New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1205323 | 102 (0.780) | 25 (0.260) +AGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAG |
8/218 | 6.1 | 24.9% | intergenic (‑204/‑365) | USA300HOU_RS15290/lspA | hypothetical protein/Lipoprotein signal peptidase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1443739 | NA (NA) | intergenic (‑312/+41) | USA300TCH1516_01342/brnQ_3 | hypothetical protein/Branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
TGCCAGTCGAAGACCGAGGCTGAGACGGCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGAACCACTCTAAAGAATACGCTC > USA300TCH1516_ALE/1443617‑1443886 | ggCCAGTCGAAGACCGAGGCTGAGACGGCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGAGATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATCTATGTCCCAACct < 1:111696/147‑1 (MQ=17) cAGTCGAAGACCGAGGCTGAGACGGCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCtt < 2:260537/148‑1 (MQ=35) agactaaGACCGAGGCTGAGACGGCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCttt < 2:558438/143‑1 (MQ=25) aGTCGAAGACCGAGGCTGAGACGGCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCttt < 2:1121090/148‑1 (MQ=35) aGTCGAAGACCGAGGCTGAGACGGCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCttt < 2:1326692/148‑1 (MQ=35) gTCGAAGACCGAGGCTGAGACGGCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGGATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCtttt > 2:924723/1‑148 (MQ=21) cGAAGACCGAGGCTGAGACGGCACCCGAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTtat < 1:378625/148‑1 (MQ=25) aatacagAGGCTGAAACGGCACCCTACGAAAGAGAAGCCATTCAATACGAAATATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATGTATGTCCCAACCTCTTTTatat < 1:254185/142‑1 (MQ=11) aCCGAGGCTGAGACGGCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTAtattat > 1:1364725/1‑148 (MQ=37) gAGGCTGAGACGGCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCg < 1:43366/148‑1 (MQ=40) gAGGCTGAGACGGCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCg < 2:600510/148‑1 (MQ=40) tGAGACCGCACGCTAGGGAAGCGAAGCAATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTAtt < 1:275674/148‑1 (MQ=255) ggggaCGGCACCCGAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTAtt < 2:936951/145‑1 (MQ=255) gtaCGGCACCCTAGGAAAGCGAAGTCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTcc < 1:655992/146‑1 (MQ=255) agaCGGCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTcc > 2:208444/1‑148 (MQ=255) ggCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGtt < 2:1405253/148‑1 (MQ=255) gCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTg > 1:508664/1‑148 (MQ=255) cccTCGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGata < 1:52089/148‑1 (MQ=255) cTAGGAAAGGGTAGCCATTCTATACGATGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCTAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATAtt < 2:791210/148‑1 (MQ=17) cTAGGAAAGGCAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATATAGTACAGCAGGAAGATATTTGCTAATTTAAATTTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATAtt < 2:748195/148‑1 (MQ=17) cTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATAtt < 2:111112/148‑1 (MQ=255) cTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATAtt < 2:1116094/148‑1 (MQ=255) cTAGAAAATCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATCAATAGAGAACAGCAGTATGTTCTTGTCTAATTCAAAATTATCTGACTGCTGTTTTCTTTTGTATTTATCTCGCAATCCCTTTTATTTCATTCTTTATTCCTGTTGATAtt < 2:408568/148‑1 (MQ=9) tAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCGCTAATATATTTTCTAATTGGAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATAttt > 1:1100203/1‑148 (MQ=255) ggAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTaa < 2:1163941/148‑1 (MQ=255) ggAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTaa > 1:997842/1‑148 (MQ=255) ggAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTAATGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCGAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTaa > 1:913590/1‑148 (MQ=255) gAAAGGGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTCATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAAt < 1:1101525/148‑1 (MQ=255) cATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTAATGCTGTTTTTTTTGGGCTTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTGGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGtt > 2:1174857/1‑148 (MQ=255) tCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTa < 1:68278/148‑1 (MQ=255) tCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTa < 1:1082438/148‑1 (MQ=255) cAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTAc > 2:754342/1‑148 (MQ=255) tACGAAGTATTATATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTCTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACaaa > 1:1013803/1‑148 (MQ=255) aaGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATg < 1:907489/148‑1 (MQ=255) aTTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTCTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTGATTCCCGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGa < 1:279598/148‑1 (MQ=255) tataAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGGCTAg > 1:327105/1‑148 (MQ=255) ataAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGa > 1:297814/1‑148 (MQ=255) tacaTAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGAt < 1:1261693/145‑1 (MQ=255) taAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTATTTTTTTTTGTCCCAACATCTTTTATATTATTCGTTATTCTTGTTGATATTTAATTGGATTTTGTTTTACAAATATGCAGACTTGAt > 2:1286160/1‑148 (MQ=21) taAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGAt > 1:124633/1‑148 (MQ=255) aaaTAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATa > 1:1000554/1‑148 (MQ=255) tAGAGAACTGCAGTAAGCTATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATCCTGACGAGATAGcc < 2:1220780/148‑1 (MQ=25) tAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGcc < 2:325829/148‑1 (MQ=255) tAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGcc > 1:505184/1‑148 (MQ=255) agaACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTaa > 1:485927/1‑148 (MQ=255) gcagTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGTATTTATGTCCCCACATCTTTTATCTTATTCTTTATTCCTGTTTATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGt > 2:1207294/1‑148 (MQ=37) gcagTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTTCTGTTGATATTTAAGTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATcct > 2:16578/1‑146 (MQ=255) gcagTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGt < 1:1098850/148‑1 (MQ=255) gcagTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGt < 1:1067580/148‑1 (MQ=255) gcagTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTACTTTATAGTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGt > 2:1207173/1‑148 (MQ=255) agTAATATAGTTTCTAATTGAAATTTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGCGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGCTGTTCAGTGACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTg < 2:584130/148‑1 (MQ=25) agTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTTTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTg < 2:1256733/148‑1 (MQ=255) tAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCa < 1:924723/148‑1 (MQ=255) tAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCa > 2:1167154/1‑148 (MQ=255) ttttCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTg < 1:760373/148‑1 (MQ=255) ttgtAATTGAAAATTATCTTATCGCTCTTTTTTTTGGGATGTATGTCCCAACCTCTTGTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCt < 1:1198438/145‑1 (MQ=255) aaTTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTg < 1:165288/148‑1 (MQ=255) aaaaTTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGAAc > 2:1198312/1‑148 (MQ=255) aaaTTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGAAcc > 2:786179/1‑148 (MQ=255) ttttttACTGCTGTTTTTTTAGGAATTTTTGTCCCTACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGAACCActc < 1:755837/144‑1 (MQ=255) tagcTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCTTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGAACCActc < 1:227347/145‑1 (MQ=255) tATCTTACTTCTGTTTTTTTTGGGACTGTTGTCACAACCTCTTTTATATTATGCGTTATTCCTGTTGTTATTTAATTGGATTTTGCTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGAACCActc < 2:548770/148‑1 (MQ=255) tATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGCACCActc > 2:551465/1‑148 (MQ=255) tATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGAACCActc < 2:97681/148‑1 (MQ=255) tCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGAACCACTCTa < 2:124633/148‑1 (MQ=255) aCTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCTTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGAACCACTCTAAAGa < 1:986352/148‑1 (MQ=255) tgctgTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATACGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGAACCACTCTAAAGAAt > 1:547855/1‑148 (MQ=255) tttttttAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGAACCACTCTAAAGAATACGct > 1:1250862/1‑148 (MQ=255) ttttttAGGGATTTTTGTCCCAACTTTTTTTATATGATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGTACTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGAACCACTCTAAAGAATACGctc < 2:97353/148‑1 (MQ=255) ttttttAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGAACCACTCTAAAGAATACGctc < 2:474494/148‑1 (MQ=255) | TGCCAGTCGAAGACCGAGGCTGAGACGGCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTTAGGGATTTATGTCCCAACCTCTTTTATATTATTCGTTATTCCTGTTGATATTTAATTGGATCTTGTTTTACAAATATGCCGACTAGATAGCCTAATATCGTTGCAATAATTGCTACTGGGAACCACTCTAAAGAATACGCTC > USA300TCH1516_ALE/1443617‑1443886 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |