| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1454018 = | 96 (0.740) | 8 (0.070) | 5/270 | 8.6 | 8.1% | intergenic (‑97/+187) | odhA/arlS | 2‑oxoglutarate dehydrogenase E1 component/Signal transduction histidine‑protein kinase ArlS |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1454048 = | 94 (0.790) | intergenic (‑127/+157) | odhA/arlS | 2‑oxoglutarate dehydrogenase E1 component/Signal transduction histidine‑protein kinase ArlS | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CACCGAAGTTTACAGGAGCCTCTGAAACTTCTTTTCTTTCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTTATACATTAGTCACAGCTAATGTGTACTT > USA300TCH1516_ALE/1453873‑1454162 | cACCGAAGTTTACAGGAGCCTCTGAAACTTCTTTTCTTTCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAaaga < 1:1117953/148‑1 (MQ=255)cACCGAAGTTTACAGGAGCCTCTGAAACTTCTTTTCTTTCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAaaga > 1:1228221/1‑148 (MQ=255) aGTTTACAGGAGCCTCTGAAACTTCTTTTCTTTCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTATGCTATGCGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATc > 1:457293/1‑148 (MQ=255) gTTTACAGGAGCCTCTGAAACTTCTTTTCTTTCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATca > 2:93943/1‑148 (MQ=255) gTTTACAGGAGCCTCTGAAACTTCTTTTCTTTCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATca > 2:1371205/1‑148 (MQ=255) tttACAGGAGCCTCTGAAACTTCTTTTCTTTCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATcaa < 2:849569/148‑1 (MQ=255) gCCTCTGAAACTTCTTTTCTTTCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGt < 1:896151/148‑1 (MQ=255) gAAACTTCTTTTCTTTCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGAttc > 1:167180/1‑148 (MQ=255) aaaCTTCTTTTCTTTCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGAttct < 1:792204/148‑1 (MQ=255) aaCTTAATTTCGTACGTTAATCATTTGAGACCCCTCCA‑AAAAATGTAGAAACGATTACAATGTAATAATATCACTAGTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGAttctt < 2:668674/148‑1 (MQ=255) ttcttttcttTCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTa < 2:1268631/148‑1 (MQ=255) ttcttttcttTCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTa < 1:1371205/148‑1 (MQ=255) ttcttttcttTCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTa < 1:93943/148‑1 (MQ=255) ttttttttCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGt < 1:11518/148‑1 (MQ=255) tttctttcGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGtt < 2:805235/148‑1 (MQ=255) tttctttcGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGtt < 2:1312647/148‑1 (MQ=255) ttctttcGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGttt < 2:76709/148‑1 (MQ=255) ttctttcGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGttt < 1:273661/148‑1 (MQ=255) ttctttcGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTGACCTATTTAGCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGttt < 2:817664/148‑1 (MQ=255) tttcGTTTGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATTATATCACTATTGAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTAGCTGCTAAACACAAGAATCAACAACAGCGTTGATTCTTCTAGGTTtata < 2:1359180/148‑1 (MQ=255) tttcGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTCATTCTTCTAGGTTtata < 1:1034330/148‑1 (MQ=255) tttcGTTAGGCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTtata < 1:1124256/148‑1 (MQ=255) tttcCTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACGTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTTATTCTTCTAGGTTtata < 2:904808/148‑1 (MQ=255) ttcGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAg > 2:151249/1‑148 (MQ=255) tcGTTAGTCATTTTACC‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGa < 1:233204/148‑1 (MQ=255) tcGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGa < 1:925111/148‑1 (MQ=255) tcGTTAGTCATTCCACC‑TCCTCCTCAAAATTGTTGAATCGTTTACAATGTAATAAGATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGa < 2:1100202/148‑1 (MQ=255) gTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATg < 1:240359/148‑1 (MQ=255) gTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATg < 1:229169/148‑1 (MQ=255) ttAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGt < 1:190883/148‑1 (MQ=255) ttAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGt < 1:992753/148‑1 (MQ=255) ttAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGt < 2:201590/148‑1 (MQ=255) ttAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGt < 2:1232570/148‑1 (MQ=255) ttCATTTTATA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTAtt < 2:960559/147‑1 (MQ=255) gTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTCTAGAGGTAtt > 1:251607/1‑148 (MQ=255) gTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTAtt < 2:246688/148‑1 (MQ=255) gTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTAtt < 1:352081/148‑1 (MQ=255) tCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATTTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTAGCTGCTACAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTAttt > 2:931036/1‑148 (MQ=255) tCATTATACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTAttt < 2:1170929/148‑1 (MQ=255) aTTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACTCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTa < 2:1233750/148‑1 (MQ=255) aTTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTa < 2:1365007/148‑1 (MQ=255) aTTTTACA‑CACACCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTAATTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTa < 2:149011/148‑1 (MQ=255) ttttACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTAtttttt > 2:43136/1‑146 (MQ=255) ttttACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTAt < 2:215902/148‑1 (MQ=255) ttttACA‑CCCTCCACAAAAATATTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAGTCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTAt < 1:975798/148‑1 (MQ=255) ca‑cCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTaa > 1:700709/1‑148 (MQ=255) ca‑cCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTaa > 2:382033/1‑148 (MQ=255) cTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAAttt < 2:606896/148‑1 (MQ=255) cTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCCAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAAttt > 2:85411/1‑148 (MQ=255) ccACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTg < 2:105549/148‑1 (MQ=255) caAACATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAAAAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGa < 2:5983/148‑1 (MQ=255) caAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGa < 2:1185672/148‑1 (MQ=255) gTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTacaac < 2:525739/148‑1 (MQ=255) ttGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTgcaact > 2:1097350/1‑147 (MQ=255) aaCGCTTACAATTTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGaaa < 2:401016/148‑1 (MQ=255) aaCGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGaaa < 2:1194719/148‑1 (MQ=255) aaCGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGaaa < 1:85775/148‑1 (MQ=255) aaCGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGaaa < 2:638199/148‑1 (MQ=255) 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ttAAAGTAGATTCACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACACCAGAACGCACTGAGATCCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCt < 1:681023/148‑1 (MQ=255) tAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCtt < 2:457293/148‑1 (MQ=255) aaaGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTta < 2:311722/148‑1 (MQ=255) gTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTTATAc > 2:201432/1‑148 (MQ=255) aGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTTATACAt < 1:301581/148‑1 (MQ=255) aTTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTTATACATTAGTCACAGc < 1:287638/148‑1 (MQ=255) aTTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTTATACATTAGTCACAGc < 1:689752/148‑1 (MQ=255) ttATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCCTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACATAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTTATACATTAGTCACAGCTa < 1:942142/148‑1 (MQ=255) tgaTCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCCTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACATAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTTATACATTAGTCACAGCTa < 1:942587/146‑1 (MQ=255) tCTGCTAAAAAGCAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATCGATGAATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTTATACATTAGTCAAAGCTAAtg > 2:1059043/1‑148 (MQ=255) tCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTATGGAAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCAATGTTTATTTGTTTTATAGTTATCATAATATATTAGTGCCAGCTACtg > 2:628351/1‑148 (MQ=255) cTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAACGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTTATACATTAGTCACAGCTAAtgt < 2:1215176/148‑1 (MQ=255) cTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGATCCACTGTTTATTTGTTTTAGAGTTGTTCTTATACATTAGTCACAGCTAAtgt < 1:486685/148‑1 (MQ=255) cTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCTCTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTTATACATTAGTCACAGCTAAtgt < 1:1100367/148‑1 (MQ=255) cTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTTATACATTAGTCACAGCTAAtgt < 2:1171152/148‑1 (MQ=255) cTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTTATACATTAGTCACAGCTAAtgt < 1:760613/148‑1 (MQ=255) cTAAAAAGAAGAATCAACAATAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTATTATAGTTGTTCTTATACATTAGTCACAGCTAATGTGTa > 1:996879/1‑148 (MQ=255) aaaaGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTTATACATTAGTCACAGCTAATGTGTACtt < 1:1218839/148‑1 (MQ=255) | CACCGAAGTTTACAGGAGCCTCTGAAACTTCTTTTCTTTCGTTAGTCATTTTACA‑CCCTCCACAAAAATGTTGAAACGCTTACAATGTAATAATATCACTATTTAGTTATTTGTTAAAGTAGATTTACCTATTTATCTGCTAAAAAGAAGAATCAACAAAAGCGTTGATTCTTCTAGGTTTATAGATGTATTTTATTGTAAATTTTGGGAGTACAACAGAAATGATAAAGAACCACTGTTTATTTGTTTTATAGTTGTTCTTATACATTAGTCACAGCTAATGTGTACTT > USA300TCH1516_ALE/1453873‑1454162 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |