Predicted mutation | |||||||
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New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | CP000730 | 353694 = | 89 (1.000) | 5 (0.060) | 5/236 | NT | 5.7% | intergenic (+130/‑23) | USA300HOU_0322/USA300HOU_0323 | hypothetical protein/hypothetical membrane protein |
? | CP000730 | = 353690 | 85 (1.050) | intergenic (+126/‑27) | USA300HOU_0322/USA300HOU_0323 | hypothetical protein/hypothetical membrane protein |
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AAAAAGATTAACATAGGCTTTCTTTAAAACTTTTAACCAGTTTCAAAAAGTAAATGAGCTTTAGCGACAATAATTTTTAAAATAAACACGATATAAATTTAAACATTTATATATAAGAACACAAACGCAAGTTTGTAAATAATAATAATAAAGGAGTAAGACAATGGAAAAATCGATCAAAATAATGACAATAATAGGAATTGTTGTTCAGGGTTTAGCAACGGTATTTAGTTTACTATTGATGGTTTTAGCAGCATCAGGTGTAATGACTACAGA > CP000730/353554‑353829 | aaaaaGATTAACATAGGCTTTCTTTAAAACTTTTAACCAGTTTCAAAAAGTAAATGAGCTTTAGCGACAATAATTTTTAAAATAAACACGATATAAATTTAAACATATATATATAAGAACACAAACGCAAGTTTGTAaata < 1:1007571‑M2/141‑5 (MQ=255) aaaGATTAACATAGGCTTTCTTTAAAACTTTTAACCAGTTTCAAAAAGTAAATGAGCTTTAGCGACAATAATTTTTAAAATAAACACGATATAAATTTAAACATTTATATATAAGAACACAAACGCAAGTTTGTAaataat > 2:263354‑M2/1‑135 (MQ=255) aaaGATTAACATAGGCTTTCTTTAAAACTTTTAAACAGATTAAAAAAGTAAATGAGCTTTAGCGACAATAATTTTTAAAATAAACACGATATAAATTTAAACATTTATATATAAGAACACAAACGCAAGTTTGTAaataat > 2:548259‑M2/1‑135 (MQ=255) aaGATTAACATAGGCTTTCTTTAAAACTTTTAACCAGTTTCAAAAAGTAAATGAGCTTTAGCGACAATAATTTTTAAAATAAACACGATATAAATTTAAACATTTATATATAAGAACACAAACGCAAGTTTGTAaataata > 2:1010434‑M2/1‑134 (MQ=255) 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2:514325/8‑141 (MQ=255) aGTTTGTAAATAATAATAATAAAGGAGTAAGACAATGGAAAAATCGATCAAAATAATGACAATAATAGGAATTGTTGTTCAGGGTTTAGCAACGGTATTTAGTTTACTATTGATGGTTTTAGCAGCATCAGGTGTAATGAc < 1:619408/141‑1 (MQ=255) aGTTTGTAAATAATAATAATAAAGGAGTAAGACAATGGAAAAATCGATCAAAATAATGACAATAATAGGAATTGTTGTTCAGGGTTTAGAAACGGTATTTAGTTTACTATTGATGGTTTTAGCAGCATAAGGTGTAATGaa > 2:583175/1‑140 (MQ=255) tttGTAAATAATAATAATAAAGGAGTAAGACAATGGAAAAATCGATCAAAATAATGACAATAATAGGAATTGTTGTTCAGGGTTTAGCAACGGTATTTAGTTTACTATTGATGGTTTTAGCAGCATCAGGTGTNATGACTa > 2:814909/1‑141 (MQ=255) tttGTAAATAATAATAATAAAGGAGTAAGACAATGGAAAAATCGATCAAAATAATGACAATAATAGGAATTGTTGTTCAGGGTTTAGCAACGGTATTTAGTTTACTATTGATGGTTTTAGCAGCATCAGGTGTAATGACTa > 1:420893/1‑141 (MQ=255) tttGTAAATAATAATAATAAAGGAGTAAGACAATGGAAAAATCGATCAAAATAATGACAATAATAGGAATTGTTGTTCAGGGTTTAGCAACGGTATTTAGTTTACTATTGATGGTTTTAGCAGCATCAGGTGTAATGACTa > 1:724849/1‑141 (MQ=255) tttGTAAATAATAATAATAAAGGAGTAAGACAATGGAAAAATCGATCAAAATAATGACAATAATAGGAATTGTTGTTCAGGGTTTAGCAACGGTATTTAGTTTACTATTGATGGTTTTAGCAGCATCAGGTGTAATGACTa > 1:667731/1‑141 (MQ=255) tttGTAAATAATAATAATAAAGGAGTAAGACAATGGAAAAATCGATCAAAATAATGACAATAATAGGAATTGTTGTTCAGGGTTTAGCAACGGTATTTAGTTTACCATTGATGGTTTTAGCAGCATCAGGTGTAATGACTa > 2:948660/1‑141 (MQ=255) tGTAAATAATAATAATAAAGGAGTAAGACAATGGAAAAATCGATCAAAATAATGACAATAATAGGAATTGTTGTTCAGGGTTTAGCAACGGTATTTAGTTTACTATTGATGGTTTTAGCAGCATCAGGTGTAATGACTACa > 1:1003403/1‑141 (MQ=255) tAAATAATAATAATAAAGGAGTAAGACAATGGAAAAATCGATCAAAATAATGACAATAATAGGAATTGTTGTTCAGGGTTTAGCAACGGTATTTAGTTTACTATTGATGGTTTTAGCAGCATCAGGTGTAATGACTACAGa < 2:246825/141‑1 (MQ=255) tAAATAATAATAATAAAGGAGTAAGACAATGGAAAAATCGATCAAAATAATGACAATAATAGGAATTGTTGTTCAGGGTTTAGCAACGGTATTTAGTTTACTATTGATGGTTTTAGCAGCATCAGGTGTAATGACTACAGa > 2:865553/1‑141 (MQ=255) tAAATAATAATAATAAAGGAGTAAGACAATGGAAAAATCGATCAAAATAATGACAATAATAGGAATTGTTGTTCAGGGTTTAGCAACGGTATTTAGTTTACTATTGATGGTTTTAGCAGCATCAGGTGTAATGACTACAGa < 1:38869/141‑1 (MQ=255) | AAAAAGATTAACATAGGCTTTCTTTAAAACTTTTAACCAGTTTCAAAAAGTAAATGAGCTTTAGCGACAATAATTTTTAAAATAAACACGATATAAATTTAAACATTTATATATAAGAACACAAACGCAAGTTTGTAAATAATAATAATAAAGGAGTAAGACAATGGAAAAATCGATCAAAATAATGACAATAATAGGAATTGTTGTTCAGGGTTTAGCAACGGTATTTAGTTTACTATTGATGGTTTTAGCAGCATCAGGTGTAATGACTACAGA > CP000730/353554‑353829 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |