Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | USA300TCH1516_ALE | 1915881 | 1916062 | 182 | 2 [1] | [1] 2 | metK/pckA | S‑adenosylmethionine synthase/Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP) |
TGTCTGCAAACGGTTTGGCACCTTTCTTTTATAAAAAAGAGGTTGCTGGGTTTCATTGGGTCCATGTCCCTCCACCACTCAGGATAAGAGAATCCGTTAAAAATAATAGTACCTAATTAATGAATTAATGTCAATTTTTCACAAATAAATTTACGGTAAAATATTGTAGATTAATTATGTTAATGTGTTATACTAATTAAATGTAAAGGCTTACATTTAAATTATCGCTTTGGAGGGATTTAGGATGTCAGTAGAC > USA300TCH1516_ALE/1915948‑1916203 | tGTCTGCAAACGGTTTGGCACCTTTCTTTTATAAAAAAGAGGTTGCTGGGTTTCATTGGGTCCATGTCCCTCCACCACTCAGGATAAGAGAATCCGTTAAAAATAATAGTACCTAATTAATGAATTAATGTCAATTTTTca > 1:29227/1‑141 (MQ=255) attaatgaattaatgTCAATTTTTCACAAATAAATTTACGGTAAAATATTGTAGATTAATTATGTTAATGTGTTATACTAATTAAATGTAAAGGCTTACATTTAAATTATCGCTTTGGAGGGATTTAGGATGTCAGTAGac < 2:29227/141‑1 (MQ=255) | TGTCTGCAAACGGTTTGGCACCTTTCTTTTATAAAAAAGAGGTTGCTGGGTTTCATTGGGTCCATGTCCCTCCACCACTCAGGATAAGAGAATCCGTTAAAAATAATAGTACCTAATTAATGAATTAATGTCAATTTTTCACAAATAAATTTACGGTAAAATATTGTAGATTAATTATGTTAATGTGTTATACTAATTAAATGTAAAGGCTTACATTTAAATTATCGCTTTGGAGGGATTTAGGATGTCAGTAGAC > USA300TCH1516_ALE/1915948‑1916203 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |