| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | = 4433 | 529 (1.070) | 91 (0.110) +TAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTC |
3/204 | 42.0 | 9.8% | intergenic (+398/‑67) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0006/cadR | hypothetical protein/cadmium binding protein |
| ? | NC_012417 | = 2166 | 1912 (0.990) | coding (509/582 nt) | USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1934 total aligned reads displayed.
GACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGAAACAGTCACCGCTATTTTT > NC_012417/2018‑2314 | gACCCTTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTc < 1:265768/149‑1 (MQ=255)gACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTc > 1:1081424/1‑149 (MQ=255) aCCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAGCGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTcc < 2:947321/149‑1 (MQ=255) aCCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTcc < 2:402171/149‑1 (MQ=255) ccATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCt > 2:710555/1‑149 (MQ=255) cATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCtt < 1:604347/149‑1 (MQ=255) tCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACACGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACAATAGTAACTGCGATTCCAGCCAGGGTTCCttttt > 2:455465/1‑148 (MQ=37) aCAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATcc > 2:804441/1‑149 (MQ=255) ttttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAAtt > 1:145702/1‑149 (MQ=255) tttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAAttt < 1:117154/149‑1 (MQ=255) tGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTa < 1:732092/149‑1 (MQ=255) aTTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTa < 1:521625/149‑1 (MQ=255) tAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTATtttt > 1:283041/1‑149 (MQ=255) aGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCGAATTTTAGCTAAtttttt > 1:457927/1‑149 (MQ=255) aGGGTTCCGAGGCGAAACGTCAATAAAGC‑CTTGTTGTGACATAGTATCCAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACAATGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAAtttttt > 1:820306/1‑149 (MQ=255) ggTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTg < 2:483881/149‑1 (MQ=255) ccGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTAc < 2:160929/149‑1 (MQ=255) gCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AGATAGTTTCTGAATTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTACTTTTTTTGCTAAGCCCt < 2:507531/149‑1 (MQ=255) gCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCt < 1:902678/149‑1 (MQ=255) gCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCt < 1:501618/149‑1 (MQ=255) cAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTa < 2:982186/149‑1 (MQ=255) tCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCCATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGttt > 1:916224/1‑149 (MQ=255) tCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCATATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGttt > 2:568327/1‑149 (MQ=255) aaTAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGttttt > 2:733426/1‑149 (MQ=255) aaGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTTCAGCGTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCt < 1:1042383/149‑1 (MQ=255) aGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCtt > 2:1050928/1‑149 (MQ=255) cAATTGGACT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATTCCACTTTTGGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTa > 2:685558/1‑149 (MQ=255) cAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTa < 1:594273/149‑1 (MQ=255) gTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATTTTCAAAAAct > 2:44224/1‑149 (MQ=255) gTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAAct > 1:836584/1‑149 (MQ=255) tATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAActg > 2:927188/1‑149 (MQ=255) tATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAActg > 2:2390/1‑149 (MQ=255) cTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGTTTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCACCACTGAAGCCGACTGTGATGCGACGCCCTGTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAActgctg > 2:1067021/1‑149 (MQ=255) cTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAActgctg > 2:549168/1‑149 (MQ=255) cTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCC‑TTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCtgt > 1:359860/1‑149 (MQ=255) aaaGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCtgtt > 2:856812/1‑148 (MQ=255) aaGGAACCCGTATTTAAGATTACATTCCACATCCCTCGACACCGGAGGAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGa < 1:206984/149‑1 (MQ=255) aGTAACGCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGTTTTAACATCTTCAAAAACTGCTTTGAt > 2:14532/1‑149 (MQ=255) aGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGAt > 1:79509/1‑149 (MQ=255) aGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGAt < 1:1106146/149‑1 (MQ=255) gTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGAtt < 2:1088211/149‑1 (MQ=255) aaCCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTAt < 2:530627/149‑1 (MQ=255) aCCCGTATTTAAGATTACATTTTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTATTTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATg < 1:1062010/149‑1 (MQ=255) 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ttAAGATTACCTTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGt < 1:226785/149‑1 (MQ=255) ttAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTCTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGt > 2:834616/1‑149 (MQ=255) ttAAGATTACATTGTACATCCTTCAAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCatt > 1:557224/1‑147 (MQ=255) tAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGtt > 1:182611/1‑149 (MQ=255) aaGATTCCATTGTAAATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGATTCCTTTTATCCCAATTTTCGCTAATTTTTTTGCTACGACGTTTACGTTTTTGCCTTTACCATCTTCAACAACTGATGTGCTTGTGTTTCCATTTa > 2:305559/1‑149 (MQ=255) aGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTaa > 2:125186/1‑149 (MQ=255) gATTACTTTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTaaa < 2:667337/149‑1 (MQ=255) gATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTaaa < 2:893820/149‑1 (MQ=255) gATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTaaa < 1:339434/149‑1 (MQ=255) aCATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCTCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTTTTCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGtt > 2:816369/1‑149 (MQ=255) 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aTAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTACAACTTc > 1:385519/1‑149 (MQ=255) gtagCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCGGa > 1:306115/1‑149 (MQ=255) gtagCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGa > 2:607867/1‑149 (MQ=255) tagCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTATTTTTTTTGCTACGCCCTTCAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTAAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTATCCATCTGAGTTTAAAACCTCAGaa > 2:186395/1‑149 (MQ=255) tagCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGaa > 1:323175/1‑149 (MQ=255) tagCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGaa > 1:879380/1‑149 (MQ=255) tagCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGaa > 1:781586/1‑149 (MQ=255) tagCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTGTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAACCTTCAGaa > 2:75377/1‑149 (MQ=255) gCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATa < 2:1109238/149‑1 (MQ=255) gCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATa < 2:90951/149‑1 (MQ=255) cTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAATGTTCTCCATATATGTTTAGAACTTCAGAATAg > 1:168087/1‑149 (MQ=255) cTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTATTGGCTTTAACATCTTCAAAATATGCTGTGATTATGTTTCCAGTTACTAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATaa > 2:624794/1‑148 (MQ=255) gCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGaa < 1:573177/149‑1 (MQ=255) gCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGaa > 2:355548/1‑149 (MQ=255) tgtgcccAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATACaaa > 2:968777/6‑149 (MQ=255) cGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGATTAGaaa > 1:939143/1‑149 (MQ=255) aTTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCACAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAGCATCTTCAACAACTGCTGTGATTTTGTTTCTAGTTAAAGGTTCTCCATCTAAGTTTAAAACTTCAGATTAGAAACa > 1:658935/1‑149 (MQ=255) ccAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGAAACAGTc > 2:257176/1‑149 (MQ=255) cTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGAAACAGTCACCg < 2:220630/149‑1 (MQ=255) tttCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGAGTTTGGCTTTAACATCGTCAAAAACTGCTGTGATTAGGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGAAACAGGCACCGCTAtt > 2:283317/1‑149 (MQ=255) tCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGAAACAGTCACCGCTAtttt < 1:988450/149‑1 (MQ=255) tCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTATTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGAAACAGTCACCGCTAtttt > 1:681267/1‑149 (MQ=255) | GACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT‑AAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGAAACAGTCACCGCTATTTTT > NC_012417/2018‑2314 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |