| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 895785 = | 71 (1.120) | 4 (0.070) | 4/226 | NT | 6.7% | coding (806/822 nt) | metQ_2 | Methionine‑binding lipoprotein MetQ |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 909740 | 50 (0.910) | intergenic (‑663/‑371) | USA300HOU_RS04500/csbD_1 | hypothetical protein/Stress response protein CsbD | |||||
AAGTGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACAAAAAAA > USA300TCH1516_ALE/895645‑895923 | ggttgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaat > 1:618037‑M1/141‑141 (MQ=255)ggttgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaat > 1:706666‑M1/141‑141 (MQ=255) gTGCGAAAGATAATCCTTAAGACAAATCAAATGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTa < 1:329621/141‑1 (MQ=255) ctaaaGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACAGCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTc < 2:506447/139‑1 (MQ=255) cGAAAGATAATCCTTATGCAAACACAATAGCATATAAAGAAGGACATCAAGATGATCAGAAAATCAAAGCATTAATTGAATGATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTc > 2:203186/1‑141 (MQ=255) gAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTcc > 2:453969/1‑141 (MQ=255) ttcgagtgcgaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCt > 2:645024‑M1/134‑141 (MQ=255) ttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattattttgaaaattttataacacccactagttgaatgttttgattgcacttgaacttccttgataatctggctaaTTAttcat < 1:536918‑M1/8‑3 (MQ=255) aaaGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCt > 2:333578/1‑141 (MQ=255) aaGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCGAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTg > 1:741965/1‑141 (MQ=255) aGATAATTCTTATGCAAACTTAATTGCGGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACCATGGTGCAGTTATTCCTGc < 2:611510/141‑1 (MQ=255) aGATAATCCTTATTAAATTTTAATTGCTGTTAAATAAGAAAATAAATATTATAAGATAATCAAATTATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATTGTGCAGTTATTCCTGc < 2:236498/141‑1 (MQ=255) aagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCt > 1:583149‑M1/131‑141 (MQ=255) agggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTa < 2:390841‑M1/12‑1 (MQ=255) agggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTa < 2:131094‑M1/12‑1 (MQ=255) aaTCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAACATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTaaa < 1:535964/141‑1 (MQ=255) atcgtgaTGCAAACGTAAGTGCTGTTAAGGAAGGACATCAAGATCAGAAGAAAATCAAAGCAGTAATCGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAaat < 1:290238/135‑1 (MQ=255) atacatATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGTACAACAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAATACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAaat < 2:485821/136‑1 (MQ=255) aTCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAaat < 2:450256/141‑1 (MQ=255) ttATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAataata < 2:461501/141‑1 (MQ=255) cAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGGAAAATACAATGGTGCAGTTATTTCTGTTAAATAATACCAAt > 1:83202/1‑141 (MQ=255) cTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATtaaa < 1:88361/141‑1 (MQ=255) ttAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATtaaat < 1:102574/141‑1 (MQ=255) ttAATTGATGTTAAATAAGTACATCAATATGATAAGAAAATAAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATtaaat < 2:683208/141‑1 (MQ=255) aaTTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATtaaataa > 2:701317/1‑141 (MQ=255) aTTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATtaaataaa > 1:478141/1‑141 (MQ=255) aTTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATtaaataaa > 2:61964/1‑141 (MQ=255) ttGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATaaaa < 1:734508/141‑1 (MQ=255) gCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAAt > 1:335781/1‑141 (MQ=255) aagaagGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCttt > 1:344713/1‑141 (MQ=255) gaagGACATCAATATGATTAGAAGATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTtaa < 2:422520/141‑1 (MQ=255) aagGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTtaat < 1:529398/141‑1 (MQ=255) agGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTtaata < 1:672874/141‑1 (MQ=255) aaTCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATaacta < 2:768678/140‑3 (MQ=255) aTCAAGATGGTAGGTAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATGAATGAAAAATACAATGCTGCAGTTATCCCTGCTAACTAATACCAATTCAATAAAAATACCCTTTAATaacgac > 2:335368/1‑141 (MQ=255) aTCAAGACGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATATAAAGATATTAAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGCTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACACTTTACTcacaca > 2:288542/1‑139 (MQ=255) tCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTTAATACTTCATTAATGAAAAATACAATGTTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACg < 2:430786/141‑1 (MQ=255) aaGATTATAAGAAAATCAAAGAATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGATAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGAt < 2:691560/141‑1 (MQ=255) atgatAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTaa > 2:249063/1‑141 (MQ=255) aaGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGt < 1:249063/141‑1 (MQ=255) aaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGtt > 1:390841‑M1/79‑141 (MQ=255) aaaTCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTAtt < 2:222803/141‑1 (MQ=255) aaaTCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTAtt < 1:639208/141‑1 (MQ=255) aaaTCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTAtt < 1:524167/141‑1 (MQ=255) aaTCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTAttt < 1:508942/141‑1 (MQ=255) aaGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAACAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTtgtg > 2:238507/1‑141 (MQ=255) aGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTgg < 1:377247/141‑1 (MQ=255) aGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTgg > 1:552299/1‑141 (MQ=255) aTTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGTTTATTTTTGTGGTAt > 2:28041/1‑141 (MQ=255) aTTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGaa < 2:335781/141‑1 (MQ=255) atGAAGTATTACAATGTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATAAAATGGTGCAGTTATTCATGCTAAATAATACAAATTAAATAAAAATACCATTTAATAACAAAGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGaaa < 2:149807/140‑1 (MQ=255) aagaaatACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTGCGTTGTTGTTTGTGTAGTATTGAAAATa < 2:641864/135‑1 (MQ=255) aGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATaa < 1:110387/141‑1 (MQ=255) aGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATaa < 1:308621/141‑1 (MQ=255) aGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATaa > 1:721161/1‑141 (MQ=255) gTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATaaa > 1:310770/1‑141 (MQ=255) ttACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGTGTTATTTTTCTGGTATTGAAATTaaaaaa > 2:115219/1‑141 (MQ=255) cAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATAAAGGGGTTATTTATGTGGTATTGAAAATAAAAAAggg > 2:109870/1‑141 (MQ=255) cAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTGTAATAACAACGAGTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAggg < 2:628974/141‑1 (MQ=255) aaaTATAAACATATTCAAGACTTTATTAATGAAAAATACAGTGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATAACCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTATGTGGTATTGAAAATAAAAAAggg < 2:4029/140‑1 (MQ=255) aTCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGca < 2:629014/141‑1 (MQ=255) taacaatgttttgattgccctttaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGcac > 1:275941‑M1/47‑141 (MQ=255) tCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGcac < 1:61964/141‑1 (MQ=255) cTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAACCTACCTTTTAATATCAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGcaca < 1:497432/141‑1 (MQ=255) tAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACaa < 1:203186/141‑1 (MQ=255) tAAAGAAATTAAAGAATTCATTAATGAAAAATACAATGGTGAAGTTATTCCTACTAAATAATAACAATTAAATAAAAATACCATTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACaa < 2:506320/141‑1 (MQ=255) caattttttgattgcccttgaccttcctttataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAAAAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACaaa > 1:482364‑M1/44‑141 (MQ=255) gATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACTCTTTAATAACAACGATTAAGCGGTCATTTTTCTGGTATTGAAAATAAAAAAGTGCACAAAAgg > 2:754714/1‑141 (MQ=255) gATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAgg < 1:706867/141‑1 (MQ=255) gttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAggg < 2:704859‑M1/102‑1 (MQ=255) cAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGt > 1:760604/1‑141 (MQ=255) aaGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAACGGGGCAGtt > 1:222881/1‑140 (MQ=255) aaGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGta > 2:34786/1‑141 (MQ=255) aaGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGAGCACAACAAGGACAGta > 2:668467/1‑141 (MQ=255) aGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGTTATTGAAACTAAAAAACGGCACAAAAGGGGCAGttt > 2:517272/1‑139 (MQ=255) cTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATg < 1:438931/141‑1 (MQ=255) cTTCAATAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATg < 1:558337/141‑1 (MQ=255) tCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCa > 2:736251/1‑141 (MQ=255) tCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCa > 2:152657/1‑141 (MQ=255) cATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCaa < 1:126933/141‑1 (MQ=255) aaaaagAAAAATAAAAAGGTGCAAGTATAGCTGAAAAATAATACCAATTAAATAAAAATACTATATAAGAAAAATGATTAAGGGGATATTTTTATAGAATAGAAAAAAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAAt < 2:561172/136‑1 (MQ=255) aaTGAAAAATACAAAAGTGAAGTTATACATGCTAAATAATAACAATTAAAAAAAAATACACTTTAATAACAACGATAAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTa < 2:1770/141‑1 (MQ=255) ggTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAAGTAAATAAAAAGACCCTCTAATAACAACGATTAAGGGGTGAGTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACaa < 1:128757/141‑1 (MQ=255) aGTTATTCCTTCTAAATAATACCAAGTAAATAAAAATACCCTTTAATAATAACAATTGAGGAGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAATATCCATTATATGCTGATTATCAAATTTTAAACaaaaaca > 2:461927/1‑139 (MQ=255) aGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAAGAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATGATCGAATTTTAAACaaaaaaa > 1:56133/1‑141 (MQ=255) | AAGTGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACAAAAAAA > USA300TCH1516_ALE/895645‑895923 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |