| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
GTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000731/1557‑1610‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgtcacaaaaATAAGACAGTACTTTTTTATAAAAAATCAACAAAAAAGACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTT < NC_012417/1047‑908 aTAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAGTACTTTTTTATAAAAAATCAACAAAAAAGACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATT < 1:57890/140‑1 AAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAGTACTTTTTTATAAAAAATCAACAAAAAAGACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAAT > 3:317462/1‑141 GTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCAC < 1:248186/37‑1 GTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCAC > 3:425953/1‑37 TTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAGTACTTTTTTATAAAAAATCAACAAAAAAGACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATT > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |