BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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*	?	USA300TCH1516_ALE	2055574 =	186 (0.980)	10 (0.060)	8/142	NT	5.9%	intergenic (‑715/‑146)	purB/sspP	Adenylosuccinate lyase/Staphopain A
*	?	USA300TCH1516_ALE	2055599 =	152 (0.900)	10 (0.060)	8/142	NT	5.9%	intergenic (‑740/‑121)	purB/sspP	Adenylosuccinate lyase/Staphopain A

Only 100 of 247 total aligned reads displayed.

TCAAAATCGACTAATATATTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACTAAATTTAATATAAT  >  USA300TCH1516_ALE/2055509‑2055689

tCAAAATCGACTAATATATTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAatta                                                                                            >  1:3757831/1‑91 (MQ=255)

  atataaaattttaatctatgtttaaaaaataattaatttttacacattatcagtttatgtaatAATTTAGTAAATAAGCTACTAAattatt                                                                                          >  1:3011308‑M1/64‑91 (MQ=255)

   tataaaattttaatctatgtttaaaaaataattaatttttacacattatcagtttatgtaataatttagtaaataagctactaaattatta                                                                                         <  1:2395717‑M2/4‑1 (MQ=255)

   tataaaattttaatctatgtttaaaaaataattaatttttacacattatcagtttatgtaataatttagtaaataagctactaaattatta                                                                                         <  1:2394958‑M2/4‑1 (MQ=255)

   aaaTCGACTAATATATTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAAttatta                                                                                         <  1:1306099/91‑1 (MQ=255)

   aaaTCGACTAATATATTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAAttatta                                                                                         >  1:1798629/1‑91 (MQ=255)

    aaTCGACTAATATATTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTAc                                                                                        <  1:171326/91‑1 (MQ=255)

      tCGACTAATATATTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACAt                                                                                      >  1:1282648/1‑91 (MQ=255)

        gACTAATATATTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATaa                                                                                    <  1:2683706/91‑1 (MQ=255)

        gACTAATATATTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATaa                                                                                    <  1:2339763/91‑1 (MQ=255)

        gACTAATATATATTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATaa                                                                                    <  1:3519517/91‑1 (MQ=255)

          ttttaatctatgtttaaaaaataattaatttttacacattatcagtttatgtaataatttagtaaataagctactaaattATTACATAAAc                                                                                  <  1:1624973‑M2/11‑1 (MQ=255)

          cTAATATATTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGGTGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAAc                                                                                  <  1:1505104/91‑1 (MQ=255)

          cTAATATATTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAAc                                                                                  <  1:2940256/91‑1 (MQ=255)

          cTAATATATTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAAc                                                                                  >  1:3779419/1‑91 (MQ=255)

          cTAATATATTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAAc                                                                                  >  1:852477/1‑91 (MQ=255)

            aaTATATTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTg                                                                                >  1:3761701/1‑91 (MQ=255)

             atatatTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGa                                                                               >  2:813648/1‑91 (MQ=255)

             atatatTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGa                                                                               >  2:2744599/1‑91 (MQ=255)

                   atgtttaaaaaataattaatttttacacgttatcagtttatgtaatAATTTAGTAGCTTATTTACTAAATTATTACATAAACTGATAAtgt                                                                         <  1:2391352‑M1/45‑1 (MQ=255)

                    ttCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAAtgtg                                                                        >  1:1550007/1‑91 (MQ=255)

                      cATGAAGCTGTCGATCATATTAACTATTGAATGATATGTTTGCAAGTTAGTAAAGAAGCAACTAAAGTATTACATAAACTGAGAATGTGTa                                                                      <  2:2922576/91‑1 (MQ=255)

                               ttCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAaattaat                                                             <  1:1064780/91‑1 (MQ=255)

                                tCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAaattaatt                                                            <  1:940322/91‑1 (MQ=255)

                                tCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAaattaatt                                                            >  1:2610849/1‑91 (MQ=255)

                                tCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAaattaatt                                                            >  2:2604957/1‑91 (MQ=255)

                                tCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAaattaatt                                                            <  1:939954/91‑1 (MQ=255)

                                tCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAaattaat                                                             <  1:1211783/90‑1 (MQ=255)

                                tCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAaattaat                                                             >  2:1211473/1‑90 (MQ=255)

                                 cGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAattaatta                                                           <  2:2104113/91‑1 (MQ=255)

                                   aTCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAattatt                                                         >  2:1275131/1‑91 (MQ=255)

                                   aTCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAattatt                                                         >  1:3694465/1‑91 (MQ=255)

                                   aTCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAattatt                                                         >  1:970683/1‑91 (MQ=255)

                                   aTCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAattatt                                                         >  2:2356982/1‑91 (MQ=255)

                                   aTCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAattatt                                                         <  1:1653187/91‑1 (MQ=255)

                                    tCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTAttt                                                        <  1:1688887/91‑1 (MQ=255)

                                     cATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTAtttt                                                       <  2:459599/91‑1 (MQ=255)

                                      atatTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTAttttt                                                      <  1:2553174/91‑1 (MQ=255)

                                         ttaattaTTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTaa                                                   >  2:1673540/1‑91 (MQ=255)

                                         ttaattaTTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTaa                                                   >  2:2551294/1‑91 (MQ=255)

                                            attattGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACa                                                >  1:1534482/1‑91 (MQ=255)

                                              tattGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATa                                              <  2:3278337/91‑1 (MQ=255)

                                               attGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAg                                             <  2:2436161/91‑1 (MQ=255)

                                                 tGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGAt                                           <  1:1719753/91‑1 (MQ=255)

                                                 tGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGAt                                           >  1:3656112/1‑91 (MQ=255)

                                                 tGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGAt                                           <  2:562219/91‑1 (MQ=255)

                                                  gAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGAtt                                          <  1:3191196/91‑1 (MQ=255)

                                                    aTGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTaa                                        >  1:2040643/1‑91 (MQ=255)

                                                     tGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTaaa                                       >  2:1379475/1‑91 (MQ=255)

                                                     agtttatgtaatAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTAATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTaaa                                       >  2:3553090‑M1/13‑91 (MQ=255)

                                                       agaTGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAAt                                     <  2:3621459/91‑1 (MQ=255)

                                                        gaTGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAAtt                                    <  2:1798629/91‑1 (MQ=255)

                                                          tGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAAtttt                                  <  1:1208522/91‑1 (MQ=255)

                                                          tGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAAtttt                                  <  2:681100/91‑1 (MQ=255)

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                                                            tttGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTtat                                >  2:2675755/1‑91 (MQ=255)

                                                            tttGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTtat                                >  2:1072434/1‑91 (MQ=255)

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                                                             taatAATTTAGTAGCTTATTTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTtata                               <  1:2743201‑M1/87‑1 (MQ=255)

                                                              tGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTatat                              <  2:1861629/91‑1 (MQ=255)

                                                                cAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTACAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTg                            >  2:3402589/1‑91 (MQ=255)

                                                                 AATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGa                           >  2:377221‑M1/1‑91 (MQ=255)

                                                                 AATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGa                           <  1:658319‑M1/91‑1 (MQ=255)

                                                                 AATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGa                           <  1:206275‑M1/91‑1 (MQ=255)

                                                                  ATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGaa                          <  2:146406‑M1/91‑1 (MQ=255)

                                                                    TTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAAc                        <  2:1974336‑M1/91‑1 (MQ=255)

                                                                     tagtagcttatttactaaattATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAAct                       >  1:2293275‑M2/22‑91 (MQ=255)

                                                                     TAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAAct                       >  2:890795‑M1/1‑91 (MQ=255)

                                                                     TAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAAct                       >  2:1438123‑M1/1‑91 (MQ=255)

                                                                     TAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAAct                       <  1:1601704‑M1/91‑1 (MQ=255)

                                                                     TAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAAct                       <  1:192972‑M1/91‑1 (MQ=255)

                                                                     TAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAAct                       >  1:3029558‑M1/1‑91 (MQ=255)

                                                                      AGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAActc                      <  2:2988113‑M1/91‑1 (MQ=255)

                                                                       gtagcttatttactaaattATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAActct                     >  2:95816‑M2/20‑91 (MQ=255)

                                                                       gtagcttatttactaaattATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAActct                     >  1:827824‑M2/20‑91 (MQ=255)

                                                                        TAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCtt                    <  2:2795089‑M1/91‑1 (MQ=255)

                                                                        TAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCtt                    >  1:3808‑M1/1‑91 (MQ=255)

                                                                         AAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTa                   <  2:2848290‑M1/91‑1 (MQ=255)

                                                                         AAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTa                   >  1:473714‑M1/1‑91 (MQ=255)

                                                                          aaTAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTaa                  <  1:1918610/91‑1 (MQ=255)

                                                                           aTAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAAc                 <  2:1329622/91‑1 (MQ=255)

                                                                           aTAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAAc                 >  2:1258127/1‑91 (MQ=255)

                                                                           aTAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAAc                 <  1:588806/91‑1 (MQ=255)

                                                                           aTAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAAc                 <  2:676625/91‑1 (MQ=255)

                                                                           aTAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAAc                 <  1:2772600/91‑1 (MQ=255)

                                                                           aTAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAAc                 <  1:1705557/91‑1 (MQ=255)

                                                                           aTAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAAc                 <  2:2055362/91‑1 (MQ=255)

                                                                            tAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACt                >  1:1022481/1‑91 (MQ=255)

                                                                            tAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACt                >  2:754178/1‑91 (MQ=255)

                                                                             aaGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACTa               >  2:3366817/1‑91 (MQ=255)

                                                                             aaGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACTa               >  1:3406451/1‑91 (MQ=255)

                                                                              aGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACTaa              <  1:2470201/91‑1 (MQ=255)

                                                                                ctactaAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACTAAAt            >  2:3671558/1‑91 (MQ=255)

                                                                                   ctaaattATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACTAAATTTa         >  2:3535314‑M2/8‑91 (MQ=255)

                                                                                   ctaaattATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACTAAATTTa         >  2:3443201‑M2/8‑91 (MQ=255)

                                                                                     aaattATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACTAAATTTAat       <  1:2141075‑M2/86‑1 (MQ=255)

                                                                                      aattATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACTAAATTTAata      >  1:3148062‑M2/5‑91 (MQ=255)

                                                                                       attATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACTAAATTTAatat     <  1:2719488‑M2/88‑1 (MQ=255)

                                                                                        ttATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACTAAATTTAAtata    <  2:1598028‑M2/89‑1 (MQ=255)

                                                                                          attaCATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACTAAATTTAATATAat  <  1:2898522/91‑1 (MQ=255)

TCAAAATCGACTAATATATTTTCATGAAACTTTCGATCATATTAATTATTGAATGAGATGTTTGCAATTTAGTAAATAAGCTACTAAATTATTACATAAACTGATAATGTGTAAAAATTAATTATTTTTTAAACATAGATTAAAATTTTATATTGAAACTCTTAACTAAATTTAATATAAT  >  USA300TCH1516_ALE/2055509‑2055689

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.