| New junction evidence | |||||||||||
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TTATTATTATATGTATTATATCCAGGTGGAGAAACGACATCACTGATTAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGACAGTTGATGGTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCATTTTTTTATACATATTTTAATCTTAATAATGAAATTCAACCTGAAAACATAAAGATAGGTTATGATATAGAGTGTAGGGAAAATCTTTATGACGTTAAAA > CP000730/1129154‑1129431 | ttattattaTATGTATTATATCCAGGTGGAGAAACGACATCACTGATTAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCgg > 1:993208/1‑141 (MQ=255)ttattattaTATGTATTATATCCAGGTGGAGAAACGACATCACTGATTAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCgg < 1:867045/141‑1 (MQ=255) tattattatATGTATTATATCCAGGTGGAGAAACGACATCACTGATTAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGa < 2:920704/141‑1 (MQ=255) tattattatATGTATTATATCCAGGTGGAGAAACGACATCACTGATTAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGa < 1:662668/141‑1 (MQ=255) 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tCGGACAGTTGATGGTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCATTTTTTTTTTTTTTTTTTAATCTTAATAATGAAATTCAACCTGAAAACATAAAGATAGGTTATGATATAGAGTGTAGGGAAAATCTTTATGACGTTaaaa > 2:1038884/1‑141 (MQ=255) | TTATTATTATATGTATTATATCCAGGTGGAGAAACGACATCACTGATTAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGACAGTTGATGGTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCATTTTTTTATACATATTTTAATCTTAATAATGAAATTCAACCTGAAAACATAAAGATAGGTTATGATATAGAGTGTAGGGAAAATCTTTATGACGTTAAAA > CP000730/1129154‑1129431 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |