| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | 4311 = | 284 (1.190) | 6 (0.010) | 3/246 | 19.1 | 0.92% | intergenic (+276/‑189) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0006/cadR | hypothetical protein/cadmium binding protein |
| ? | NC_012417 | 2053 = | 1037 (1.080) | intergenic (+286/+40) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTTTTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000731/4455‑4311‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gttaagggttcCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT > NC_012417/2053‑2186 atcTTTAAAAAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACTCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTTGGTTTAATAGCTCACGTTATGCTGACATTCGTCTGCAAGTGT‑‑‑‑A‑‑G < 1:173544/132‑1ATTTTTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCTGTCTTTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑G < 1:473581/135‑1ATTTTTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑G < 2:102829/135‑1ATTTTTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑G > 1:72972/1‑135ATTTTTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAACTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑G > 1:53304/1‑135ATTTTTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTACTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGGTTAATAGCTTACGCTATGCCGAACTTCGTCTGCGAGTTT‑‑‑‑A‑‑G > 1:107983/1‑135 TTTTTAAATAATCATAGGTTCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAATTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCTACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GT < 2:342772/135‑1 TTTTTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GT < 1:607319/135‑1 tgTAAATAATCATTGGTGCTTTCTTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAACCTTGTCGAATGGTCTGCTTAATAGTTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTA < 1:72423/133‑1 TTTAAATAATCATAGGTTCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTA > 2:670033/1‑135 TTTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGTCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTA < 1:531911/135‑1 TTTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTA > 1:114286/1‑135 TTTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTA > 1:679412/1‑135 TTTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTA > 1:610816/1‑135 TTTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTA > 2:332957/1‑135 TTTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTA‑‑‑‑A‑‑GTTA < 1:524213/135‑1 TTTAAATAAACATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCCCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCACGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTA > 2:117953/1‑135 TTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAA > 2:69933/1‑135 TTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAA > 2:614702/1‑135 TAATTAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAAG > 1:30981/1‑135 TAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCACAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGCCATTCGTCTGCAGGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAAG > 2:293521/1‑135 TAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAAG > 1:635552/1‑135 AAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGG < 2:93808/135‑1 TAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGTCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTT < 1:481779/135‑1 AATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTC > 1:107077/1‑135 AATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTC < 1:513919/135‑1 ATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCCAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGACATTGGA > 2:25295/1‑135 TCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTC‑‑‑TTCTCAACATCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAG > 1:354645/1‑135 AATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATT > 1:355477/1‑135 TCCCAGACCTGGTCGAATGGTCGGCTTAAGAGCTCACGCTAAGCCGACATTGGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTC‑‑‑TTCTCAACATCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGA < 2:281540/135‑1 CCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTC‑‑‑TTCTCAACATCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAT < 2:354645/135‑1 AAAACTTGTCGAATAGTCAGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCAGTATT > 1:648789/1‑135 TTACGGGTCCCTAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCA > 2:439398/1‑135 TTAAGGGTTCCTAGGCTCAACGTCAATAAAGCCATTGGAATAAATAGTATTTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCGTTTATCCCA < 1:276781/135‑1 TTAAGGGTTCCGATGCTCAACGTCAATAACGCAAGTGGAATAAATAGTATCTAAAGTATCCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTAGCCCA < 2:542081/135‑1 TTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAGTAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCA < 1:434209/135‑1 TTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGATAGCTTTACTTTTATCCCA > 2:544760/1‑135 TTAAGGGTTCCGAGGCTAAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCA < 2:566258/135‑1 TTAAGGGTTCCGAGATTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCA > 1:379075/1‑135 TAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGTAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAA < 1:230946/135‑1 TAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAA < 1:26551/135‑1 aggtgcTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAAT < 2:469641/129‑1 AAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAAT > 2:663036/1‑135 AAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAAT < 1:359149/135‑1 AGGGTTCTGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGTTAGGTTTTCTTTTATCCCAATT < 1:355045/135‑1 AGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAGCCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTTTCCCAATT < 2:330244/135‑1 AGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATT < 2:64948/135‑1 AGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGATATTGGCCAATTTAGGATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTCTCCTTTTATCCCAATT < 1:291653/135‑1 AGGGTTCCGAGGCTCAACGGCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCATTT < 2:30988/135‑1 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTTCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTT < 1:226586/135‑1 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCTTTTTATCCCAATgt < 1:515013/135‑3 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTT < 1:531611/135‑1 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTT < 2:272066/135‑1 GGGTTCCGAGGCCCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTT < 1:666435/135‑1 GGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTT > 2:574147/1‑135 GGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTT > 2:273834/1‑135 GGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTT < 1:598600/135‑1 GTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTA > 1:114751/1‑135 GTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAACTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCACTTTTA > 2:7043/1‑135 GTTCCGAAGCTCAATGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCTAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTATGTTTCCTTTTATCCCAATTTTA < 1:646573/135‑1 TTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCGTAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAG < 2:463000/135‑1 TTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAG > 2:397948/1‑135 TTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAG > 1:603567/1‑135 TTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAG > 2:508228/1‑135 TTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATACCAATTTTAG > 2:125272/1‑135 TTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACAATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGATTCCTTTTATCCCCATTTTAG > 2:556741/1‑135 TTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTAGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAG > 2:505587/1‑135 TTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAAAAAATAGTATCTAAAGAAACCGGTATTAAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCGTTGATCCCAACTTGAG > 1:130281/1‑135 TTCCGAGGCTCAACGTAAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTcg > 1:13107/1‑133 TTCCGAGGCTCAACGGCAATAAAGCAATTGGAATAAATAATATCTAAAGTAACACGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGGTTCCAGCTAGGTTTCCTTCTATCCCAATTTTAG > 1:349176/1‑135 TCCGCGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGAAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGC > 1:191230/1‑135 TCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATTGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCTTTTTATCCCAATTTTAGC < 1:85735/135‑1 TCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGC > 1:121613/1‑135 CCGTGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT > 1:564586/1‑135 CCGAGGCTCAACGTGAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCATATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT > 1:343610/1‑135 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTTGAAACTATAGTATCTGCGATTCCAGCTAGGTTTTCTTTTATCCCAATTTTAGCT < 1:163716/135‑1 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATCGTAGCTGCGATAGCATCTACGTTTCCTTTTATCCCACTTTTAGCT > 2:249534/1‑135 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTGGCT > 2:75732/1‑135 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT > 1:602725/1‑135 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT > 2:32636/1‑135 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT > 1:212029/1‑135 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT < 1:284461/135‑1 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT > 1:247321/1‑135 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTACTCCCAATTTTAGCT > 2:105208/1‑135 CCGAGGCTCAACATCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT > 2:63804/1‑135 ATTTTTAAATAATCATAGGTGCTTTATTCCAATTGCTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000731/4455‑4311‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gttaagggttcCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT > NC_012417/2053‑2186 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |