgacccaaattatatgggtgttggaagaatgcctAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGa > 1:8115‑M2/46‑91 (MQ=255) ATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAg < 2:1407277‑M1/91‑1 (MQ=255) TTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAgg > 1:3135025‑M1/1‑91 (MQ=255) TCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGt > 2:2802900‑M1/1‑91 (MQ=255) ttcCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTaa > 2:366682/1‑91 (MQ=255) ccAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTaaaa > 2:1584415/1‑91 (MQ=255) taacgacccaaattatatgggtgttggaagaatgcctAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAAc > 1:3011476‑M2/38‑91 (MQ=255) cAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAAc < 1:1067617/91‑1 (MQ=255) acacCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTa < 1:757756/91‑1 (MQ=255) cacCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTAc < 1:1903405/91‑1 (MQ=255) cccATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACAt < 2:735367/91‑1 (MQ=255) cATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACAttt < 1:1689386/91‑1 (MQ=255) atatAATTTGGGTCGTTAGATGAATGACTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTg > 2:2209658/1‑91 (MQ=255) tataATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTgg > 2:50051/1‑91 (MQ=255) tataATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTgg < 1:1219406/91‑1 (MQ=255) ataATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGt > 2:658740/1‑91 (MQ=255) taATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGtt > 1:2793520/1‑91 (MQ=255) aaTTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGttc > 2:2427920/1‑91 (MQ=255) aTTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGttct < 1:2560807/91‑1 (MQ=255) aTTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGttct < 2:2639807/91‑1 (MQ=255) aTTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGttct < 2:3412725/91‑1 (MQ=255) ttGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGttcttc < 2:2403018/91‑1 (MQ=255) ttGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGttcttc < 1:3413724/91‑1 (MQ=255) gTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATc > 1:1123253/1‑91 (MQ=255) tCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCt < 1:1275178/91‑1 (MQ=255) tCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCt > 1:3706414/1‑91 (MQ=255) cGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTGGGTATTCAGTTCGGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCtt < 1:3091414/91‑1 (MQ=255) cGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCtt > 1:1891323/1‑91 (MQ=255) gTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCttt < 1:1657216/91‑1 (MQ=255) gTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCttt > 2:2716410/1‑91 (MQ=255) gTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCttt < 1:2617847/91‑1 (MQ=255) ttAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCtttt < 2:2469244/91‑1 (MQ=255) ttAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCtttt > 2:2170597/1‑91 (MQ=255) gATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAATTACATTTGGTTCTTCTATCTTTTCAt > 2:3826399/1‑91 (MQ=255) aTGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCTTTTCATc < 1:383180/91‑1 (MQ=255) gaatgcctAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGtt > 2:2594484‑M2/9‑73 (MQ=255) gaatgcctAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGtt < 1:2594484‑M2/65‑1 (MQ=255) atgcctAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCTTTTCATCGTTc > 2:2499670‑M2/7‑91 (MQ=255) gcctAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCTTTTCATCGTTCat < 2:1484752‑M2/87‑1 (MQ=255) gcctAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCTTTTCATCGTTCat < 1:234797‑M2/87‑1 (MQ=255) cctAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCTTTTCATCGTTCata > 1:2767549‑M2/4‑91 (MQ=255) ctAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCTTTTCATCGTTCatat > 2:561327‑M2/3‑91 (MQ=255) ctAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCTTTTCATCGTTCatat > 1:3530845‑M2/3‑91 (MQ=255) ctAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCTTTTCATCGTTCatat > 1:509660‑M2/3‑91 (MQ=255) tAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCTTTTCATCGTTCatata > 1:2389205‑M2/2‑91 (MQ=255) aaTTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCTTTTc > 1:1529079/1‑78 (MQ=255) aaTTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCTTTTCATCGTTCatatat < 2:872718/91‑1 (MQ=255) | AATAAGTAACCTAATCTGCAACGATTTTAAAAGATAAATAAAAGGCATTCTTCCAACACCCATATAATTTGGGTCGTTAGATGAATGCCTAATTTTGTGAATTTATTTTGTAGTTCCTCGGTATTCAATTCTGTGAGGTAAAACTACATTTGGTTCTTCTATCTTTTCATCGTTCATATAT > USA300TCH1516_ALE/1853593‑1853773 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |