New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 2554 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) aTTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCg < 2:706882/141‑1 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGa < 2:630527/141‑1 (MQ=255) tAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGAt > 3:154253/1‑141 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTCAGGGTTCCGAGGCTCAACCTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATTCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGAtt > 4:402044/1‑141 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGAtt > 3:441261/1‑141 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGAtt > 2:220766/1‑141 (MQ=255) ccGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGaaa < 4:4861/121‑1 (MQ=255) gcccATTCGACAAGATCTGGGATTGTTAAGCGTTCCGAGGCGCAACGGCAATAAAGCAATTGGAATAAAGAGTAGCTAAAGTGACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTcccac > 2:48655/3‑138 (MQ=25) gACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGc > 4:6402/1‑141 (MQ=255) gcATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTa < 2:655248/140‑1 (MQ=255) ccATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTa < 1:170307/141‑1 (MQ=255) ccATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCAGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAGCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACAACCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTGCAGCTa > 2:603312/1‑141 (MQ=255) ttCGACTAGTTTTGGGATTGTTAAGGATTACGAGGCTCAAAGTAAATAAAGCAATTGGAATAAATAGAATCTAAAGTAACCCGTATATAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGt < 2:199852/141‑1 (MQ=37) tCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGtt > 1:136640/1‑141 (MQ=255) tCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCACAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGtt > 2:727205/1‑141 (MQ=255) caagtttTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCt > 2:378692‑M2/8‑141 (MQ=255) caagtttTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAACCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCcagctaggccattt > 3:210249‑M2/8‑135 (MQ=255) tTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATc < 1:620176‑M2/140‑1 (MQ=255) tGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATCAATAGTATGCATTGTCCCCAGTATTTAAGTTTACAATGTGCATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATcc < 3:311117/141‑1 (MQ=25) tGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATcc < 1:1025707/141‑1 (MQ=255) | ATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCC > NC_012417/1895‑2175 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |