| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2870578 | 55 (0.940) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 7.0% | intergenic (‑46/+21) | mnmG/mnmE | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification enzyme MnmG/tRNA modification GTPase MnmE |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2870582 | 54 (0.970) | intergenic (‑50/+17) | mnmG/mnmE | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification enzyme MnmG/tRNA modification GTPase MnmE | |||||
ATTAATGTTTTAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCAATTTGTACCATATCCAT > USA300TCH1516_ALE/2870438‑2870718 | aTTAATGTTTTAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACCCCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGG < 1:552411‑M1/141‑1 (MQ=255)aTTAATGTTTTAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGG < 1:598862‑M1/141‑1 (MQ=255) tGTTTTAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGaatac < 2:608733‑M1/141‑6 (MQ=255) tttAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTccgt < 1:10587‑M2/141‑5 (MQ=255) tttAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTccgg < 1:390895‑M2/141‑5 (MQ=255) cgccccacGTCTTGCCGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGAATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTa < 1:250364/137‑1 (MQ=255) aGCCCCACGTCTGGCAGATTCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGTACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTa < 2:455108/141‑1 (MQ=255) accacGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGTACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGCCTAttt > 2:322642/1‑141 (MQ=255) ccacGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAACCCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTCAGACGGTATTccgtcatgttc < 1:266363‑M2/141‑12 (MQ=255) cacGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCa < 1:657208/141‑1 (MQ=255) cGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACAACTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAAt < 1:534733/141‑1 (MQ=255) ttGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACt > 1:252857/1‑141 (MQ=255) gCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTCTAAAAATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTAt > 1:134167/1‑141 (MQ=255) gCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTAt > 1:76798/1‑141 (MQ=255) gCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTAATTTGATATCTTACTAGGCTTCTTTGCAGGATATTCCGTCTTTTTCAATTACTAt > 2:283121/1‑141 (MQ=255) gCTAACCCTGCTTCTACCCCTTCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCt < 1:317089/141‑1 (MQ=255) cTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTa < 2:469702/141‑1 (MQ=255) cTAAACCTGCTGCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACAGCATATTCTTGAAGCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCGATTTCAATTACTATTTACCTa < 2:558450/141‑1 (MQ=255) gctgctACACCTGCGCGGCCGGCACCTGTAACGAGTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTACTTAGGCCGGCATGCGGTCGATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAAAAt > 2:144396/1‑141 (MQ=255) gCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCGTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAAt > 2:542765/1‑141 (MQ=255) tctcacccTGCAGGTCCCGGACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACAACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCCTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGACTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCATAATTGa < 2:117976/135‑1 (MQ=255) cTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGAc < 2:86312/141‑1 (MQ=255) cacCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACATCCTTATTTGTTATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCAATGCCAATTACTCTTTACCTAAGCAGAATTGACTGa > 2:209749/1‑141 (MQ=255) cacCAGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGa > 2:480573/1‑141 (MQ=255) cccagCATGTCCCGCACATATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCTTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGaa < 2:465147/137‑1 (MQ=255) cccTGCATGTCCCGGACCTATTACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAACCCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGaa < 2:356175/140‑1 (MQ=255) gCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATAGTCTGGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTGACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATGACTATTTAACTAAGCGGAAGTAACTGAATAAc > 1:86974/1‑141 (MQ=255) cATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCGCCTTAGTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACt > 2:490340/1‑141 (MQ=255) aTGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGAATAccgtcttaagaaggctagtaagatatcaaataaggaggtttatattgtg < 2:613301‑M2/141‑50 (MQ=255) aTGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTCGAACCACAATATAAACCTCCTACTTTGATCTCTTACTATCCTTCTTAAGACGGaattccgtcttaagaaggctagtaggaaatcaaacaaagaggtttaaactgtg > 1:613301‑M1/1‑88 (MQ=255) tGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTCCCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGa > 2:378091/1‑141 (MQ=255) tGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCCGAGTTGACTGAATAACTGa > 1:49734/1‑141 (MQ=255) gTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGAt > 1:693104/1‑141 (MQ=255) ccGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTACAATTACTATTTACCTCAGCAGAATTGACTGAATAACTGCTCGa > 1:472525/1‑141 (MQ=255) ccGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATCACGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGa < 1:540208/141‑1 (MQ=255) gCACCTAGAACGATTAAATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATg < 1:37652/141‑1 (MQ=255) cACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGACTTGACTGAATAACTGATCGATgg > 2:396111/1‑140 (MQ=255) aCCTATAACGATTACATCATATTCTTGGACCCCAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGACTTCTTAATCCGGaataccgtcttaagaaggatagtaggttatcacataaggaggattataacgtggttcaacaa > 2:216942‑M1/1‑79 (MQ=255) aCCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGtattccgtcttaagaagtctagtaagatatcaaatacggaggtttagattatggttcaagaa > 1:551414‑M1/1‑79 (MQ=255) aCCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAg < 2:62612/141‑1 (MQ=255) cTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATGGATGAGtt > 1:352944/1‑141 (MQ=255) ataACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTtca < 1:288657/141‑1 (MQ=255) tACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAGCTGATCGATGAGTTCATCACTTGc > 2:9944/1‑141 (MQ=255) catATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGtct > 1:485787/1‑141 (MQ=255) atatTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGtctc < 1:311854/141‑1 (MQ=255) ttgttgAACCACGTTATAATCCTCCTTATGTGATAACCTACTATCCTTCTTAAGACGGTATTccggattaagaagtctagtaagatatcaaataaggaggtttatattggggtccaagaatatgatgtaatcgttataggt > 2:216942‑M2/1‑62 (MQ=255) ttCTTGAACCATAATCTAAACCTCCGTATTTGATATCTTACTAGACTTCTTAAGACGGAATAccgtcttaagaaggctagtaagatatcaaataaggaggtttatattgtggttcaagaatatgatgtaatcgttataggt > 1:551414‑M2/1‑62 (MQ=255) tCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGCGTTCATCACTTGCATTATCACCa > 1:184961/1‑141 (MQ=255) cTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCaa < 1:566372/141‑1 (MQ=255) aCCATAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAAtt < 2:614373/141‑1 (MQ=255) cacaGTTTAAACCTCTTTGTTTGATTTCCTACTAGCCTTCTTAAGACGGAATTccgtcttaagaaggatagtaagagatcaaagtaggaggtttatattgtggttcgagaatatgatgtaatcgttataggtgcgggacat > 1:613301‑M2/1‑53 (MQ=255) cacaATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGtattccgtcttaagaaggctagtaagatatcaaataaggaggtttatattgtggttcaagaatatgatgtaatcgttataggtgcgggacat < 2:613301‑M1/141‑93 (MQ=255) aacttaAACCTTCGTATTTGATATCTTACTAGTGTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCGATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTTATCGAGGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTcc < 2:89255/137‑1 (MQ=255) aacataAACCCCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTcc < 2:565353/138‑1 (MQ=255) aaTATAAACCTCCGTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTcc < 1:285228/141‑1 (MQ=255) atatAAACCTCCTTATTTGATACCTGACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTGTTTAAATTAGTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGCTAAGTTCGACACTTCCAGTCTCACCAATAAGTTATcca > 2:201799/1‑140 (MQ=255) cctcctTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAGTTTCTCCTAATAttt < 1:515536/141‑1 (MQ=255) ctTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCa > 1:178487/1‑141 (MQ=255) ctTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCa > 1:4897/1‑141 (MQ=255) aTTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGt < 1:42427/141‑1 (MQ=255) aTTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGt > 2:442242/1‑141 (MQ=255) aTTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGt > 1:343175/1‑141 (MQ=255) tGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCt < 1:480573/141‑1 (MQ=255) tatCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTAATTAAGTCGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGt < 1:160063/141‑1 (MQ=255) cTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTaa > 1:629186/1‑141 (MQ=255) cTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACATAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCACGTTCTAGTTaa > 1:232358/1‑141 (MQ=255) aCTACCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATc < 2:428413/141‑1 (MQ=255) tcttAAGAAGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATAGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCATTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGATCTAGTTAAATCACTTTGTa > 2:511953/1‑141 (MQ=255) gaacatgacggaataccgtctgaagaaggctagtaagatatcaaataaggagggttatattgtggttcaagaatatgatgtaatcgttataggtgcgggacatgcaggtgtagaagcaggtttagcatctgcaagacgtgg < 1:266363‑M1/135‑131 (MQ=255) aaGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCAATTTGTACCat < 2:605275/141‑1 (MQ=255) ccgGaataccgtcttaagaaggctagtaagatatcaaataaggaggtttatattgtggttcaagaatatgatgtaatcgttataggtgcgggacatgcaggtgtagaagcaggtttagcatctgcaagacgtggtgctaaa < 1:390895‑M1/140‑138 (MQ=255) aCGGaataccgtcttaagaaggctagtaagatatcaaataaggaggtttatattgtggttcaagaatatgatgtaatcgttataggtgcgggacatgcaggtgtagaagcaggtttagcatctgcaagacgtggtgctaaa < 1:10587‑M1/141‑138 (MQ=255) aCGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCCATTTGTACGATATc > 1:387519/1‑141 (MQ=255) ggTTTTTCGTCGATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCAATTTGTACCATATCCa < 1:124733/141‑1 (MQ=255) gTATTccgtcttaagaaggctagtaagatatcaaataaggaggtttatattgtggttcaagaatatgatgtaatcgttataggtgcgggacatgcaggtgtagaagcaggtttagcatctgcaagacgtggtgctaaaaca < 2:608733‑M2/141‑137 (MQ=255) | ATTAATGTTTTAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCAATTTGTACCATATCCAT > USA300TCH1516_ALE/2870438‑2870718 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |