New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1933839 = | 213 (1.120) | 10 (0.060) | 7/142 | NT | 5.5% | coding (1409/3816 nt) | USA300HOU_RS09605 | hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 1933862 = | 158 (0.940) | coding (1386/3816 nt) | USA300HOU_RS09605 | hypothetical protein |
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
GTCGTTCATTAATTCAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTACACAGTACTCACAC > USA300TCH1516_ALE/1933772‑1933952 | gTCGTTCATTAATTCAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTa < 1:1986630/91‑1 (MQ=255) tCGTTCATTAATTCAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTaa > 1:2391599/1‑91 (MQ=255) cGTTCATTAATTCAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAat < 2:2890402/91‑1 (MQ=255) cGTTCATTAATTCAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAat > 2:1866534/1‑91 (MQ=255) gTTCATTAATTCAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAata > 2:3101159/1‑91 (MQ=255) ttCATTAATTCAACTAATCCTTTTATTACTTTTTTTTCAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAatat > 2:3529220/1‑91 (MQ=255) aTTAATTCAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAGATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTa < 2:1761074/91‑1 (MQ=255) aTTAATTCAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTa < 1:3477689/91‑1 (MQ=255) ttAATTCAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTAc > 1:3762857/1‑91 (MQ=255) tAATTTAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACt < 1:2955466/91‑1 (MQ=255) tAATTCAACTAGTCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATCGTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACt < 2:1162228/91‑1 (MQ=255) aTTCAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGt > 1:3472207/1‑91 (MQ=255) aTTCAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGt < 1:3647396/91‑1 (MQ=255) tCAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCt > 2:111154/1‑91 (MQ=255) cAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCtt < 1:2568189/91‑1 (MQ=255) aaactataagtgttgcagagctatttacaaatgttcttaagacagtaaatattaatttatcttccttagataaattAATATTTACTGTCtt < 1:1590719‑M2/15‑1 (MQ=255) cTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAg < 1:1561761/91‑1 (MQ=255) cTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATATATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAg < 2:2552233/91‑1 (MQ=255) tcaTCCTGTTATTACTTTTTGTACAACAGTGATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGa < 2:539728/89‑1 (MQ=255) aaTCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCATATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTtaataa > 2:3862423/1‑91 (MQ=255) tCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACa > 1:1366933/1‑91 (MQ=255) cTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACAtt > 2:797170/1‑91 (MQ=255) tttATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTg > 2:2010431/1‑91 (MQ=255) tttATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTg < 1:3874553/91‑1 (MQ=255) tgcagagctatttacaaatgttcttaagacagtaaatattAATTTATCTAAGGAAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTa < 1:2902468‑M1/51‑1 (MQ=255) tattaCTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTa < 1:1545877/91‑1 (MQ=255) tattaCTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTa > 2:3054401/1‑91 (MQ=255) tattaCTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTa > 2:2159739/1‑91 (MQ=255) tattaCTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTa < 2:2849781/91‑1 (MQ=255) attaCTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTaa < 1:1552710/91‑1 (MQ=255) attaCTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTaa < 1:1131055/91‑1 (MQ=255) attaCTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTaa < 2:2083481/91‑1 (MQ=255) ttaCTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTaaa < 2:1601739/91‑1 (MQ=255) ttaCTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTaaa < 2:378036/91‑1 (MQ=255) ttaCTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTaaa < 2:2583877/91‑1 (MQ=255) aCTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATa < 1:2251723/91‑1 (MQ=255) aCTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATa < 1:2015412/91‑1 (MQ=255) cTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAg > 1:1889370/1‑91 (MQ=255) cTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAg > 2:1402300/1‑91 (MQ=255) tttttGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGc > 2:2061853/1‑91 (MQ=255) ttttGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGct < 1:2224288/91‑1 (MQ=255) ttttGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGct < 1:996713/91‑1 (MQ=255) tttGTACTTCATTAATATTTTTATCAAAATCATATTTATTTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGATTATTTGTAAATAGctc < 2:3666447/91‑1 (MQ=255) gTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGc < 2:304833/91‑1 (MQ=255) tACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCa < 2:775690/91‑1 (MQ=255) tACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCa > 1:1038518/1‑91 (MQ=255) acaacaTTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCaa < 2:2669146/91‑1 (MQ=255) aacaTTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAaca < 2:1884252/91‑1 (MQ=255) acaTTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAacac < 1:1187855/91‑1 (MQ=255) caTTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACt < 2:467362/91‑1 (MQ=255) ttAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTta < 1:1437577/91‑1 (MQ=255) tAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTtat < 2:1055546/91‑1 (MQ=255) tatTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGt > 2:3268938/1‑91 (MQ=255) atTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGtt > 1:1378621/1‑91 (MQ=255) ttttATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTg < 2:2730980/91‑1 (MQ=255) tttATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTgg < 1:1721295/91‑1 (MQ=255) ttATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGt < 1:1732960/91‑1 (MQ=255) ttATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGt < 1:1310862/91‑1 (MQ=255) tATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTTTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTc < 2:2149210/91‑1 (MQ=255) cagtaaatattAATTTATCTAAGGAAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTc < 1:1495615‑M1/80‑1 (MQ=255) atcaaaatcaaaTTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCa < 2:1959874/91‑1 (MQ=255) aaatattAATTTATCTAAGGAAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAAt < 1:553913‑M1/84‑1 (MQ=255) aaatcaaaTTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCCACACTTATAGTTTGGTCAAAtt > 2:24001/1‑91 (MQ=255) aaatcaaaTTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAAtt > 2:23002/1‑91 (MQ=255) aaatcaaaTTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAAtt < 1:2683244/91‑1 (MQ=255) tattaatttatctaaggaagataaattAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTcc > 2:2475734‑M2/28‑91 (MQ=255) atcaaaTTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTcc > 1:3185168/1‑91 (MQ=255) atcaaaTTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTcc < 1:75012/91‑1 (MQ=255) tcaaaTTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCt < 1:2343282/91‑1 (MQ=255) tcaaaTTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCt > 2:397436/1‑91 (MQ=255) aaaTTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTa < 2:1187478/91‑1 (MQ=255) atttatctaaggaagataaattAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTaaa > 2:3404011‑M2/23‑91 (MQ=255) atttatctaaggaagataaattAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTaaa > 2:1932793‑M2/23‑91 (MQ=255) TTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACt > 1:838252‑M1/1‑66 (MQ=255) TTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAat > 1:1262537‑M1/1‑91 (MQ=255) TTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAat > 1:3101159‑M1/1‑91 (MQ=255) TTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAat < 2:1035597‑M1/91‑1 (MQ=255) TTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAat < 1:72342‑M1/91‑1 (MQ=255) TTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAat < 2:262421‑M1/91‑1 (MQ=255) TTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAatt < 2:2471611‑M1/91‑1 (MQ=255) TTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAatt < 2:1598268‑M1/91‑1 (MQ=255) ATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAattta > 1:797170‑M1/1‑91 (MQ=255) TCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAatttat < 2:739449‑M1/91‑1 (MQ=255) tCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAAtttattta < 2:2220668/91‑1 (MQ=255) ccTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAAt > 1:495427/1‑74 (MQ=255) ccTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTac < 2:3503298/91‑1 (MQ=255) ccTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTac > 1:2078381/1‑91 (MQ=255) cTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTaca < 1:3814446/91‑1 (MQ=255) ttAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTacac < 1:3835135/91‑1 (MQ=255) ttAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTacac < 2:1745091/91‑1 (MQ=255) agataaattAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTACACAg < 2:587502‑M2/82‑1 (MQ=255) gataaattAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTACACAGt > 2:2384918‑M2/9‑91 (MQ=255) taaattAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTACACAGTAc > 2:1296153‑M2/7‑91 (MQ=255) aaattAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATTGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTACACAGTACt < 2:3832427‑M2/86‑1 (MQ=255) attAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTACACAGTACTca > 2:2194320‑M2/4‑91 (MQ=255) attAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTACACAGTACTca < 1:2589236‑M2/88‑1 (MQ=255) ttAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTACACAGTACTcac < 1:3213673‑M2/89‑1 (MQ=255) tAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTACACAGTACTcaca > 2:1363870‑M2/2‑91 (MQ=255) tAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTACACAGTACTcaca < 1:914488‑M2/90‑1 (MQ=255) aaTATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTACACAGTACTcacac < 1:3673520/91‑1 (MQ=255) | GTCGTTCATTAATTCAACTAATCCTTTTATTACTTTTTGTACAACATTAATATTTTTATCAAAATCAAATTTATCTTCCTTAGATAAATTAATATTTACTGTCTTAAGAACATTTGTAAATAGCTCTGCAACACTTATAGTTTGGTCAAATTCCTTAAATTTATTTACACAGTACTCACAC > USA300TCH1516_ALE/1933772‑1933952 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |