Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | USA300TCH1516_ALE | 1988768 | 1988872 | 105 | 2 [1] | [1] 2 | trmL | tRNA (cytidine(34)‑2'‑O)‑methyltransferase |
TTATAATGAAAATGAGTAAATTTTAATTCAATCCCGGAAAATCTTGTTGACGTAACGCTTCATAAATTAACAACGCAGCAGTATTTGATAAATTTAATGAACGAATATGTTCACTCATAGGAATTCTTAACGCTGTGTCTTGATATTTCTCTTTCACCCAGTCTGGT > USA300TCH1516_ALE/1988627‑1988793 | ttATAATGAAAATGAGTAAATTTTAATTCAATCCCGGAAAATCTTGTTGACGTAACGCTTCATAAATTAACAACGCAGCAGTATTTGATAAATTTAATGAACGAATATGTTCACTCATAGGAATTCTTAACGCTGTGTCtt < 1:4531/141‑1 (MQ=255) ttCAATCCCGGAAAATCTTGTTGACGTAACGCTTCATAAATTAACAACGCAGCAGTATTTGATAAATTTAATGAACGAATATGTTCACTCATAGGAATTCTTAACGCTGTGTCTTGATATTTCTCTTTCACCCAGTCTGGt < 2:8236/141‑1 (MQ=255) | TTATAATGAAAATGAGTAAATTTTAATTCAATCCCGGAAAATCTTGTTGACGTAACGCTTCATAAATTAACAACGCAGCAGTATTTGATAAATTTAATGAACGAATATGTTCACTCATAGGAATTCTTAACGCTGTGTCTTGATATTTCTCTTTCACCCAGTCTGGT > USA300TCH1516_ALE/1988627‑1988793 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |