| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
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aaGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACg > 2:50835/1‑135 (MQ=255) aaGTTCTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACg < 2:394715/135‑1 (MQ=255) aGTTTTGGTATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTAAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGa < 2:562848/135‑1 (MQ=255) ttttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACTCCGCCGGCTATTGGATTTACGAtt < 1:65207/135‑1 (MQ=255) ttttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGAtt > 1:32846/1‑135 (MQ=255) ttttGGGATTGGTAAGGGCTCGTCGGCTTAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCGGCAAATGCAGTTCCGGAAACTGCTTCACATACCCCGCCGGCTATTGGATTTACGAtt < 2:539990/135‑1 (MQ=255) | TTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATT > CP000731/2201‑2466 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |