| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2494782 = | 188 (0.990) | 20 (0.120) | 13/138 | NT | 12.0% | intergenic (‑145/+62) | USA300HOU_RS12845/mnmC_2 | hypothetical protein/tRNA 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine biosynthesis bifunctional protein MnmC |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2494828 = | 131 (0.800) | intergenic (‑191/+16) | USA300HOU_RS12845/mnmC_2 | hypothetical protein/tRNA 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine biosynthesis bifunctional protein MnmC | |||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
GTATGACAGCTAAAATAACTTTACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGAAACTAAACTTGATACAGCGCCAAA > USA300TCH1516_ALE/2494738‑2494918 | cacaaaacgtactgaagtgccgtcataatttaataaatagaaatAATTGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCtatta > 2:2997542‑M1/45‑91 (MQ=255) acaaaacgtactgaagtgccgtcataatttaataaatagaaatAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCtattat > 2:1005730‑M1/44‑91 (MQ=255) caaaacgtactgaagtgccgtcataatttaataaatagaaatAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTattatt > 1:3777952‑M1/43‑91 (MQ=255) caaaacgtactgaagtgccgtcataatttaataaatagaaatAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTattatt > 2:1985928‑M1/43‑91 (MQ=255) aTGACAGCTAAAATAACTTTACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTattatt > 2:2568586/1‑91 (MQ=255) aTGACAGCTAAAATAACTTTACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTattatt > 2:2918372/1‑91 (MQ=255) gACAGCTAAAATAACTTTACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTc < 2:3682996/91‑1 (MQ=255) cAGCTAAAATAACTTTACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCta > 2:1363048/1‑91 (MQ=255) gtactgaagtgccgtcataatttaataaatagaaatAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCtatt > 1:2000721‑M1/37‑91 (MQ=255) gCTAAAATAACTTTACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTATAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCtatt < 2:3378319/91‑1 (MQ=255) gCTAAAATAACTTTACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCtatt < 2:243466/91‑1 (MQ=255) tactgaagtgccgtcataatttaataaatagaaatAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCtattt > 2:1727529‑M1/36‑91 (MQ=255) cTAAAATAACTTTACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCtattt > 2:3098998/1‑91 (MQ=255) tgaagtgccgtcataatttaataaatagaaatAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCtatttatt > 1:2493503‑M1/33‑91 (MQ=255) tgaagtgccgtcataatttaataaatagaaatAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCtatttatt > 1:1868401‑M1/33‑91 (MQ=255) aaTAACTTTACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATttatta > 1:1757296/1‑91 (MQ=255) tAACTTTACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTaaa < 1:1028337/91‑1 (MQ=255) tAACTTTACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTaaa < 2:2741290/91‑1 (MQ=255) cTTTACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTa < 2:1936045/91‑1 (MQ=255) ttACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATg < 1:3692163/91‑1 (MQ=255) ttACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATg > 2:3649611/1‑91 (MQ=255) ttACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATg > 1:2510982/1‑91 (MQ=255) ttACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTAGTATAGCTATTATTACTATTTATTAAATTATg > 1:3316955/1‑91 (MQ=255) tACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGa > 1:3390559/1‑91 (MQ=255) tACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGa > 2:3042230/1‑91 (MQ=255) aCATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGAc < 2:957864/91‑1 (MQ=255) aTCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACgg < 1:1162651/91‑1 (MQ=255) aTCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACgg > 1:3327234/1‑91 (MQ=255) aTCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACgg < 2:600861/91‑1 (MQ=255) cAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCa > 2:3130431/1‑91 (MQ=255) aGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACt > 2:274620/1‑91 (MQ=255) cgcTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACtt < 2:1546707/90‑1 (MQ=255) cgcTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACtt > 1:1546707/1‑90 (MQ=255) gcTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCa < 1:3663771/91‑1 (MQ=255) tataCAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGTCGGCACTTCAGt > 2:2257713/1‑91 (MQ=255) tataCAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGt < 2:290419/91‑1 (MQ=255) tataCAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGt > 2:449207/1‑91 (MQ=255) taaatagaaataatagctatacaagacgtttgtagcgagcgtcatggtatagctattATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGt > 1:2899846‑M2/58‑91 (MQ=255) ataCAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTa < 1:467960/91‑1 (MQ=255) taCAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTAc > 2:3758621/1‑91 (MQ=255) cAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGt > 2:2180225/1‑91 (MQ=255) aaataaaataGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGtt < 2:3832471/91‑1 (MQ=255) aaataaaataGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGtt > 1:2213687/1‑91 (MQ=255) aataaaataGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGttt < 1:2143854/91‑1 (MQ=255) aaataatagctatacaagacgtttgtagcgagcgtcatggtatagctattATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGtttt > 1:2444840‑M2/51‑91 (MQ=255) aaataatagctatacaagacgtttgtagcgagcgtcatggtatagctattATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGtttt > 1:1392124‑M2/51‑91 (MQ=255) taaaataGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTtg < 2:3484658/91‑1 (MQ=255) AATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTGAGTACGTTTTGTGc > 2:3295039‑M1/1‑91 (MQ=255) AATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGc < 1:2056080‑M1/91‑1 (MQ=255) AATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGc > 2:673082‑M1/1‑91 (MQ=255) AATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGc > 2:805025‑M1/1‑91 (MQ=255) TAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTa < 1:2412817‑M1/91‑1 (MQ=255) TAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTa > 2:1419017‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCt > 1:3413452‑M1/1‑89 (MQ=255) AGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCt < 2:3413452‑M1/89‑1 (MQ=255) AGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTAt < 1:636586‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTAt < 2:3207308‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTAt > 1:712656‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTAt > 1:1593665‑M1/1‑91 (MQ=255) GCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATg > 1:3508675‑M1/1‑91 (MQ=255) atacaagacgtttgtagcgagcgtcatggtatagctattATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGttt > 2:1373141‑M2/40‑91 (MQ=255) TACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGtttt < 2:638388‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTc < 2:894589‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTc < 1:3586587‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTc > 2:942240‑M1/1‑91 (MQ=255) aTGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTaa > 2:741269/1‑91 (MQ=255) aTGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTaa < 2:1163589/91‑1 (MQ=255) aTGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTaa < 2:92983/91‑1 (MQ=255) tGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAAc < 1:2581247/91‑1 (MQ=255) tGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAAc < 1:3734271/91‑1 (MQ=255) gACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGc < 2:1348545/77‑1 (MQ=255) gACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACa > 1:2115036/1‑91 (MQ=255) cgtttgtagcgagcgtcatggtatagctattATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACaa < 1:1727529‑M2/60‑1 (MQ=255) cgctcgctACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAAt < 1:1891688/91‑1 (MQ=255) cgctcgctACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAAt < 1:80483/91‑1 (MQ=255) gctcgctACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATa > 2:277757/1‑91 (MQ=255) cgctACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCt > 1:1262304/1‑91 (MQ=255) cgctACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCt > 2:1227835/1‑91 (MQ=255) gctACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTg < 1:885145/91‑1 (MQ=255) gctACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTg < 1:1701294/91‑1 (MQ=255) ctACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGa > 1:1921176/1‑91 (MQ=255) ctACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGa < 1:3200655/91‑1 (MQ=255) tACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGaa > 1:3812811/1‑91 (MQ=255) aCAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGaaa > 1:1504617/1‑91 (MQ=255) cAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGaaac < 1:51786/91‑1 (MQ=255) aCGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGaaactaa > 2:1533062/1‑91 (MQ=255) tCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGaaactaaact > 1:2713562/1‑91 (MQ=255) ttGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGAAACTAAACTTg > 2:1990726/1‑91 (MQ=255) gtatagctattATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGAAACTAAACTTGAt > 2:1902533‑M2/12‑91 (MQ=255) tagctattATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGAAACTAAACTTGATACa > 2:2927789‑M2/9‑91 (MQ=255) tagctatATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGAAACTAAACTTGATACAg < 1:3114241‑M2/84‑1 (MQ=255) gctattATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGAAACTAAACTTGATACAgc < 1:1049329‑M2/85‑1 (MQ=255) ctattATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGAAACTAAACTTGATAcagaa < 2:869670‑M2/86‑3 (MQ=255) ctattATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGAAACTAAACTTGATACAgcg < 1:1367503‑M2/86‑1 (MQ=255) tattATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGAAACTAAACTTGATACAgcgc > 1:139854‑M2/5‑91 (MQ=255) tattATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGAAACTAAACTTGATACAgcgc > 1:1058945‑M2/5‑91 (MQ=255) attCTTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGAAACTAAACTTGATACAGCGcc < 1:3006889‑M2/88‑1 (MQ=255) attATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTCTGCTATGTTTTTTAACAATAGCTGACACTATACTTGATACCGCGcc > 2:2490414‑M2/4‑91 (MQ=255) ttATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGAAACTAAACTTGATACAGCGCCa > 2:1763987‑M2/3‑91 (MQ=255) attTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGAAACTAAACTTGATACAGCGCCaaa < 2:3768530/91‑1 (MQ=255) | GTATGACAGCTAAAATAACTTTACATCAAGCGCTATACAAATAAAATAGCTATACCATGACGCTCGCTACAAACGTCTTGTATAGCTATTATTTCTATTTATTAAATTATGACGGCACTTCAGTACGTTTTGTGCTATGTTTTCTAACAATAGCTGAAACTAAACTTGATACAGCGCCAAA > USA300TCH1516_ALE/2494738‑2494918 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |