New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_012417 | = 1974 | 732 (0.920) | 5 (0.010) | 4/238 | NT | 0.73% | intergenic (+207/+119) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_012417 | = 2041 | 687 (0.940) | intergenic (+274/+52) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/1824‑1974 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaacccttaacAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATG < NC_012417/2041‑1903 tttttTTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGTAGAAAAATATGATTATTATGTATATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGTCGTGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAG > 2:416739/6‑141 tttTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAACAATATGATTATTTTGAAGATAATAAAAAATAGAAGACGCATTTATGCCGAGAAAATATATTGATGTTGAG‑‑‑AAG > 2:482577/4‑141 ttCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAG < 2:522903/139‑1 tctttTTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGCAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGTGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAG > 2:308673/6‑141 tcaTATTTGTGTTGTTGCGTACTTTTTGTTTTTCTAGAGAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAAGATGATTATCTTGATGATAATAAAAAATAGACGGCGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAG < 1:347927/138‑1 TCCTGTTGGTGTTGGTGTTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATTATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAG < 1:752148/141‑1 TCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTCTCATGAAGATAATAAAAAATAGCCGACCCATTTATGCCGAGAAACTTTATTGATGTTGCG‑‑‑AAG > 1:293656/1‑141 TCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGTCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAG < 2:344603/141‑1 TCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAG > 1:104972/1‑141 TCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAG < 1:41652/141‑1 TCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAG < 1:481571/141‑1 TCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAG < 2:16101/141‑1 TCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAG < 1:234368/141‑1 tCTATTGTGGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGA < 2:487185/140‑1 tCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTTTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTAGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGA < 2:536680/140‑1 CCTATTGGTTTTTTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTCACGAGATGAAAGAAAAATATGATTATCATTAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGA < 2:818773/141‑1 CCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGTCGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGA < 1:573523/141‑1 CCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTCTGCTGTGGAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGA < 2:593869/141‑1 CCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGA < 1:124567/141‑1 tTATTGGTGTTGTTGTTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAACAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAA < 2:430508/140‑1 cttTTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAA < 2:815163/138‑1 CTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGCCGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAGTAAAAAATAGCCGACGCAGTTAGGCAGAGAAAATTTATTGATGTTGAA‑‑‑GAGAA > 2:530021/1‑141 CTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGCTGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTAATGTTGAG‑‑‑AAGAA > 2:717949/1‑141 CTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAA > 1:245805/1‑141 CTATTGGTGGTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGAAGAGGTGTAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGGGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAA > 1:159180/1‑141 TATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGACCTATAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAAC < 2:384876/141‑1 TATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTCAGGACGAGAGGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTTTGCCGAGAAAATTTATTGATGTTTAT‑‑‑AAGAAC > 2:720426/1‑141 TATTGGTGTTGTTGCTTACTATTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAAC > 1:506613/1‑141 TATGGGTGTTGGTGCTTACTTGTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCAAGAAAAAAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAAC < 2:284422/141‑1 ATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAGGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACC > 1:328918/1‑141 ATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACC > 1:593586/1‑141 TTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCC < 1:204706/141‑1 TTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCC < 2:761579/141‑1 tgggttcGTTGCTTTCTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGAATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCT < 2:5099/134‑1 TGGTGTTGTTGTTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCT < 1:9456/141‑1 TGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCT < 1:230625/141‑1 TGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTCCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATCATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCT < 1:514498/141‑1 GGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTT < 1:114741/141‑1 GGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTAATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTT > 2:296335/1‑141 GTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGACGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTTA > 2:362171/1‑141 GTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATGTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AGGAACCCATA > 1:334676/1‑141 TGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTTAA < 2:755855/141‑1 TGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTTAA < 2:466324/141‑1 TGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTTAA > 1:76713/1‑141 TGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTTAA < 2:145597/141‑1 TGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTTAA > 1:244790/1‑141 tTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTTAAC < 2:110803/140‑1 ggTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTTTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGCCGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTTAAC < 2:410341/139‑1 TTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGACGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAA‑‑‑AAGAACCCTTAAat > 2:58048/1‑139 TTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTTTCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AGGAACCCTTAgct > 1:115480/1‑138 TTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCGTTTATACAGAGAAAATTTATTGATATTAGG‑‑‑AAGAAGCCTTAAat > 2:66596/1‑139 TGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AACAACCCTTAccta > 1:353899/1‑137 TTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAG > 2:466025/1‑110 AATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGAAGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCT > 2:552143/1‑141 TATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTT < 1:552143/141‑1 ATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGAAAGTTTAGTTAAGGGT > 2:713895/1‑141 gctttgATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGCATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGTCGACCTTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAA < 1:773068/135‑1 cCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAA < 1:372651/140‑1 cccGAACCCTTAACAACCCCAAAACTTGTCCAATGGGCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTT < 2:321317/138‑1 cggaaaaCTTAACAATCCATAAGCTGGTCGAATGGTCTGCTTAATATCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTA < 2:209332/134‑1 tGAACCCTTAACTAGCCCATATCTTGTCGACTGGTCCGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTGTAGTTAAGTGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTAT < 1:713895/140‑1 GAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCGTAAATGCGTCGTCTATTTTTTATT < 1:535301/141‑1 GAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATT < 2:81331/141‑1 GAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATT < 2:620184/141‑1 AACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTA > 1:797063/1‑141 AACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTA > 2:498459/1‑141 ACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTTGTCTATTTTTTATTAT < 1:466221/141‑1 ACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTAT > 1:298359/1‑141 ACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTAT > 1:635150/1‑141 ACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTAT < 2:186167/141‑1 ACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTAT > 2:408403/1‑141 CCCTTAACAATCCCAAAGCTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCTTCTATTTTTTATTATC < 1:498122/141‑1 CCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATCAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCT > 1:831890/1‑141 CCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATat > 2:349716/1‑139 CCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCT > 2:431149/1‑141 CCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCT > 2:210887/1‑141 CCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCT > 1:743024/1‑141 CCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCT > 1:225053/1‑141 CCTTAACAAACCTAAAACTAGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATCCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCCACACCAATAAACATTCACGGCATAAATCCGTCGTCTACTTTGTATTATgt > 2:469249/1‑139 CTTAACAATCCCAAATCGTGTCGAATGGTCTGTTTTATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCATGTTTAGTTAAGGGTGCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTT < 2:214587/141‑1 CTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTT > 2:796643/1‑141 CTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTT > 2:563969/1‑141 CTTAACAATCCCAAAACTTGGCGAATGGTCGACTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAACTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTAGCTT > 2:29152/1‑141 CTTAACAATCCCAAAACGTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTAAGCCGTGATTCGGCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATGAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTT < 1:438332/141‑1 TTAACCATCCCAAAACTAGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTC < 1:279976/141‑1 TTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTC < 1:294793/141‑1 TTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTC < 2:205477/141‑1 TTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTC > 2:66345/1‑141 TTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTC < 1:215275/141‑1 TTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTC > 2:505678/1‑141 TTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTCTATTATCTTC < 2:568129/141‑1 TTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGATAAACGTAATAGCTTGCGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTC > 1:795570/1‑141 TAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCA < 2:206050/141‑1 TAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCA < 1:750673/141‑1 AACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCAT < 1:459342/141‑1 AACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCAT < 1:459636/141‑1 AACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCATCGTCTATTTTTTATTATCTTCAT > 1:116135/1‑141 AACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATCCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAATTAAGAGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGACGTCTATTTTTTATTATCTTCAT > 1:464844/1‑141 ACAATCCCAAACCTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATG < 1:315865/141‑1 ACAATCCCAAAACTTGGCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATG < 1:17843/141‑1 TCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAG‑‑‑AAGAACCCTTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/1824‑1974 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaacccttaacAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATG < NC_012417/2041‑1903 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |