| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP000730 | 1,441,102 | (TGTTG)1→2 | coding (127/624 nt) | xpaC → | 5‑bromo‑4‑chloroindolyl phosphate hydrolysis protein XpaC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 1441097 | 0 (0.000) | 36 (1.030) +TGTTG |
16/274 | 0.6 | 100% | coding (122/624 nt) | xpaC | 5‑bromo‑4‑chloroindolyl phosphate hydrolysis protein XpaC |
| ? | CP000730 | 1441098 = | 0 (0.000) | coding (123/624 nt) | xpaC | 5‑bromo‑4‑chloroindolyl phosphate hydrolysis protein XpaC | |||||
AATGCTAAATAAAGGAAGATGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/1440952‑1441097‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTGGTTTGACTAGAAAAGACTATCGCTATATTCGAAATCAGTTAAATCATACACACCAAAAACTTAGAGGTATTTTAAA > CP000730/1441098‑1441241 ||||| AATGCTAAATAAAGGAAGATGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTG > 1:70424/1‑148AATGCTAAATAAAGGAAGATGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTG > 1:290736/1‑148AATGCTAAATAAAGGAAGATGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTG > 1:87049/1‑148 AAGATGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTT < 2:380400/148‑1 AAGATGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTT < 2:289456/148‑1 ATGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAAT < 2:245166/148‑1 ATGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAAT < 2:350660/148‑1 ATGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAAT < 2:220428/148‑1 ATGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAAT < 1:352619/148‑1 TGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATG > 2:190046/1‑148 TGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATG > 1:130322/1‑148 TGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATG > 2:297072/1‑148 TGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATG > 1:200265/1‑148 TATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATAC < 1:345780/148‑1 TATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATAC > 2:83024/1‑148 TATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATAC > 2:307022/1‑148 TATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGGTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATAC > 1:381971/1‑148 ATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTGTTAATTGATATGTCGATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACA > 1:390817/1‑148 CATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACT < 1:369661/148‑1 CATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACT < 2:154649/148‑1 GTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAAT > 1:30396/1‑148 GTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAAT < 1:228647/148‑1 GTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAAT > 1:234488/1‑148 taTAGCATTTTTAACAAGCATATTTGTGATTATTGCACGTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATAAAAAAAAAAAAAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTG < 2:300862/146‑1 TGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTG < 1:205592/148‑1 TGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTG < 1:144507/148‑1 TTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTGGTTTGACT > 1:159233/1‑148 TTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTGGTTTGACT > 1:279907/1‑148 ATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTGGTTTGACTAGAAAAGACTA > 1:107236/1‑148 ATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTGGGCTGTTTAATTACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTGGTTTGACTAGAAAAGACTA > 1:370151/1‑148 TTGCACTTGATGTATCTTTTTTATTTGATTTTTCTATTGGTAGTGGTGTGGTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACTAAATTGGTTTGACTAGAAAAGACTATCTCTATATTCGA > 2:370128/1‑148 TTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTAAATTAACGAAAATATTTAAACGAAATTGGTTTGACTAGAAAAGACTATCGCTATATTCGA > 1:102472/1‑148 TTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGNATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTGGTTTGACTAGAAAAGACTATGGCTATATTCGA > 1:319468/1‑148 GCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTTATTTCTTACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTGGTTTGACTAGAAAAGACTATCGCTATATTCGAAA > 2:33401/1‑148 TTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTGGTTTGACTAGAAAAGACTATCGCTATATTCGAAATCAG > 2:167914/1‑148 CTATTGGTATTGTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACCTCACGCAAATATTTAAACGAAATTGGTTTGACTAGAAAAGACTATCGCTATATTCGAAATCAGTTAAATCATACACACCAAAAACCTAGA > 2:86232/1‑148 tTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATAACTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTGGTTTGACTAGAAAAGACTATCGCTATATTCGAAATCAGTTAAATCATACACACCAAAAACTTAGAGGTATTTTAAA < 2:290736/147‑1 GTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTGGTTTGACTAGAAAAGACTATCGCTATATTCGAAATCAGTTAAATCATACACACCAAAAACTTAGAGGTATTTTAAA < 2:70424/148‑1 GTTGTGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTGGTTTGACTAGAAAAGACTATCGCTATATTCGAAATCAGTTAAATCATACACACCAAAAACTTAGAGGTATTTTAAA < 2:87049/148‑1 ||||| AATGCTAAATAAAGGAAGATGACAGTGAGATATAATATTTCTCATATATTTGGGGTGTTAGTGGGAATTCCTGTAGCGTTTTTAACAAGCATATTTGGGATGATTGCACTTGATGTATCTTTTTTAATTGATATGTCTATTGGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/1440952‑1441097‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTTGGCTTTTTAATGACATACCTACCGATACAAAAACTCACTTCACGCAAATATTTAAACGAAATTGGTTTGACTAGAAAAGACTATCGCTATATTCGAAATCAGTTAAATCATACACACCAAAAACTTAGAGGTATTTTAAA > CP000730/1441098‑1441241 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |