Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | USA300TCH1516_ALE | 1637361 | 1637449 | 89 | 2 [0] | [1] 2 | recN | DNA repair protein RecN |
TTTAACGCTAACATAATTCTAGAAAGTTCTCCACCTGACGCAATTTTATTTAAACTTTTTAATGGTTCCCCTTTATTTGGACTGATTAAAAATTCTACAAATTCGATTCCATCAATATTCGGTTCTTCTAATTTTTTAAAT > USA300TCH1516_ALE/1637220‑1637360 | tttAACGCTAACATAATTCTAGAAAGTTCTCCACCTGACGCAATTTTATTTAAACTTTTTAATGGTTCCCCTTTATTTGGACTGATTAAAAATTCTACAAATTCGATTCCATCAATATTCGGTTCTTCTAATTTTTTAAAt < 2:13705/141‑1 (MQ=255) tttAACGCTAACATAATTCTAGAAAGTTCTCCACCTGACGCAATTTTATTTAAACTTTTTAATGGTTCCCCTTTATTTGGACTGATTAAAAATTCTACAAATTCGATTCCATCAATATTCGGTTCTTCTAATTTTTTAAAt < 2:13709/141‑1 (MQ=255) | TTTAACGCTAACATAATTCTAGAAAGTTCTCCACCTGACGCAATTTTATTTAAACTTTTTAATGGTTCCCCTTTATTTGGACTGATTAAAAATTCTACAAATTCGATTCCATCAATATTCGGTTCTTCTAATTTTTTAAAT > USA300TCH1516_ALE/1637220‑1637360 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |