New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000731 | 2365 = | 282 (1.180) | 4 (0.020) | 4/252 | 18.5 | 1.4% | intergenic (+145/+23) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0003/USA300HOU_pUSA300HOUMR0004 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | CP000731 | 4302 = | 282 (1.260) | intergenic (+267/‑198) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0006/cadR | hypothetical protein/cadmium binding protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
CGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCCATACTCCACAGTAGTGAGCACATGCATAA > CP000731/2239‑2499 | aaatTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAAt > 1:503065/1‑135 (MQ=17) aaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCTGAGGTTTAACGTCAATAAAACAAtt < 1:2512/135‑1 (MQ=12) aTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTgg > 1:393521/1‑135 (MQ=32) aTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTgg > 2:274393/1‑135 (MQ=32) tttATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGTTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGa < 2:715/135‑1 (MQ=17) tttATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTgaa > 1:56771/1‑133 (MQ=17) tttATTGATGTTGAGAAGAAAAATTAAATAAAATTGCAGACGAATGTAGGCATAGCGTGAGCTATTAAGACGACAATTCGACAAGTTTTGGGAGTGGTAAGGGTGGCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGa > 1:327440/1‑135 (MQ=11) ttATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGaa > 2:323721/1‑135 (MQ=32) tATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCAATACAAGATGCAAGTGTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAAt > 1:266891/1‑135 (MQ=11) aTTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTTGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATa < 1:198747/135‑1 (MQ=17) tGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATaaa > 2:569905/1‑135 (MQ=33) tGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATc > 2:622287/1‑135 (MQ=34) gTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCa < 1:643284/135‑1 (MQ=35) ttGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCaa > 2:515642/1‑135 (MQ=37) gagcAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAAcc < 1:122429/135‑1 (MQ=38) gagaAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAAcc < 1:594345/135‑1 (MQ=38) gaagaaCCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTa < 2:89793/135‑1 (MQ=40) gaagaaCCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTa < 1:627487/135‑1 (MQ=40) gaagaaCCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTa < 2:46004/135‑1 (MQ=40) agaaCCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACa > 2:443012/1‑135 (MQ=255) agaaCCCGTAACGAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAGGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAAAAATTGGACTAAAATAAACCTACa > 2:284771/1‑135 (MQ=14) cccTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGc < 1:406616/135‑1 (MQ=255) cccTTAACTAAACTTGAAAAAGAATGTAGGAATAGCGTGAGATATTAAGCCGACAATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTACGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAAAATAAAGAGc > 1:243718/1‑135 (MQ=11) ccTTAACTAAACTTGCAAACAAATGTCGGAATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGGTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTGAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCGACAGAGCa > 1:156505/1‑135 (MQ=14) tAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATcc > 2:391575/1‑135 (MQ=255) aaCTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCa > 1:318439/1‑135 (MQ=255) aaCTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACAATTAGACACGTATTGGGTTTGTTAAGGGTTCCGCGGCGCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCa > 2:586885/1‑135 (MQ=17) aCTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGATTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAg > 1:436331/1‑135 (MQ=255) cTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACACAGCATCCAGc > 2:205007/1‑135 (MQ=255) tAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCt < 1:292331/135‑1 (MQ=255) aattacAGACGAATGTCGGCATAGCATAAACTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAGTCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCa > 1:459961/6‑135 (MQ=17) aCTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCa > 2:215647/1‑135 (MQ=255) aCTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCa > 2:608586/1‑135 (MQ=255) aCTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCa < 1:109175/135‑1 (MQ=255) ttGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCACTCAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCaaa < 1:239388/135‑1 (MQ=255) ttGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCaaa < 2:340483/135‑1 (MQ=255) aGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGCCCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGTATAAATTCAACTTACAGAGCATCCAGCTGCAAAGGCa < 1:166204/135‑1 (MQ=17) aGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCa < 1:99707/135‑1 (MQ=255) aGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCa < 1:570223/135‑1 (MQ=255) gcGAATGGCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGCCCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGt < 1:555565/134‑1 (MQ=255) acaaaTGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGt < 1:649155/132‑1 (MQ=255) cGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGATTTGGGAATGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCAACCAGCTGCAAATGCAGtt > 1:344974/1‑135 (MQ=255) cGAATGTCGGCATACCGTGAGCTATTAAGCCGACAATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGtt > 1:133429/1‑135 (MQ=255) cGAACGGCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGATGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCGGCAAATGCAggt < 2:231375/135‑3 (MQ=18) aTGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCg < 2:14788/135‑1 (MQ=255) tGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGc > 2:560993/1‑135 (MQ=255) tCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCTGCTGCAAATGCAGTTCCGCaa < 1:331798/135‑1 (MQ=255) tCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCaa < 1:181134/135‑1 (MQ=255) gCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGCATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAAGAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGAAGTTCAGCaaagt > 2:378224/1‑133 (MQ=18) cATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACCGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTg > 2:303932/1‑135 (MQ=255) aTAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTATTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAGTGCAGTTCCGCAAACTGc > 1:529353/1‑135 (MQ=255) aGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGGGCCTTAGCGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCtt < 1:452823/135‑1 (MQ=255) 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tATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATacac < 1:533323/135‑1 (MQ=255) tAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACATAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACAccgc < 1:42141/135‑1 (MQ=255) tAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACAccgc > 2:674656/1‑135 (MQ=255) gCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGCTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAAGCTACAGCGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCgg > 2:389279/1‑135 (MQ=255) cccttCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTAtt > 1:402635/4‑135 (MQ=255) ccATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTAtt < 1:213776/135‑1 (MQ=255) caaTTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTAtt < 1:433353/133‑1 (MQ=255) aCAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTTCTTCACATTCTTCGCCGGCTATTGGAttga < 1:287345/135‑3 (MQ=37) cAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTAc > 2:404498/1‑135 (MQ=255) gcgTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGAATTTACg > 1:544564/3‑135 (MQ=255) ccgTTTTGGGATTGTTAAGAGAACCAAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACg > 1:619671/3‑135 (MQ=255) ttttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACTCCGCCGGCTATTGGATTTACGAtt < 1:65207/135‑1 (MQ=255) tGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGcc < 2:165025/135‑1 (MQ=255) gggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGccc < 2:59594/135‑1 (MQ=255) aTTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATTCAGTTCAACACACTGTGTTACTTTCACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCCATa < 2:547039/135‑1 (MQ=37) aaGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCAGCACTTACATGTAGGATTGCACATACTCcac > 2:472941/1‑135 (MQ=38) aGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCCATACTCcaca < 1:622287/135‑1 (MQ=255) gggTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCCATACTCCACag < 2:654463/135‑1 (MQ=255) 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tCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGTCCATGATCCACAATAGGGAGCACAt < 1:670612/135‑1 (MQ=255) tCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCCATACTCCACAGTAGTGAGCACAt > 2:124823/1‑135 (MQ=255) gcAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCCATACTCCACAGTAGTGAGCACAt < 2:583453/134‑1 (MQ=255) gcAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCCATACTCCACAGTAGTGAGCACAt < 2:11763/134‑1 (MQ=255) cAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCCATTCTCCACAGTAGTGAGCACATg < 1:608586/135‑1 (MQ=255) cAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCCATACTCCACAGTAGTGAGCACATg < 2:335933/135‑1 (MQ=255) cAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCAATATCCCACCGTAGTGAGccaatg > 1:681182/1‑130 (MQ=255) accGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCCATTCTCCACAGTAGTGAGCACATGc < 1:358491/133‑1 (MQ=255) cGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCCATACTCCACAGTAGTGAGCACATGCAt < 1:573443/135‑1 (MQ=255) gTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGATAAACAAACTTCTGCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTTTCCATACTCCACAGTAGTGAGCACATGCATa < 1:127434/135‑1 (MQ=255) tCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCCATACTCCACAGTAGTGAGCACATGCATaa < 1:410394/135‑1 (MQ=255) tCAATAAAAAAATTGGAATAAAATCAGCCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCCATACTTCACAGTAGTGAGCACATGCATaa < 1:38334/135‑1 (MQ=255) | CGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTTCACATACACCGCCGGCTATTGGATTTACGATTGCCCATACTCCACAGTAGTGAGCACATGCATAA > CP000731/2239‑2499 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |