Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | USA300TCH1516_ALE | 322076 | 322150 | 75 | 2 [1] | [1] 2 | USA300HOU_RS01440/lytM_2 | Penicillin acylase/Glycyl‑glycine endopeptidase LytM |
AAATAGTTGGAAAATGAGAATTAAATCCTTTACTCAGTTGTCTAATTCTTTTAGTATGTGCAGTACAGTTTAATTGAAAACTAACTTTAACTTTAATGGAGGATGTTTTATACATGAAAAAATTAACAGCAGCAGCGATTGCAACGATGGGCTTCGCTACATTTACA > USA300TCH1516_ALE/322125‑322291 | aaaTAGTTGGAAAATGAGAATTAAATCCTTTACTCAGTTGTCTAATTCTTTTAGTATGTGCAGTACAGTTTAATTGAAAACTAACTTTAACTTTAATGGAGGATGTTTTATACATGAAAAAATTAACAGCAGCAGCGATTg > 2:2263/1‑141 (MQ=255) ccTTTACTCAGTTGTCTAATTCTTTTAGTATGTGCAGTACAGTTTAATTGAAAACTAACTTTAACTTTAATGGAGGATGTTTTATACATGAAAAAATTAACAGCAGCAGCGATTGCAACGATGGGCTTCGCTACATTTACa > 1:60533/1‑141 (MQ=255) | AAATAGTTGGAAAATGAGAATTAAATCCTTTACTCAGTTGTCTAATTCTTTTAGTATGTGCAGTACAGTTTAATTGAAAACTAACTTTAACTTTAATGGAGGATGTTTTATACATGAAAAAATTAACAGCAGCAGCGATTGCAACGATGGGCTTCGCTACATTTACA > USA300TCH1516_ALE/322125‑322291 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |