New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2349040 | 176 (0.920) | 22 (0.130) | 15/146 | NT | 11.2% | coding (915/1137 nt) | clpB_3 | Chaperone protein ClpB |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2349060 | 189 (1.090) | coding (895/1137 nt) | clpB_3 | Chaperone protein ClpB |
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
TTTCTTTTTCATTTAGAGATGATAGTATTTCATTTAATTTATTTTCTATTACTTTCTGCTTTTCTTCCTGTGTTAAATATAAAAATTTAATACAGGAATCTATTCTAGAAAATACCGGTTCTCCAATATTAACTATTGCTTCTTCAATACTATTAAAATTAGATGTTAGAATGAAAATACA > USA300TCH1516_ALE/2348970‑2349150 | tttctttttcATTTAGAGATGATAGTATTTCATTTAATTTATTTTCTATTACTTTCTGCTTTTCTTCCTGTGTTAAATATAAAAATTTAAt > 1:3562082/1‑91 (MQ=255) ttCTTTTTCATTTAGAGATGATAGTATTTCATTTAATTTATTTTCTATTACTTTCTGCTTTTCTTCCTGTGTTAAATATAAAAATTTAATa < 1:1937931‑M2/91‑2 (MQ=255) ttttTATTTATATATGATAGTATTTCATTTAATTTATTTTCTATTACTTTCTGCTTTTCTTCCTGTGTTAAATATAAAAATTTATTacagt < 2:2719226‑M2/91‑6 (MQ=255) ttttCATTTAGAGATGATAGTATTTCATTTAATTTATTTTCTATTACTTTCTGCTTTTCTTCCTGTGTTAAATATAAAAATTTAATacagg < 1:445461‑M2/91‑6 (MQ=255) ttttCATTTAGAGATGATAGTATTTCATTTAATTTATTTTCTATTACTTTCTGCTTTTCTTCCTGTGTTAAATATAAAAATTTAATacagg < 2:2148592‑M2/91‑6 (MQ=255) ttttCATTTAGAGATGATAGTATTTCATTTAATTTATTTTCTATCACTTTCTGCTTTTCTTCCTGTGTTAAATATAAAAATTTAATacagg > 2:3488398‑M2/1‑86 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |