New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_012417 | 2725 = | 941 (1.180) | 6 (0.010) | 4/250 | NT | 0.66% | intergenic (‑51/–) | USA300HOU_RS14900/– | hypothetical protein/– |
? | NC_012417 | 2752 = | 914 (1.190) | intergenic (‑78/–) | USA300HOU_RS14900/– | hypothetical protein/– | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 1086 total aligned reads displayed.
AAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCA > NC_012417/2585‑2865 | cctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaattaacaaaattaaaaattaaaaatacagataataaaataatcaaaaattaaaaaaacttattc < 1:145527‑M1/1‑1 (MQ=255) cctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaattaacaaaattaaaaattaaaaatacagataataaaataatcaaaaagtaaaaaaacttattc > 2:646587‑M1/141‑141 (MQ=255) aaaaTCCAAGACCATTGAAAGTATTGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAAc < 2:311765/141‑1 (MQ=255) aaaaTCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAAc < 1:400763/141‑1 (MQ=255) ctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaattaacaaaattaaaaattaaaaatacagataataaaataatcaaaaagtaaaaaaacttattCa < 2:807493‑M1/2‑1 (MQ=255) taaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaattaacaaaattaaaaattaaaaatacagataataaaataatcaaaaagtaaaaaaacttattCat < 1:379957‑M1/3‑1 (MQ=255) aaTCCAAGACCATTTAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACat < 2:232120/141‑1 (MQ=255) aTCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACata > 2:117923/1‑141 (MQ=255) aTCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACata > 2:769077/1‑141 (MQ=255) aCCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTACAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAAc < 2:426221/141‑1 (MQ=255) aCCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAAc > 1:577425/1‑141 (MQ=255) cATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACaa > 1:691130/1‑141 (MQ=255) aaGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGt > 1:123255/1‑141 (MQ=255) aaGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGt > 2:152460/1‑141 (MQ=255) aaGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGt > 1:420099/1‑141 (MQ=255) aaGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGt > 2:522418/1‑141 (MQ=255) aGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATCGAAGATTAACATATAAAAACAAAGGAGtt > 2:378309/1‑141 (MQ=255) tGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAat > 1:184722/1‑141 (MQ=255) ggTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAata > 2:132817/1‑141 (MQ=255) ttAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATg > 1:349690/1‑141 (MQ=255) aaaaTACTTAAAGATACTGCTAAAATTTTTCTTAGTGATGTACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCGTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAACACAAAGGAGTTTAATATGaa < 2:490824/141‑1 (MQ=255) aaaTACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAAt < 1:359820/141‑1 (MQ=255) cTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGtt > 2:604128/1‑141 (MQ=255) cTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGACCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGATTAAGtt > 2:265956/1‑141 (MQ=255) aaaGATATTACTAAATTTTTTTTTAGTTATATACTGTTTAGAATTGCATTTATTGTAAATGCCCCCTTGATTTGTTATTTAAACGAATTCAATATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGttttt < 2:710788/141‑1 (MQ=255) aaGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGtttttt < 1:765474/141‑1 (MQ=255) gATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTa > 1:811607/1‑141 (MQ=255) aaTACTAATAAAATCTTTCTTAGTGATATAATGTTTTGAATTGCATTTATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTa < 1:646083/140‑1 (MQ=255) ctactaAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACttt > 2:394808/1‑141 (MQ=255) ctactaAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACttt > 2:824958/1‑141 (MQ=255) actaAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACttttt > 2:352110/1‑141 (MQ=255) actaAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACttttt < 1:83506/141‑1 (MQ=255) taAAATCTTTCTTAGTGATATAATGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGa > 2:612324/1‑141 (MQ=255) tctttcttAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTTTTTTTTTtttatt > 2:659958/1‑141 (MQ=255) ttttttAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGAttatttt < 2:791024/141‑1 (MQ=255) tttcttAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATACGTTTTTTTACTTTTTGAttatttt < 1:611800/141‑1 (MQ=255) tcttAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATCTAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGTtttttttat > 1:155962/1‑141 (MQ=255) tcttAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGAttattttat < 2:186427/141‑1 (MQ=255) ttAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGAttatttttatt > 2:411418/1‑137 (MQ=255) ttAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAAAGCCCCCTTTTTTTGTTCTTTAAATGCATTCAATATAATATTAACAAATAAAAACAAAGGAGTTTAGTATGAATAAGTTTTGTTACTTTTTGATTATTttgtta > 2:211009/1‑141 (MQ=255) tAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTtattat > 1:6038/1‑141 (MQ=255) tAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTtattat > 1:369608/1‑141 (MQ=255) aGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATc > 2:68077/1‑141 (MQ=255) tGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTg < 1:621411/141‑1 (MQ=255) gATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGt > 1:743643/1‑141 (MQ=255) tataCTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTat < 1:455915/141‑1 (MQ=255) taCTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTattt < 1:263174/141‑1 (MQ=255) taCTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTattt < 2:334558/141‑1 (MQ=255) taCTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTattt > 2:110090/1‑141 (MQ=255) tGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAATGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTattttta > 1:170661/1‑141 (MQ=255) ttttGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTatttttaat > 1:679863/1‑141 (MQ=255) gAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATTTTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTatttttaattttt > 1:504664/1‑141 (MQ=255) aaTTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTatttttacttttta > 2:473059/1‑141 (MQ=255) aTTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTatttttaatttttat > 2:626449/1‑140 (MQ=255) aTTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTAtttttaatttttaa > 1:101071/1‑141 (MQ=255) ttGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATttttaatttttaat > 1:494976/1‑141 (MQ=255) tGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTtttaatttttaatt < 1:754972/141‑1 (MQ=255) tGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTtttaatttttaatt > 1:239982/1‑141 (MQ=255) tGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTATTTTACTTTTTGAATATTTAATTATCTGTATTtttattctttaatt > 2:366816/1‑141 (MQ=255) tGCATTCATTGTAAATGCCAGCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTtttaatttttaatt > 1:543900/1‑141 (MQ=255) attcattGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATGGACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTAATTTATTATCTGTATTTTtaatttttaattttt > 1:560021/1‑140 (MQ=255) tcattGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGTATTCATTATGATATTTAGATGTTGAAACAAAGGTGTTTAATATGTTTGTGTTTTTTTACGTTTTGATTATTTTTTTTTTTGTTTTTTTTATTTTTATTTTTGtt > 2:197877/1‑141 (MQ=255) tcattGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTATTTTTTAATTTTGtt > 2:445055/1‑141 (MQ=255) tcattGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGtt > 1:59233/1‑141 (MQ=255) tcattGTAAATGCCCCATTATTTTGTTATTTAAATGAAGTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGtt > 1:467496/1‑141 (MQ=255) cattGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTAATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTGTAATATGAATAAAGTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTATATTTTTAATTCTTCATCTTGTTa > 2:168956/1‑141 (MQ=255) ttGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAAt > 1:203422/1‑141 (MQ=255) gTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTc < 2:456984/141‑1 (MQ=255) aaaTGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGa > 1:660360/1‑141 (MQ=255) aaTGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTCTTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGAt > 2:586823/1‑141 (MQ=255) cccTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGTTTATTTTTTTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTAtt > 2:298793/1‑141 (MQ=255) cccTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTGATTTTGTTAATTCGATTTTAtt > 1:226028/1‑141 (MQ=255) cccTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTAtt < 2:251291/141‑1 (MQ=255) ccTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTAttt > 1:71058/1‑141 (MQ=255) cTTGGTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTg < 1:288798/141‑1 (MQ=255) tgttttgttATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGAt < 1:321253/141‑1 (MQ=255) tgttttgttATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGAt > 1:517016/1‑141 (MQ=255) ttttgttATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTATTTTTGTTAATTCGATTTTTTTTGATaa > 2:56814/1‑141 (MQ=255) ttgttATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATc < 1:728479/141‑1 (MQ=255) ttttATTTAAATTAATTTAATATAATATTATCATATAAATACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTTATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATATTcc < 2:728718/139‑1 (MQ=255) tgttATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATcc > 2:834655/1‑141 (MQ=255) tgttATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATcc > 2:282942/1‑141 (MQ=255) tATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCttt < 1:91924/141‑1 (MQ=255) tttAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATTCTTTTg > 1:442898/1‑141 (MQ=255) aaTGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACtt < 2:536166/141‑1 (MQ=255) tGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACtttt > 2:694438/1‑141 (MQ=255) gAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACttttt < 2:752160/141‑1 (MQ=255) gAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACttttt < 1:302896/141‑1 (MQ=255) gAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACttttt < 1:335494/141‑1 (MQ=255) aaTTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATTAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTa > 2:549942/1‑141 (MQ=255) aTTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAg > 1:799656/1‑141 (MQ=255) ttCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTTATTAACTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTGGATATTTCTTTTGTCTTTTTAGa > 2:742377/1‑141 (MQ=255) cAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTATTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGaaa < 1:785364/141‑1 (MQ=255) ataatatTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGttt < 2:669899/141‑1 (MQ=255) ataatatTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGttt > 1:251661/1‑141 (MQ=255) taatatTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGtttt < 1:700991/141‑1 (MQ=255) ttAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATATGTATTTTTCATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTtttattta > 2:504715/1‑141 (MQ=255) aCATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTtatttatta > 1:280024/1‑140 (MQ=255) aCATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTc > 1:824375/1‑141 (MQ=255) CATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATCAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTACTTCGATTTTATTTGATAATCATTTTGACTTTTTACAAAGTTTTATTTATtct < 1:526604‑M1/141‑2 (MQ=255) | AAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTTTGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCA > NC_012417/2585‑2865 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |