| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 2830200 | 63 (1.150) | 5 (0.100) | 5/232 | NT | 8.4% | intergenic (+28/+163) | icaC/USA300HOU_2670 | intercellular adhesion protein C/hypothetical protein |
| ? | CP000730 | = 2830235 | 51 (1.010) | intergenic (+63/+128) | icaC/USA300HOU_2670 | intercellular adhesion protein C/hypothetical protein | |||||
TATTCATTTTAGGATTATGTATAGGTGTCGGCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAATTTATTTC > CP000730/2830063‑2830339 | taTTCATTTTAGGATTATGTATAGGTGTCGGCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTggg < 1:341986/141‑1 (MQ=255) tttCATTTTAGGATTATGTATAGGTGTCGGCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGc < 2:473150/140‑1 (MQ=255) ttCATTTTAGGATTATGTATAGGTGTCGGCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCg < 2:161234/141‑1 (MQ=255) tCATTTTAGGATTATGTATAGGTGTCGGCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGa < 1:447227/141‑1 (MQ=255) ttttAGGATTATGTATAGGTGTCGGCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAAt > 2:411363/1‑141 (MQ=255) ttAGGATTATGTATAGGTGTCGGCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCa < 1:454192/141‑1 (MQ=255) ggATTATGTATAGGTGTCGGCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGtt > 1:72707/1‑141 (MQ=255) aTTATGTATAGGTGTCGGCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTg < 1:696825/141‑1 (MQ=255) tATGTATAGGTGTCGGCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGaa < 2:436438/141‑1 (MQ=255) gtCGGCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACtt < 1:655441/141‑1 (MQ=255) gtCGGCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACtt < 1:665348/141‑1 (MQ=255) ggCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGt > 2:284565/1‑141 (MQ=255) gCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGtt > 1:497768/1‑141 (MQ=255) aTGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGtttt > 1:491951/1‑141 (MQ=255) gATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTac > 2:120820‑M2/1‑139 (MQ=255) tGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgt > 1:284565‑M2/1‑134 (MQ=255) gCGTGAATTCTATAGCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAAGTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccaccgcgtg < 2:451954‑M1/141‑44 (MQ=255) cGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgt > 1:484478‑M2/1‑132 (MQ=255) cGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgt < 1:44761‑M2/141‑10 (MQ=255) tGAAGTCTATAACTTTAGGTTGTTTGTTGGAAAACAACGACATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTACTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAATTCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCTCTTGttt > 2:329570/1‑141 (MQ=255) gAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTa < 1:259365/141‑1 (MQ=255) aaTTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTaa < 1:92703/141‑1 (MQ=255) aTTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAat > 1:406340/1‑141 (MQ=255) aTTCTATATCGTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTTAACATGAATTCTTATTAATTATTAAGCGATGTTAAAAACACGCTTGGGGCGAAATCAGTTTTAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAat < 2:565384/141‑1 (MQ=255) tCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAatat > 1:5151/1‑141 (MQ=255) cTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACTCGGTGGGCGAAATCATTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATAtt < 2:617126/141‑1 (MQ=255) tatCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGtt > 1:664066/1‑141 (MQ=255) cTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTtata < 2:594597/141‑1 (MQ=255) ttAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACa > 1:367658/1‑141 (MQ=255) gTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACatata < 1:52597/141‑1 (MQ=255) tttATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTACTGCTTAGTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACatatat > 1:515967/1‑141 (MQ=255) ttattaTTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATAtt > 1:690395/1‑141 (MQ=255) ttattaTTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATAtt > 2:34977/1‑141 (MQ=255) ttattaTTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAACTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATAtt < 2:162666/141‑1 (MQ=255) tattatTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTc < 1:419405/141‑1 (MQ=255) tGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTg > 2:451372/1‑141 (MQ=255) aaaaCAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGcat > 2:244779/1‑140 (MQ=255) aacaacCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAt < 1:323834/141‑1 (MQ=255) acaacCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAtt < 2:675191/141‑1 (MQ=255) acaacCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAtt < 1:283625/141‑1 (MQ=255) caacCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAttt > 2:65087/1‑141 (MQ=255) aacCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccacc < 2:209371‑M1/98‑39 (MQ=255) aacCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccacc > 1:209371‑M1/1‑60 (MQ=255) aacCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTa > 2:515100/1‑141 (MQ=255) aaTTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatt < 1:213364‑M1/80‑30 (MQ=255) aaTTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatt > 2:213364‑M1/1‑51 (MQ=255) aTTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTaa > 1:414522/1‑141 (MQ=255) ttGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTaaa > 1:39336/1‑141 (MQ=255) aaCATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGc > 2:523216/1‑141 (MQ=255) aaCATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGc < 1:1475/141‑1 (MQ=255) aTTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCaa > 2:518194/1‑141 (MQ=255) ttattaattattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATTCATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGTGAGtc > 2:554099/1‑140 (MQ=255) tattaattattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACCTTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTgg > 2:316410/1‑141 (MQ=255) tattaattattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTgg < 2:497768/141‑1 (MQ=255) tattaattattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTgg > 1:675733/1‑141 (MQ=255) ttaattattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGa < 1:659471/141‑1 (MQ=255) aattattaaGCTATGTGAAAAACACGCGGTGGGCAAAATCAGTTTGAATTTACTGACTTCGTTGTACCGCGTGTTTAATATTATTATACATATATTCTAATTGCACATTTAGACTTCGTAAATGCCAATGGCAGTGGGACa > 2:135951/1‑141 (MQ=255) tattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGaa < 2:515967/141‑1 (MQ=255) ttaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAAt < 1:26260/141‑1 (MQ=255) ttaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAAt < 2:399169/141‑1 (MQ=255) aaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGa > 1:623539/1‑141 (MQ=255) aGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGat > 2:612433/1‑141 (MQ=255) cTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGatat > 2:405257/1‑141 (MQ=255) gTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTc > 2:707349/1‑141 (MQ=255) gTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTc < 1:523216/141‑1 (MQ=255) gTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTc > 1:433192/1‑141 (MQ=255) aaaaCACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCaa < 1:363742/141‑1 (MQ=255) aaaCACGCTGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTCCCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCaaa < 1:107282/141‑1 (MQ=255) aaaCACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGtt < 2:58809/44‑1 (MQ=255) aaaCACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGtt > 1:58809/1‑44 (MQ=255) aaaCACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCaaa < 1:368986/141‑1 (MQ=255) aaCACGCGGTGGGTGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCaaaa > 2:307553/1‑141 (MQ=255) aaCACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCaaaa > 2:114150/1‑141 (MQ=255) acacGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttcaatttatatggttgttttccaataataaacctaaagatatagaattcacg < 1:44761‑M1/141‑133 (MQ=255) acacGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttcaatttatatggttgttttccaataataaacctaaagatatagaattcacg > 1:484478‑M1/1‑9 (MQ=255) cacGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttcactttatatggttgttttccaataataaacctaaagctatagaattcacgc < 2:451954‑M2/141‑99 (MQ=255) cacGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAatt < 1:633424/141‑1 (MQ=255) acGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttcaatttatatggttgttttccaataataaacctaaagatatagaattcacgca > 1:284565‑M1/1‑7 (MQ=255) cgcgGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACACTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAattta > 1:689745/1‑141 (MQ=255) gcgGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTTCCGCGGGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAatttat > 1:696018/1‑141 (MQ=255) ggTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttcaatttatatggtt > 1:209371‑M2/1‑38 (MQ=255) ggTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttcaatttatatggtt < 2:209371‑M2/98‑61 (MQ=255) gTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttcaatttatatggttgttttccaataataaacctaaagatatagaattcacgcaatatc > 2:120820‑M1/1‑2 (MQ=255) | TATTCATTTTAGGATTATGTATAGGTGTCGGCATGATATTGCGTGAATTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAATTTATTTC > CP000730/2830063‑2830339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |