| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2857675 = | 139 (0.990) | 3 (0.020) | 3/238 | NT | 2.3% | intergenic (+71/‑172) | nixA/nhoA | High‑affinity nickel‑transport protein NixA/N‑hydroxyarylamine O‑acetyltransferase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2857737 = | 125 (0.970) | intergenic (+133/‑110) | nixA/nhoA | High‑affinity nickel‑transport protein NixA/N‑hydroxyarylamine O‑acetyltransferase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
CTAGATAAGGCAACTTGTCTTGCAACTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAAGTTAGAGAATTATTTAC > USA300TCH1516_ALE/2857597‑2857877 | cTAGATAAGGCAACTTGTCTTGCAACTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTAt > 2:1004645/1‑141 (MQ=255) tAGATAAGGCAACTTGTCTTGCAACTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTAtt < 1:775917/141‑1 (MQ=255) aGATAAGGCAACTTGTCTTGCAACTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTAttt > 2:879296/1‑141 (MQ=255) aGATAAGGCAACTTGTCTTGCAACTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTAttt > 1:256286/1‑141 (MQ=255) gATAAGGCAACTTGTCTTGCAACTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTAtttt < 3:23999/141‑1 (MQ=255) ggCAACTTGTCTTGCAACTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTAt > 3:332884/1‑141 (MQ=255) gCAACTTGTCTTGCACCTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTAtt < 4:223662/141‑1 (MQ=255) gCAACTTGTCTTGCAACGACCTTTGTATTGTGGCATATTTAGTCACCCTGCTCACTTCTTCCATTATGCTACGCGCTCGGAAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTACAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTact < 4:391457/141‑3 (MQ=255) cAACTTGTCTTGCAACTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTAttt > 1:532055/1‑141 (MQ=255) cAACTTGTCTTGCAACTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTAttt > 1:548030/1‑141 (MQ=255) gTCTTGCAACTACCTTTGTATTCTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCCTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATg < 3:419950/141‑1 (MQ=255) cTTGCAACTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTa > 4:210678/1‑141 (MQ=255) cTTGCAACTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTa > 1:844300/1‑141 (MQ=255) cTTGCAACTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTa < 4:164411/141‑1 (MQ=255) ttGCAACTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTAt < 3:435208/141‑1 (MQ=255) aaCTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTCGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTAt < 2:605505/141‑1 (MQ=255) aaCTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTAt > 1:493296/1‑141 (MQ=255) aCTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATc < 1:391093/141‑1 (MQ=255) tACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCTCACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCa < 1:1104842/141‑1 (MQ=255) tGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTc < 3:262331/141‑1 (MQ=255) gttgCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCt > 1:140737/1‑141 (MQ=255) cATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCg < 3:145841/141‑1 (MQ=255) ttttAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAAt > 1:883783/1‑141 (MQ=255) ttAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAAttt < 2:388096/141‑1 (MQ=255) tAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTa > 2:1137240/1‑141 (MQ=255) tAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTa > 3:301250/1‑141 (MQ=255) gACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCTTTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTaca > 4:171835/1‑139 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1:1025433/1‑141 (MQ=255) gCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGt < 3:496298/141‑1 (MQ=255) cacaCTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTa > 1:1059781/1‑141 (MQ=255) acacTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTAt < 3:168711/141‑1 (MQ=255) acacTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTAt > 1:23876/1‑141 (MQ=255) acTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTAttt > 1:26423/1‑141 (MQ=255) acTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTAttt > 2:1171621/1‑141 (MQ=255) ttcttcCATTATGCTACGCTCTGAGTAGTCATCTTGAACTCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTGATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCt > 4:437233/1‑141 (MQ=255) ttcttcCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCt > 1:700381/1‑141 (MQ=255) ttcttcCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCt < 4:332884/141‑1 (MQ=255) tcttcCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTg > 2:163535/1‑141 (MQ=255) tcCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGttt > 1:139626/1‑141 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GCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATtat > 1:679012‑M1/1‑141 (MQ=255) CTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAAt > 1:1004645‑M1/1‑141 (MQ=255) AGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCtt > 1:654620‑M1/1‑141 (MQ=255) AGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCtt < 1:761229‑M1/141‑1 (MQ=255) AGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATGTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAGTTCAATGCTTTCGAATTTACAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCtt < 4:379856‑M1/141‑1 (MQ=255) gtagtCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCttt < 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(MQ=255) gagaTGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATtat < 2:26880/107‑1 (MQ=255) gagaTGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAat > 1:485558/1‑141 (MQ=255) gagaTGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAat < 1:703292/141‑1 (MQ=255) agaTGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAata > 2:980911/1‑141 (MQ=255) tGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTCTGCTTATGAATAttt > 4:283217/1‑140 (MQ=255) gACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGc < 1:288898/141‑1 (MQ=255) tCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAAg > 3:480485/1‑141 (MQ=255) aTTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAAGtt > 2:1088440/1‑141 (MQ=255) ttttGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGTATATTGTGATGtaa > 2:887701/1‑139 (MQ=255) ttttGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAGTATTGCGAAGTTa > 1:620337/1‑141 (MQ=255) ttGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAAGTTaga < 3:192629/141‑1 (MQ=255) gagagcgtaTTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAAGTTAgaga < 2:865177‑M2/132‑1 (MQ=255) agagcgtaTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAAGTTAGAGaa > 2:1030852‑M2/9‑141 (MQ=255) agagcgtaTTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAATTTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAGGTTAGAGaa > 2:453458‑M2/9‑141 (MQ=255) agagcgtaTTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAAGTTAGAGaa > 2:720914‑M2/9‑141 (MQ=255) cgtaTTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGATGTTAGAGAattat > 3:246581‑M2/5‑141 (MQ=255) cgtaTTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAAGTTAGAGAattat < 1:347030‑M2/137‑1 (MQ=255) cgtaTTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAAGTTAGAGAattat > 3:362717‑M2/5‑141 (MQ=255) cgtaTTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAAGTTAGAGAattat < 2:879188‑M2/137‑1 (MQ=255) taTTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAAGTTAGAGAATTAttt < 1:447237‑M2/139‑1 (MQ=255) taTTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAACTTAATTATAATCTTGAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAAGTTAGAGAATTAttt < 1:86853‑M2/139‑1 (MQ=255) tttttCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAAGTTAGAGAATTATTTAc > 2:147963/1‑141 (MQ=255) | CTAGATAAGGCAACTTGTCTTGCAACTACCTTTGTATTGTTGCATTTTTAGACACCCTGCACACTTCTTCCATTATGCTACGCTCTCAGTAGTCATCTTTAAATCGTTTCTTTTAGAGATGACTTCATTTTGAGAGCGTATTTTTCTATTTAAAATGTATTTATCCAAAATTCAATGCTTTCGAATTTAAAATTTCAGTATTTCTGTTTAAAATTTAATTATAATCTTTAATACAGGAGGCGCTATGCTTATGAATATTGCGAAGTTAGAGAATTATTTAC > USA300TCH1516_ALE/2857597‑2857877 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |