| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 528464 = | 96 (0.690) | 7 (0.060) | 5/230 | NT | 7.3% | intergenic (+5/‑162) | dtd3/rnmV_1 | D‑aminoacyl‑tRNA deacylase/Ribonuclease M5 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 528541 = | 92 (0.740) | intergenic (+82/‑85) | dtd3/rnmV_1 | D‑aminoacyl‑tRNA deacylase/Ribonuclease M5 | |||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
TAGAGGGAAGCGAAATGAACCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAATTA > USA300TCH1516_ALE/528324‑528602 | tAGAGGGAAGCGAAATGAACCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTA < 2:844274‑M1/141‑1 (MQ=255) gagGGAAGCGAAATGAACCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAA > 4:420228‑M1/1‑141 (MQ=255) gagGGAAGCGAAATGAACCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAA < 2:566426‑M1/141‑1 (MQ=255) acacgctcagtatcatctcgtccttctacaactataaactcattgattttcatttaaaacgccttcctacaattcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaaaa < 2:74554‑M1/3‑1 (MQ=255) acacgctcagtatcatctcgtccttctacaactataaactcattgattttcatttaaaacgccgtcctacaattctcaataccaaggcttttaccatctctatcgcacgtagttcacatgcacgatattttattttaaaaa < 1:297653‑M1/3‑1 (MQ=255) cacgctcagtatcatctcgtccttctacaactataaactcattgattttcatttaaaacgccttcctacaattcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaaaaa > 2:693583‑M1/138‑141 (MQ=255) cgctcagtatcatctcgtccttctacaactataaactcattgattttcatttaaaacgccttcctacaattcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGt > 4:342122‑M1/136‑141 (MQ=255) gctcagtatcatctcgtccttctacaactataaactcattgattttcatttaaaacgccttcctacaattcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTg > 3:302864‑M1/135‑141 (MQ=255) gctcagtatcatctcgtccttctacaactataaactcattgattttcatttaaaacgccttcctacaattcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgaattccacatgcccgatattttaatttaaAAAAGTg < 1:839492‑M1/7‑1 (MQ=255) ctcagtatcatctcgtccttctacaactataaactcattgattttcatttaaaacgccttcctacaattcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTga < 1:796905‑M1/8‑1 (MQ=255) aaGCGAAATGAACCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGA > 1:1164389‑M1/1‑141 (MQ=255) aGCGAAATGAACCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAG > 2:628351‑M1/1‑141 (MQ=255) gCGAAATGAACCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGA > 3:452166‑M1/1‑141 (MQ=255) cGAAATGAACCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAA > 4:44133‑M1/1‑141 (MQ=255) gtatcatctcgtccttctacaactataaactcattgattttcatttaaaacgccttcctacaattcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTGAGaaa < 3:44133‑M1/12‑1 (MQ=255) tatcatctcgtccttctacaactataaactcattgattttcatttaaaacgccttcctacaattcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTGAGAAAg < 1:91431‑M1/13‑1 (MQ=255) aaaTGAACCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAG > 2:1083690‑M1/1‑141 (MQ=255) atcatctcgtccttctacaactataaactcattgattttcatttaaaacgccttcctacaattcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTGAGAAAGa < 2:1014463‑M1/14‑1 (MQ=255) aaTGAACCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGGGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGA > 2:304791‑M1/1‑141 (MQ=255) aTGAACCTGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGAt > 3:398742/1‑141 (MQ=255) aCCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCAcc > 2:473780/1‑141 (MQ=255) ggCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGcc > 3:329321/1‑141 (MQ=255) ggCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGcc < 1:25625/141‑1 (MQ=255) cGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCAt < 3:369304/141‑1 (MQ=255) tAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGt < 1:360315/141‑1 (MQ=255) aCTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTaa > 1:774759/1‑141 (MQ=255) cTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTaaa > 3:481531/1‑141 (MQ=255) gtagCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATg > 2:1070138/1‑141 (MQ=255) cTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCtat > 1:95588/1‑141 (MQ=255) tGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCtata > 2:727490/1‑141 (MQ=255) tGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCtata > 1:499500/1‑141 (MQ=255) gAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTatat < 2:395486/141‑1 (MQ=255) aaaTTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGt > 1:268214/1‑141 (MQ=255) aaaTTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGt < 1:941982/141‑1 (MQ=255) aaaTTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGt > 3:499496/1‑141 (MQ=255) aTTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGttt > 2:796905/1‑141 (MQ=255) ttGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTa > 2:610359/1‑141 (MQ=255) tGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTaa > 1:289319/1‑141 (MQ=255) tGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTaa > 2:534920/1‑141 (MQ=255) tGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAatat < 3:16356/141‑1 (MQ=255) ttAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTa < 2:164857/141‑1 (MQ=255) gCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtct < 1:1014463‑M2/141‑4 (MQ=255) cttatcttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctt < 2:201234‑M2/141‑5 (MQ=255) ttatcttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtcttt > 4:1080‑M2/1‑136 (MQ=255) ttatcttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtcttt < 2:319203‑M2/141‑6 (MQ=255) tcttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctttctc < 3:378405‑M2/141‑9 (MQ=255) tcttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctttctc < 2:191805‑M2/141‑9 (MQ=255) cttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctttctca < 4:67862‑M2/141‑10 (MQ=255) cttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctttctca < 4:502202‑M2/141‑10 (MQ=255) aattcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCAc > 2:754892‑M1/69‑141 (MQ=255) aattcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCAc > 2:1094601‑M1/69‑141 (MQ=255) ttcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACtt > 3:347188‑M1/67‑141 (MQ=255) atGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctttctcactt < 1:1176295‑M2/141‑13 (MQ=255) gaagaaGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctttctcactttt > 3:497986‑M2/1‑127 (MQ=255) gaagaaGNGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctttctcactttt > 2:896664‑M2/1‑127 (MQ=255) aagaagTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACttttt < 1:1144277/141‑1 (MQ=255) aagaagTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACttttt < 1:668785/141‑1 (MQ=255) aagTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTttaa > 3:193271/1‑141 (MQ=255) agTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGAaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcg > 1:59633‑M1/1‑73 (MQ=255) agTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTttaaa > 1:348528/1‑141 (MQ=255) gtgtGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTttaaat > 1:1019155/1‑141 (MQ=255) gtgtGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTttaaat > 1:728123/1‑141 (MQ=255) tcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTttaaatt > 3:188001‑M1/58‑141 (MQ=255) tgCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGAaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaactttatg < 3:344884‑M1/141‑73 (MQ=255) gagtacaaacaaAAAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATATATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTttaaattaaa < 2:860256/137‑1 (MQ=255) gCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTttaaattaaa > 4:261376/1‑141 (MQ=255) cacaacaaacaACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTttaaattaaa < 2:119798/138‑1 (MQ=255) acaaacaaCTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAatat < 2:274793/141‑1 (MQ=255) caaacaaTTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATc < 2:827486/141‑1 (MQ=255) caaacaaCTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATc < 2:794824/141‑1 (MQ=255) acaacTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTg > 2:969991/1‑141 (MQ=255) caacTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGc < 1:629394/141‑1 (MQ=255) caacTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAAATTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATAACCGCAATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGc > 2:1123118/1‑141 (MQ=255) acTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCAt > 1:15600/1‑141 (MQ=255) aaaaTGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTgg < 1:201234/141‑1 (MQ=255) aaaaTGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTgg > 3:247762/1‑141 (MQ=255) tGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATa > 3:369631/1‑141 (MQ=255) cAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACg < 2:217957/141‑1 (MQ=255) cAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACg > 1:819785/1‑141 (MQ=255) agagAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGt > 2:122268/1‑141 (MQ=255) agaAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGc < 3:246008/141‑1 (MQ=255) agaAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGc > 4:230776/1‑141 (MQ=255) aaaTTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGa < 1:201193/141‑1 (MQ=255) aaTGGTGTAATTTAAAGTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACGGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGAt < 2:923061/141‑1 (MQ=255) aTTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATa < 1:1128888/141‑1 (MQ=255) aatttaaATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATgg > 3:186003/1‑141 (MQ=255) atttaaATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGt < 1:924883/141‑1 (MQ=255) atttaaATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATACTATATACGTTTACTATGCTATGGCTCTATCTCTCATTTTTAAATTAAAATATCGTGCAGGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGt < 1:237550/141‑1 (MQ=255) aTTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGc < 2:210018/141‑1 (MQ=255) ttCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCt < 1:902998/141‑1 (MQ=255) tCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCtt > 2:517654/1‑141 (MQ=255) aTAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTTTTTTTTTTTATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCtttt > 2:84389/1‑140 (MQ=255) tAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctttctcacttttaactttatgaatttaaattaaacaatttctctgcatttttagttgtttgttcgcaca < 1:963997‑M2/141‑72 (MQ=255) tAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGa > 1:583959/1‑141 (MQ=255) tAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGa > 1:1127363/1‑141 (MQ=255) aaGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGaaa > 1:44457/1‑141 (MQ=255) aaGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGaaa > 2:588052/1‑141 (MQ=255) aaGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGaaa < 2:413450/141‑1 (MQ=255) aGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAAt < 1:997669/141‑1 (MQ=255) ttAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAATTa < 1:1070138/141‑1 (MQ=255) | TAGAGGGAAGCGAAATGAACCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAATTA > USA300TCH1516_ALE/528324‑528602 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |