| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | USA300TCH1516_ALE | 1,747,374 | Δ3 bp | 52.7% | coding (2073‑2075/2280 nt) | USA300HOU_RS08710 ← | Heme uptake protein MmpL11 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1747377 = | 52 (0.370) | 54 (0.410) | 50/242 | NT | 52.7% | coding (2072/2280 nt) | USA300HOU_RS08710 | Heme uptake protein MmpL11 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1747373 | 48 (0.370) | coding (2076/2280 nt) | USA300HOU_RS08710 | Heme uptake protein MmpL11 | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
ATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAA > USA300TCH1516_ALE/1747234‑1747513 | aTTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAa > 1:719238‑M2/1‑140 (MQ=255) tttCAACTGACGTTTTTTTATTTTTACCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATGGAAGAGAAGACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTACAGTAAAGTTGAATATCGTAGGCGCACCGAAGAATCGTATAGCAactac > 4:124330/1‑141 (MQ=255) tttCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactac > 2:829782‑M2/1‑136 (MQ=255) tttCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactac < 2:112106‑M2/141‑6 (MQ=255) tCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactacta < 1:320017‑M2/141‑8 (MQ=255) cAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactac < 2:154317‑M2/141‑9 (MQ=255) cAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactac > 2:46213‑M2/1‑133 (MQ=255) cTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACtactactac > 1:1090401/1‑141 (MQ=255) cTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACtactactac < 1:244775/141‑1 (MQ=255) cTGACGTTTTTTCATTATTCCCAATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGGAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAActactactat < 3:386128/141‑2 (MQ=255) gTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactg > 2:494410‑M2/1‑125 (MQ=255) tttttCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACt < 4:215185/141‑1 (MQ=255) tttttCATTACTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATTCACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgtt > 2:488079‑M2/1‑123 (MQ=255) ttttCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgtta < 4:128151‑M2/141‑20 (MQ=255) ttCATTATTCCCCATTTGAAAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGtt < 1:664701/141‑1 (MQ=255) ttCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaat < 1:131874‑M2/141‑22 (MQ=255) ttCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGtt < 3:121991/141‑1 (MQ=255) tCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaata > 4:275793‑M2/1‑119 (MQ=255) cATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatac > 2:584412‑M2/1‑118 (MQ=255) cATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatac > 3:29064‑M2/1‑118 (MQ=255) tttttttccATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATa > 2:493295/8‑141 (MQ=255) attCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACt < 2:728644/141‑1 (MQ=255) ttCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGCATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtat < 2:610828‑M2/141‑29 (MQ=255) tCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtatt < 3:176793‑M2/141‑30 (MQ=255) ccccATAGCGGAACGTTAATGAAGATTGAAGTGAATACAACATAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAaatactacaatatctgttaagactgtatta > 1:1050042‑M2/1‑111 (MQ=255) ccccATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtatta < 1:1063222‑M2/141‑31 (MQ=255) aTAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattg < 4:469033‑M2/141‑35 (MQ=255) aTAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTaa > 1:589271/1‑141 (MQ=255) aGCGGAAAGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAAtt < 4:343863/141‑1 (MQ=255) gAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAAc > 1:264156/1‑141 (MQ=255) aaCGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACg > 3:207271/1‑141 (MQ=255) aaCGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACg > 4:190815/1‑141 (MQ=255) aCGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtc < 1:9148‑M2/141‑43 (MQ=255) cGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACgtg < 2:988206/141‑1 (MQ=255) cGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACgtg < 4:481964/141‑1 (MQ=255) cGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACgtg > 1:886674/1‑141 (MQ=255) cGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACgtg < 4:257975/141‑1 (MQ=255) cAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGAAAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattg > 2:739477‑M2/1‑95 (MQ=255) aTGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtc > 4:41396‑M2/1‑93 (MQ=255) gAAGATTGAAGAGAATACACCATAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATtgt < 2:1057410/141‑1 (MQ=255) aaGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgt > 1:590190‑M2/1‑90 (MQ=255) aGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtc > 3:128151‑M2/1‑89 (MQ=255) aTTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAa < 2:1193698‑M2/88‑2 (MQ=255) tGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaat < 3:337547‑M2/141‑57 (MQ=255) tGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTgtctgtct > 2:637796/1‑141 (MQ=255) tGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTgtctgtct < 2:926473/141‑1 (MQ=255) aaGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattg > 2:1176428‑M2/1‑83 (MQ=255) agagAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattga < 2:394961‑M2/141‑60 (MQ=255) tACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctatt > 4:405375‑M2/1‑76 (MQ=255) aaaTCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatat > 3:91368‑M2/1‑68 (MQ=255) tcaatcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGatat > 4:120172/1‑141 (MQ=255) caatcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatc < 1:824387‑M2/141‑78 (MQ=255) caatcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATatc > 2:257409/1‑141 (MQ=255) caatcCAATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcagtgtctgtctaattgatccattaacgatatcatc < 2:889040‑M2/141‑78 (MQ=255) aatcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATatca > 4:49082/1‑141 (MQ=255) atcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgtggatgctgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaa < 1:622324‑M2/141‑80 (MQ=255) atcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATatcat > 2:746748/1‑141 (MQ=255) tcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATatcatc > 1:736657/1‑141 (MQ=255) ccGATAGATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCATCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATAtcatca < 2:1140900/141‑1 (MQ=255) ccGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatt < 1:399086‑M2/141‑82 (MQ=255) ccGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATAtcatca > 3:186964/1‑141 (MQ=255) cGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTGGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaatgcctgtcaatacggtattaattgaacgtgtcattgtctggctaattggcctatttacgatatcatcaattt > 2:491842‑M2/1‑59 (MQ=255) ataaataaTGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgt < 2:1091246‑M2/141‑85 (MQ=255) taaataaTGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAAttt > 4:475863/1‑141 (MQ=255) aataatGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttct < 1:942358‑M2/141‑88 (MQ=255) aataatGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGt > 2:12193/1‑141 (MQ=255) ataatGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGtt > 2:928657/1‑141 (MQ=255) atGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCtg < 2:520341/141‑1 (MQ=255) taaagtaaagTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgt > 2:147681‑M2/1‑46 (MQ=255) aagtaaagtTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtatgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaa < 3:129882‑M2/141‑98 (MQ=255) aaattTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAAt < 2:207809/141‑1 (MQ=255) agtTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtctctttgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactt > 2:85087‑M2/1‑38 (MQ=255) ttGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcacttta > 2:1110477‑M2/1‑36 (MQ=255) tGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACtt < 2:19590/141‑1 (MQ=255) gAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaac > 1:154317‑M2/1‑34 (MQ=255) atatCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTaa > 3:110271/1‑141 (MQ=255) tatCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaacctt > 1:90926‑M2/1‑31 (MQ=255) atCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttt > 2:37737‑M2/1‑30 (MQ=255) gTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCttt > 2:351035/1‑141 (MQ=255) gTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCttt > 3:37462/1‑141 (MQ=255) gTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCttt < 2:584397/141‑1 (MQ=255) tggaGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtccttgtctgtctaattgctctatcaacgatatcaccaacttgttctgttgtcgtaatccctttcaccttttgtaa < 1:1133959‑M2/140‑117 (MQ=255) aGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTg < 4:328472/141‑1 (MQ=255) aGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTg < 1:1058852/141‑1 (MQ=255) gAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagt > 1:762838‑M2/1‑23 (MQ=255) gAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagt < 4:382665‑M2/141‑119 (MQ=255) aCCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttc < 2:1054298‑M2/141‑123 (MQ=255) ccGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGttt < 1:747766/141‑1 (MQ=255) cGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcac > 1:229304‑M2/1‑17 (MQ=255) gaagaaTAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacg > 1:433210‑M2/1‑16 (MQ=255) agaaTAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaactatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacgta < 3:133832‑M2/141‑128 (MQ=255) gaaTAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacgtac > 1:176778‑M2/1‑13 (MQ=255) aaTAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattatctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacgtaca < 2:420848‑M2/141‑130 (MQ=255) aTAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTa > 4:255394/1‑141 (MQ=255) aGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTaca < 1:555865/141‑1 (MQ=255) gTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacgtacacggt > 1:179499‑M2/1‑8 (MQ=255) gCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacgtacacggtcaaac < 4:142376‑M2/141‑139 (MQ=255) cAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCaa < 1:496292/141‑1 (MQ=255) aaCTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCatg > 2:751687/1‑139 (MQ=255) aaCTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCaaa > 3:354236/1‑141 (MQ=255) | ATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAA > USA300TCH1516_ALE/1747234‑1747513 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |